Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Weimaraner

Updated Aug 7, 2020

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Weimaraner (n=0)

DLA2 #	STR types	Weimaraner (n=0)

#	Locus Name	Allele	Weimaraner (n=19)
1	AHT121	94	0.38
		98	0.15
		102	0.18
		106	0.12
		108	0.09
		112	0.06
		114	0.03
2	AHT137	133	0.03
		145	0.29
		147	0.47
		151	0.21
3	AHTH130	117	0.06
		123	0.18
		129	0.21
		133	0.56
4	AHTh171-A	219	0.59
		223	0.18
		225	0.03
		233	0.21
5	AHTh260	246	0.79
		248	0.18
		252	0.03
6	AHTk211	87	0.03
		89	0.32
		91	0.65
7	AHTk253	286	0.32
		288	0.65
		290	0.03
8	C22.279	116	0.15
		118	0.24
		124	0.21
		126	0.06
		130	0.35
9	FH2001	128	0.06
		132	0.38
		136	0.06
		140	0.03
		144	0.03
		148	0.38
		152	0.06
10	FH2054	148	0.09
		152	0.12
		156	0.03
		164	0.15
		168	0.32
		172	0.29
11	FH2848	230	0.08
		234	0.03
		236	0.03
		238	0.39
		240	0.26
		242	0.21
12	INRA21	95	0.26
		97	0.03
		101	0.71
13	INU005	124	0.24
		126	0.12
		128	0.50
		132	0.15
14	INU030	144	0.24
		150	0.50
		152	0.26
15	INU055	210	0.18
		212	0.03
		214	0.03
		216	0.68
		218	0.09
16	LEI004	85	0.56
		95	0.15
		97	0.03
		101	0.09
		107	0.18
17	REN105L03	231	0.58
		235	0.13
		237	0.21
		245	0.08
18	REN162C04	200	0.09
		202	0.32
		206	0.59
19	REN169D01	210	0.45
		212	0.08
		216	0.16
		218	0.03
		220	0.29
20	REN169O18	160	0.08
		162	0.24
		164	0.53
		166	0.05
		168	0.11
21	REN247M23	268	0.58
21	REN247M23	270	0.42
22	REN54P11	222	0.03
		228	0.03
		232	0.35
		234	0.15
		236	0.44
23	REN64E19	145	0.03
		147	0.71
		149	0.21
		153	0.06
24	VGL0760	13	0.29
		18.2	0.03
		19.2	0.15
		20.2	0.47
		21.2	0.03
		23.2	0.03
25	VGL0910	17.1	0.03
		18.1	0.03
		19.1	0.18
		20.1	0.76
26	VGL1063	13	0.12
		14	0.24
		15	0.09
		16	0.06
		18	0.41
		19	0.09
27	VGL1165	15	0.03
		16	0.06
		18	0.03
		19	0.21
		20	0.03
		21	0.21
		22	0.12
		26	0.09
		28	0.03
		29	0.18
		30	0.03
28	VGL1828	16	0.15
		18	0.03
		20	0.03
		21	0.38
		22	0.21
		26	0.03
		27	0.18
29	VGL2009	13	0.65
		14	0.32
		15	0.03
30	VGL2409	13	0.18
		15	0.21
		16	0.06
		17	0.09
		18	0.47
31	VGL2918	13	0.12
		18.3	0.15
		19.3	0.06
		21.3	0.18
		22.3	0.50
32	VGL3008	14	0.41
		15	0.03
		16	0.03
		17	0.29
		19	0.06
		20	0.18
33	VGL3235	13	0.35
		14	0.26
		15	0.03
		16	0.21
		19	0.15

		N	Na	Ne	Ho	He	F
Weimaraner	Mean	19	4.788	2.945	0.587	0.620	0.055
	SE		0.296	0.186	0.028	0.022	0.035

		N	Na	Ne	Ho	He	F
Weimaraner	Mean	19	4.143	2.317	0.513	0.554	0.080
	SE		0.374	0.143	0.037	0.033	0.028

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	19	7	4.446	0.706	0.775	0.089
2	AHT137	19	4	2.831	0.474	0.647	0.268
3	AHTH130	19	4	2.569	0.765	0.611	-0.252
4	AHTh171-A	19	4	2.379	0.529	0.580	0.087
5	AHTh260	19	3	1.509	0.412	0.337	-0.221
6	AHTk211	19	3	1.908	0.353	0.476	0.258
7	AHTk253	19	3	1.908	0.647	0.476	-0.360
8	C22.279	19	5	4.042	0.765	0.753	-0.016
9	FH2001	19	7	3.284	0.765	0.696	-0.100
10	FH2054	19	6	4.250	0.824	0.765	-0.077
11	FH2848	19	6	3.610	0.737	0.723	-0.019
12	INRA21	19	3	1.757	0.118	0.431	0.727
13	INU005	19	4	2.934	0.471	0.659	0.286
14	INU030	19	3	2.664	0.529	0.625	0.152
15	INU055	19	5	2.007	0.471	0.502	0.062
16	LEI004	19	5	2.676	0.588	0.626	0.061
17	REN105L03	19	4	2.481	0.421	0.597	0.295
18	REN162C04	19	3	2.181	0.529	0.542	0.022
19	REN169D01	19	5	3.167	0.632	0.684	0.077
20	REN169O18	19	5	2.831	0.632	0.647	0.024
21	REN247M23	19	2	1.951	0.421	0.488	0.136
22	REN54P11	19	5	2.919	0.706	0.657	-0.074
23	REN64E19	19	4	1.835	0.471	0.455	-0.034
24	VGL0760	19	6	3.010	0.706	0.668	-0.057
25	VGL0910	19	4	1.619	0.294	0.382	0.231
26	VGL1063	19	6	3.879	0.647	0.742	0.128
27	VGL1165	19	11	6.881	0.824	0.855	0.036
28	VGL1828	19	7	4.099	0.706	0.756	0.066
29	VGL2009	19	3	1.908	0.588	0.476	-0.236
30	VGL2409	19	5	3.266	0.529	0.694	0.237
31	VGL2918	19	5	3.124	0.765	0.680	-0.125
32	VGL3008	19	6	3.420	0.588	0.708	0.169
33	VGL3235	19	5	3.853	0.765	0.740	-0.033

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	19	4	2.359	0.529	0.576	0.081
2	DLA I-4ACA	19	4	2.470	0.588	0.595	0.012
3	DLA I-4BCT	19	3	2.072	0.471	0.517	0.090
4	DLA1131	19	6	2.861	0.529	0.651	0.186
5	5ACA	19	5	1.558	0.294	0.358	0.179
6	5ACT	19	4	2.513	0.588	0.602	0.023
7	5BCA	19	3	2.388	0.588	0.581	-0.012