Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated May 6, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=5377)
1001	380 373 281 182	0.26613
1002	380 365 281 181	0.15901
1003	387 375 277 186	0.17445
1004	393 379 277 183	0.08397
1005	389 371 277 181	0.06835
1006	387 375 293 180	0.04919
1007	380 372 281 182	0.03413
1008	386 373 289 182	0.01283
1009	382 377 277 184	0.01441
1010	384 371 277 186	0.01134
1011	376 365 281 180	0.01971
1012	388 369 289 188	0.01506
1013	392 373 289 186	0.00874
1014	375 373 287 178	0.01097
1015	380 373 291 186	0.00130
1016	382 371 277 178	0.02129
1017	386 373 289 178	0.00251
1018	375 373 287 186	0.00893
1019	380 373 287 185	0.00307
1020	388 369 289 184	0.00298
1021	380 373 289 186	0.00177
1022	380 375 281 181	0.00009
1023	380 379 281 181	0.00009
1024	387 373 281 182	0.00009
1025	380 365 281 186	0.00019
1026	390 369 289 186	0.00344
1027	391 371 277 181	0.00046
1028	376 369 291 186	0.00112
1029	380 365 281 182	0.00167
1030	380 373 293 178	0.00223
1031	382 371 277 186	0.00130
1032	382 377 277 178	0.00009
1033	382 379 277 181	0.00344
1034	382 379 277 182	0.00056
1035	386 373 277 184	0.00009
1036	389 365 289 180	0.00158
1040	380 371 277 186	0.00056
1043	393 381 277 183	0.00149
1045	376 371 277 186	0.00065
1046	376 379 291 180	0.00037
1052	380 372 289 184	0.00037
1053	382 377 277 186	0.00019
1054	382 379 277 184	0.00019
1065	380 371 277 181	0.00019
1069	380 365 281 184	0.00009
1084	376 373 277 184	0.00028
1092	376 379 277 181	0.00019
1093	386 379 277 180	0.00046
1102	389 375 293 180	0.00009
1103	389 375 293 181	0.00019
1105	382 379 277 178	0.00372
1106	395 379 277 178	0.00009
1107	376 375 293 183	0.00019
1109	381 379 291 186	0.00158
1111	387 378 287 182	0.00009
1130	380 373 287 178	0.00009
1134	384 365 291 178	0.00019
1141	380 365 281 180	0.00019
1168	382 379 289 186	0.00019
1169	380 365 277 180	0.00102
1225	387 374 287 186	0.00009
1234	380 371 281 181	0.00019
1265	387 375 277 184	0.00009
1270	376 365 281 181	0.00009
1271	387 375 277 181	0.00019
1279	393 379 277 186	0.00009

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=5377)
2001	343 324 284	0.59829
2002	343 327 280	0.08536
2003	343 324 282	0.10498
2004	351 327 268	0.02994
2005	339 322 280	0.01572
2006	339 325 280	0.03413
2007	351 327 280	0.01748
2008	339 327 276	0.01451
2009	351 324 280	0.00735
2010	345 329 280	0.01134
2011	345 322 284	0.01981
2012	345 322 280	0.00763
2013	345 327 284	0.01051
2014	339 322 284	0.01943
2015	339 327 280	0.00418
2016	339 323 284	0.00325
2017	343 322 280	0.00214
2019	345 324 284	0.00009
2020	349 324 284	0.00019
2021	339 324 268	0.00381
2022	339 327 282	0.00046
2023	341 323 282	0.00223
2024	343 323 280	0.00065
2025	351 321 280	0.00158
2026	351 324 284	0.00102
2028	345 327 288	0.00056
2032	339 323 280	0.00046
2035	341 323 280	0.00009
2037	341 327 280	0.00046
2039	345 327 276	0.00056
2040	345 327 280	0.00009
2048	339 331 282	0.00019
2050	341 327 284	0.00009
2053	343 324 280	0.00009
2064	351 327 284	0.00093
2066	339 324 280	0.00009
2101	341 324 280	0.00019
2115	343 327 284	0.00009

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=5378)
1	AHT121	92	0.01246
		94	0.02213
		96	0.01283
		98	0.31759
		100	0.08684
		102	0.00632
		104	0.19654
		106	0.08209
		108	0.17255
		110	0.06731
		112	0.02306
		114	0.00019
		116	0.00009
2	AHT137	131	0.23052
		133	0.01023
		135	0.00037
		137	0.17640
		139	0.00046
		141	0.36740
		143	0.01293
		145	0.04724
		147	0.05626
		149	0.00223
		151	0.09578
		153	0.00019
3	AHTH130	111	0.01677
		117	0.00245
		119	0.38287
		121	0.13918
		123	0.07878
		125	0.00104
		127	0.13211
		129	0.21655
		131	0.01555
		133	0.01253
		135	0.00217
4	AHTh171-A	217	0.00632
		219	0.37040
		221	0.23224
		223	0.00632
		225	0.14429
		227	0.00920
		229	0.04909
		231	0.02055
		233	0.00112
		235	0.14076
		237	0.01971
5	AHTh260	238	0.57115
		240	0.02939
		242	0.00028
		244	0.05822
		246	0.19057
		248	0.06501
		250	0.03404
		252	0.03683
		254	0.00623
		256	0.00828
6	AHTk211	87	0.18390
		89	0.03914
		91	0.67218
		93	0.00400
		95	0.10060
		97	0.00019
7	AHTk253	280	0.00920
		284	0.12997
		286	0.11343
		288	0.40666
		290	0.21393
		292	0.12607
		296	0.00074
8	C22.279	116	0.07986
		118	0.39968
		120	0.00456
		124	0.35813
		126	0.06833
		128	0.02138
		130	0.06796
		134	0.00009
9	FH2001	124	0.02037
		132	0.42234
		136	0.07152
		140	0.01814
		144	0.24237
		148	0.21150
		152	0.01256
		158	0.00121
10	FH2054	148	0.01014
		152	0.03217
		156	0.54947
		160	0.01757
		164	0.00344
		168	0.29701
		172	0.07802
		176	0.01116
		180	0.00102
11	FH2848	230	0.01581
		232	0.01581
		234	0.01125
		236	0.05311
		238	0.13858
		240	0.68778
		242	0.07710
		244	0.00019
		246	0.00037
12	INRA21	91	0.35552
		93	0.00009
		95	0.40322
		97	0.04695
		99	0.05550
		101	0.11417
		103	0.00762
		105	0.01404
		109	0.00288
13	INU005	110	0.02008
		120	0.00009
		122	0.00056
		124	0.51395
		126	0.44821
		128	0.00186
		130	0.01209
		132	0.00074
		138	0.00242
14	INU030	144	0.31889
		146	0.14931
		148	0.06489
		150	0.08795
		152	0.37774
		154	0.00084
		156	0.00028
		158	0.00009
15	INU055	208	0.00167
		210	0.22025
		212	0.05969
		214	0.29546
		216	0.36770
		218	0.03858
		220	0.01534
		222	0.00130
16	LEI004	85	0.65461
		95	0.10004
		97	0.00483
		105	0.00074
		107	0.20807
		109	0.03170
17	REN105L03	227	0.01051
		231	0.27664
		233	0.19918
		235	0.00725
		237	0.01516
		239	0.01209
		241	0.47889
		243	0.00028
18	REN162C04	200	0.02055
		202	0.17008
		204	0.06677
		206	0.54547
		208	0.09085
		210	0.06500
		212	0.04129
19	REN169D01	202	0.00978
		210	0.00121
		212	0.07091
		214	0.00093
		216	0.40738
		218	0.26006
		220	0.00186
		222	0.05050
		224	0.17471
		226	0.02264
20	REN169O18	156	0.00130
		160	0.03310
		162	0.56844
		164	0.31579
		166	0.01664
		168	0.02371
		170	0.03245
		172	0.00855
21	REN247M23	266	0.03431
		268	0.52548
		270	0.23461
		272	0.19844
		274	0.00251
		278	0.00465
22	REN54P11	222	0.00242
		226	0.26543
		228	0.16763
		230	0.00344
		232	0.33563
		234	0.21104
		236	0.00418
		238	0.00939
		242	0.00084
23	REN64E19	139	0.00242
		143	0.00530
		145	0.42618
		147	0.24693
		149	0.03440
		153	0.25781
		155	0.02696
24	VGL0760	12	0.29570
		13	0.00112
		14	0.01432
		15	0.00837
		18	0.00158
		19	0.08564
		19.2	0.13893
		20	0.03673
		20.2	0.16245
		21	0.00130
		21.2	0.05328
		22.2	0.01637
		23.2	0.10935
		24.2	0.05988
		25.2	0.01451
		26.2	0.00046
25	VGL0910	12	0.00046
		13	0.04779
		14	0.01729
		15	0.01878
		15.1	0.01581
		16	0.00019
		16.1	0.00502
		17.1	0.10589
		18.1	0.27473
		19	0.00009
		19.1	0.13007
		20.1	0.03988
		21.1	0.27910
		22	0.00734
		22.1	0.02222
		23	0.03022
		23.1	0.00390
		24	0.00121
26	VGL1063	8	0.02808
		9	0.00232
		10	0.00009
		11	0.00167
		12	0.03440
		13	0.16158
		14	0.13909
		15	0.08488
		16	0.09901
		17	0.03077
		18	0.04425
		19	0.29872
		20	0.04184
		21	0.02482
		22	0.00679
		23	0.00158
		24	0.00009
27	VGL1165	13	0.00009
		14	0.00009
		15	0.00669
		16	0.04230
		17	0.00335
		18	0.01850
		19	0.00939
		20	0.00084
		21	0.07949
		22	0.00316
		23	0.00270
		24	0.01543
		25	0.11454
		25.3	0.00009
		26	0.47713
		27	0.10924
		28	0.10896
		29	0.00232
		30	0.00428
		31	0.00102
		32	0.00028
		34	0.00009
28	VGL1828	14	0.03756
		15	0.00056
		16	0.04732
		17	0.02231
		18	0.08776
		19	0.42758
		20	0.33646
		21	0.03347
		22	0.00688
		23	0.00009
29	VGL2009	9	0.44998
		10	0.00614
		11	0.03570
		12	0.04760
		13	0.24386
		14	0.18827
		15	0.02826
		16	0.00019
30	VGL2409	13	0.03943
		14	0.26469
		15	0.18731
		16	0.15244
		17	0.19587
		18	0.13644
		19	0.02334
		20	0.00047
31	VGL2918	7	0.00009
		12	0.00521
		13	0.11268
		14	0.20630
		15	0.15880
		16	0.04295
		16.3	0.00149
		17	0.00223
		17.3	0.03226
		18.3	0.02176
		19.3	0.11714
		20.3	0.11872
		21.3	0.14225
		22.3	0.03496
		23.3	0.00316
32	VGL3008	12	0.00009
		13	0.01153
		14	0.03421
		15	0.23457
		16	0.03784
		17	0.50223
		18	0.02520
		18.2	0.00019
		19	0.12849
		20	0.02315
		21	0.00242
		23	0.00009
33	VGL3235	12	0.15350
		13	0.04946
		14	0.15619
		15	0.04611
		16	0.30253
		17	0.22127
		18	0.06982
		19	0.00112

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5378	10.091	3.732	0.680	0.700	0.029
	SE		0.645	0.229	0.017	0.017	0.003

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5378	8.714	2.997	0.584	0.605	0.035
	SE		1.173	0.466	0.057	0.059	0.006

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	5378	13	5.278	0.795	0.811	0.019
2	AHT137	5378	12	4.272	0.753	0.766	0.017
3	AHTH130	5378	11	4.216	0.735	0.763	0.037
4	AHTh171-A	5378	11	4.253	0.756	0.765	0.011
5	AHTh260	5378	10	2.676	0.609	0.626	0.028
6	AHTk211	5378	6	2.011	0.474	0.503	0.057
7	AHTk253	5378	7	3.893	0.736	0.743	0.009
8	C22.279	5378	8	3.288	0.708	0.696	-0.017
9	FH2001	5378	8	3.474	0.693	0.712	0.027
10	FH2054	5378	9	2.514	0.601	0.602	0.002
11	FH2848	5378	9	1.993	0.474	0.498	0.049
12	INRA21	5378	9	3.251	0.670	0.692	0.032
13	INU005	5378	9	2.148	0.512	0.534	0.042
14	INU030	5378	8	3.589	0.692	0.721	0.041
15	INU055	5378	8	3.619	0.711	0.724	0.017
16	LEI004	5378	6	2.071	0.514	0.517	0.006
17	REN105L03	5378	8	2.890	0.622	0.654	0.049
18	REN162C04	5378	7	2.894	0.619	0.654	0.055
19	REN169D01	5378	10	3.672	0.689	0.728	0.054
20	REN169O18	5378	8	2.348	0.548	0.574	0.046
21	REN247M23	5378	6	2.690	0.599	0.628	0.046
22	REN54P11	5378	9	3.908	0.699	0.744	0.061
23	REN64E19	5378	7	3.215	0.666	0.689	0.033
24	VGL0760	5378	16	6.213	0.829	0.839	0.013
25	VGL0910	5378	18	5.325	0.806	0.812	0.008
26	VGL1063	5378	17	6.289	0.817	0.841	0.028
27	VGL1165	5378	22	3.657	0.688	0.727	0.053
28	VGL1828	5378	10	3.236	0.671	0.691	0.030
29	VGL2009	5378	8	3.314	0.663	0.698	0.050
30	VGL2409	5378	8	5.334	0.803	0.813	0.011
31	VGL2918	5378	15	7.510	0.858	0.867	0.010
32	VGL3008	5378	12	3.052	0.661	0.672	0.016
33	VGL3235	5378	8	5.053	0.776	0.802	0.032

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	5378	15	3.455	0.686	0.711	0.034
2	DLA I-4ACA	5378	11	4.813	0.774	0.792	0.024
3	DLA I-4BCT	5378	6	2.570	0.587	0.611	0.038
4	DLA1131	5378	9	4.649	0.758	0.785	0.035
5	5ACA	5378	6	1.558	0.352	0.358	0.016
6	5ACT	5378	8	1.833	0.442	0.454	0.026
7	5BCA	5378	6	2.100	0.486	0.524	0.072

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media