Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Standard Schnauzer

Updated Aug 7, 2020

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Standard Schnauzer (n=0)

DLA2 #	STR types	Standard Schnauzer (n=0)

#	Locus Name	Allele	Standard Schnauzer (n=16)
1	AHT121	94	0.22
		102	0.03
		104	0.16
		106	0.06
		108	0.50
		112	0.03
2	AHT137	131	0.13
		139	0.13
		141	0.41
		147	0.22
		149	0.13
3	AHTH130	117	0.09
		119	0.03
		127	0.25
		129	0.50
		131	0.13
4	AHTh171-A	219	0.06
		225	0.13
		235	0.81
5	AHTh260	238	0.25
		246	0.28
		250	0.44
		252	0.03
6	AHTk211	87	0.47
		89	0.06
		91	0.22
		95	0.25
7	AHTk253	284	0.22
		286	0.25
		288	0.34
		290	0.19
8	C22.279	116	0.03
		118	0.09
		120	0.09
		124	0.78
9	FH2001	132	0.31
		140	0.03
		144	0.66
10	FH2054	148	0.09
		152	0.22
		156	0.50
		160	0.16
		172	0.03
11	FH2848	232	0.06
		238	0.41
		240	0.53
12	INRA21	95	0.34
		97	0.34
		99	0.25
		101	0.03
		103	0.03
13	INU005	110	0.28
		122	0.03
		124	0.03
		126	0.59
		132	0.06
14	INU030	144	0.03
		146	0.09
		148	0.03
		150	0.28
		152	0.13
		154	0.44
15	INU055	208	0.44
		210	0.22
		212	0.19
		218	0.09
		220	0.06
16	LEI004	85	0.78
		95	0.06
		97	0.09
		107	0.06
17	REN105L03	231	0.06
		233	0.56
		235	0.19
		241	0.19
18	REN162C04	200	0.09
		202	0.19
		206	0.50
		208	0.22
19	REN169D01	202	0.03
		212	0.13
		216	0.28
		220	0.56
20	REN169O18	158	0.09
		162	0.50
		164	0.25
		168	0.03
		170	0.13
21	REN247M23	266	0.06
		268	0.69
		270	0.25
22	REN54P11	222	0.03
		226	0.09
		228	0.56
		232	0.09
		234	0.19
		236	0.03
23	REN64E19	139	0.09
		143	0.06
		145	0.44
		147	0.09
		149	0.03
		153	0.28
24	VGL0760	12	0.34
		18.2	0.16
		21.2	0.16
		22.2	0.16
		23.2	0.13
		24.2	0.06
25	VGL0910	15.1	0.13
		16.1	0.09
		17.1	0.19
		18.1	0.28
		19.1	0.25
		20.1	0.03
		21.1	0.03
26	VGL1063	8	0.03
		11	0.03
		12	0.06
		13	0.13
		14	0.22
		15	0.09
		17	0.22
		18	0.06
		19	0.03
		20	0.13
27	VGL1165	19	0.59
		20	0.06
		21	0.06
		26	0.22
		27	0.06
28	VGL1828	14	0.03
		15	0.16
		16	0.22
		19	0.59
29	VGL2009	13	0.59
		14	0.09
		15	0.13
		16	0.19
30	VGL2409	14	0.09
		15	0.19
		16	0.03
		17	0.09
		18	0.50
		19	0.06
		20	0.03
31	VGL2918	12	0.13
		13	0.44
		14	0.25
		15	0.03
		18.3	0.06
		20.3	0.03
		22.3	0.06
32	VGL3008	13	0.03
		16	0.22
		18	0.28
		19	0.28
		20	0.16
		21	0.03
33	VGL3235	13	0.44
		14	0.19
		15	0.28
		16	0.09

		N	Na	Ne	Ho	He	F
Standard Schnauzer	Mean	16	4.939	3.052	0.648	0.635	-0.018
	SE		0.253	0.185	0.028	0.021	0.026

		N	Na	Ne	Ho	He	F
Standard Schnauzer	Mean	16	4.429	2.447	0.661	0.573	-0.154
	SE		0.489	0.207	0.035	0.032	0.016

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	16	6	3.048	0.875	0.672	-0.302
2	AHT137	16	5	3.850	0.563	0.740	0.240
3	AHTH130	16	5	2.960	0.750	0.662	-0.133
4	AHTh171-A	16	3	1.471	0.375	0.320	-0.171
5	AHTh260	16	4	2.994	0.688	0.666	-0.032
6	AHTk211	16	4	2.994	0.625	0.666	0.062
7	AHTk253	16	4	3.793	0.688	0.736	0.066
8	C22.279	16	4	1.590	0.375	0.371	-0.011
9	FH2001	16	3	1.889	0.313	0.471	0.336
10	FH2054	16	5	3.012	0.688	0.668	-0.029
11	FH2848	16	3	2.216	0.688	0.549	-0.253
12	INRA21	16	5	3.325	0.688	0.699	0.017
13	INU005	16	5	2.286	0.438	0.563	0.222
14	INU030	16	6	3.368	0.813	0.703	-0.156
15	INU055	16	5	3.483	0.813	0.713	-0.140
16	LEI004	16	4	1.595	0.375	0.373	-0.005
17	REN105L03	16	4	2.560	0.750	0.609	-0.231
18	REN162C04	16	4	2.926	0.563	0.658	0.145
19	REN169D01	16	4	2.427	0.500	0.588	0.150
20	REN169O18	16	5	2.960	0.688	0.662	-0.038
21	REN247M23	16	3	1.855	0.375	0.461	0.186
22	REN54P11	16	6	2.695	0.625	0.629	0.006
23	REN64E19	16	6	3.413	0.750	0.707	-0.061
24	VGL0760	16	6	4.741	0.688	0.789	0.129
25	VGL0910	16	7	4.923	0.875	0.797	-0.098
26	VGL1063	16	10	6.827	0.938	0.854	-0.098
27	VGL1165	16	5	2.427	0.625	0.588	-0.063
28	VGL1828	16	4	2.349	0.688	0.574	-0.197
29	VGL2009	16	4	2.427	0.500	0.588	0.150
30	VGL2409	16	7	3.241	0.688	0.691	0.006
31	VGL2918	16	7	3.580	0.875	0.721	-0.214
32	VGL3008	16	6	4.303	0.750	0.768	0.023
33	VGL3235	16	4	3.180	0.750	0.686	-0.094

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	16	7	3.556	0.813	0.719	-0.130
2	DLA I-4ACA	16	5	2.860	0.750	0.650	-0.153
3	DLA I-4BCT	16	3	2.473	0.688	0.596	-0.154
4	DLA1131	16	4	2.081	0.625	0.520	-0.203
5	5ACA	16	3	2.040	0.625	0.510	-0.226
6	5ACT	16	5	2.286	0.625	0.563	-0.111
7	5BCA	16	4	1.835	0.500	0.455	-0.099