Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Golden Retriever

Updated Sep 28, 2020

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Golden Retriever (n=738)
1002	380 365 281 181	0.0007
1003	387 375 277 186	0.1396
1006	387 375 293 180	0.0136
1008	386 373 289 182	0.0014
1011	376 365 281 180	0.0007
1012	388 369 289 188	0.0014
1014	375 373 287 178	0.0400
1016	382 371 277 178	0.0020
1030	380 373 293 178	0.0007
1040	380 371 277 186	0.0007
1050	380 371 289 182	0.0007
1059	390 371 291 182	0.0007
1062	382 371 277 183	0.0888
1065	380 371 277 181	0.2629
1066	376 375 277 178	0.2866
1067	376 373 277 178	0.0488
1068	380 373 287 181	0.0515
1069	380 365 281 184	0.0386
1070	380 375 291 178	0.0149
1071	380 373 277 178	0.0007
1121	380 371 277 183	0.0007
1128	384 376 287 182	0.0007
1129	382 371 277 181	0.0007
1134	384 365 291 178	0.0007
1137	383 371 281 184	0.0014
1144	390 369 289 182	0.0007
1145	392 373 281 186	0.0007

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Golden Retriever (n=738)
2001	343 324 284	0.1402
2003	343 324 282	0.0224
2005	339 322 280	0.0156
2007	351 327 280	0.0136
2012	345 322 280	0.0007
2017	343 322 280	0.0407
2021	339 324 268	0.0888
2022	339 327 282	0.0007
2023	341 323 282	0.0007
2029	337 324 268	0.0007
2045	339 325 284	0.0393
2046	339 329 280	0.2751
2047	339 331 280	0.0108
2048	339 331 282	0.2602
2049	339 331 284	0.0014
2050	341 327 284	0.0400
2051	343 331 282	0.0115
2052	345 321 280	0.0020
2053	343 324 280	0.0305
2059	343 324 276	0.0007
2079	343 323 278	0.0007
2085	345 325 280	0.0014
2086	339 329 284	0.0014
2088	339 329 268	0.0014

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Golden Retriever (n=740)
1	AHT121	90	0.0007
		96	0.2878
		98	0.0514
		100	0.0041
		102	0.4365
		104	0.0155
		106	0.1757
		108	0.0142
		110	0.0135
		112	0.0007
2	AHT137	131	0.1604
		133	0.1258
		135	0.0007
		137	0.1509
		141	0.0007
		143	0.0968
		145	0.0237
		147	0.0974
		149	0.1861
		151	0.1130
		153	0.0440
		155	0.0007
3	AHTH130	111	0.0007
		117	0.0365
		119	0.0014
		121	0.3478
		123	0.0014
		125	0.3126
		127	0.0027
		129	0.2950
		131	0.0020
4	AHTh171-A	219	0.6022
		221	0.0007
		223	0.0257
		225	0.1962
		227	0.1441
		229	0.0007
		233	0.0020
		235	0.0014
		237	0.0271
5	AHTh260	236	0.0007
		238	0.0047
		240	0.0189
		242	0.1204
		244	0.5595
		246	0.1949
		248	0.0805
		250	0.0034
		252	0.0027
		254	0.0142
6	AHTk211	87	0.0020
		89	0.0805
		91	0.1130
		93	0.6658
		95	0.0332
		97	0.1055
7	AHTk253	284	0.0034
		286	0.3593
		288	0.2788
		290	0.0081
		292	0.3505
8	C22.279	110	0.0007
		116	0.2243
		118	0.5230
		120	0.0682
		124	0.0446
		126	0.1392
9	FH2001	124	0.0905
		132	0.2007
		136	0.0324
		140	0.0446
		144	0.3601
		148	0.1655
		152	0.0892
		156	0.0155
		158	0.0007
		160	0.0007
10	FH2054	148	0.1658
		152	0.0149
		156	0.3424
		160	0.0494
		164	0.0217
		168	0.2449
		172	0.1394
		176	0.0210
		180	0.0007
11	FH2848	232	0.0710
		234	0.0419
		236	0.0257
		238	0.4520
		240	0.4080
		242	0.0007
		244	0.0007
12	INRA21	91	0.2212
		95	0.0961
		97	0.0095
		99	0.0670
		101	0.2821
		103	0.3221
		105	0.0020
13	INU005	110	0.1196
		122	0.0007
		124	0.2257
		126	0.5169
		128	0.1318
		132	0.0054
14	INU030	144	0.3985
		150	0.5176
		152	0.0839
15	INU055	210	0.1520
		212	0.0007
		214	0.4459
		216	0.2764
		218	0.1250
16	LEI004	85	0.0791
		93	0.0007
		95	0.3176
		97	0.1054
		105	0.0014
		107	0.4932
		109	0.0014
		111	0.0014
17	REN105L03	227	0.0020
		231	0.0798
		233	0.5636
		235	0.2064
		237	0.0081
		239	0.0487
		241	0.0913
18	REN162C04	202	0.0947
		204	0.3721
		206	0.2889
		208	0.2436
		212	0.0007
19	REN169D01	202	0.3451
		210	0.0014
		212	0.1428
		216	0.3897
		218	0.0907
		220	0.0304
20	REN169O18	160	0.0007
		162	0.2984
		164	0.4114
		166	0.0014
		168	0.0920
		170	0.1874
		172	0.0081
		174	0.0007
21	REN247M23	264	0.0014
		268	0.3802
		270	0.0020
		272	0.3931
		276	0.0014
		278	0.2219
22	REN54P11	222	0.0467
		226	0.0474
		228	0.0196
		230	0.0007
		232	0.2997
		234	0.4581
		236	0.1042
		238	0.0237
23	REN64E19	139	0.0345
		143	0.0068
		145	0.2959
		147	0.3446
		149	0.1831
		153	0.1345
		155	0.0007
24	VGL0760	12	0.0020
		13	0.0020
		14	0.0014
		18.2	0.0047
		19.2	0.1637
		20.2	0.1631
		21.2	0.3309
		22.2	0.0900
		23.2	0.2152
		24.2	0.0230
		25.2	0.0041
25	VGL0910	14	0.0115
		15	0.0122
		15.1	0.0237
		16	0.0047
		16.1	0.0034
		17.1	0.0440
		18.1	0.4479
		19	0.0047
		19.1	0.3031
		20	0.0047
		20.1	0.0372
		21	0.0007
		21.1	0.0751
		22.1	0.0264
		23.1	0.0007
26	VGL1063	8	0.0074
		9	0.0014
		12	0.0291
		13	0.6089
		14	0.0426
		15	0.0014
		17	0.0014
		18	0.2395
		19	0.0602
		20	0.0081
27	VGL1165	14	0.0014
		15	0.0007
		16	0.0934
		17	0.2321
		18	0.0081
		19	0.1326
		20	0.0014
		21	0.0359
		26	0.0020
		27	0.0995
		28	0.3234
		29	0.0156
		30	0.0514
		31	0.0027
28	VGL1828	14	0.1245
		15	0.0995
		16	0.0318
		17	0.0007
		18	0.0014
		19	0.3978
		20	0.1191
		21	0.0101
		22	0.2124
		23	0.0027
29	VGL2009	9	0.0007
		10	0.0041
		11	0.0074
		12	0.1549
		13	0.2097
		14	0.1840
		15	0.3816
		16	0.0568
		17	0.0007
30	VGL2409	13	0.0020
		14	0.1734
		15	0.0894
		16	0.3604
		17	0.3340
		18	0.0230
		19	0.0163
		20	0.0014
31	VGL2918	11	0.0007
		12	0.2733
		13	0.1157
		14	0.0061
		17.3	0.0176
		18.3	0.0095
		19.3	0.5223
		20.3	0.0514
		21.3	0.0020
		22.3	0.0014
32	VGL3008	13	0.0027
		14	0.4201
		15	0.0034
		16	0.0007
		17	0.0027
		18	0.0346
		19	0.2405
		20	0.0556
		21	0.0644
		22	0.0522
		23	0.0745
		24	0.0447
		25	0.0041
33	VGL3235	11	0.0007
		12	0.4214
		13	0.0054
		14	0.0644
		15	0.4140
		16	0.0373
		17	0.0285
		18	0.0285

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

		N	Na	Ne	Ho	He	F
Golden Retriever	Mean	740	8.394	3.421	0.652	0.687	0.052
	SE		0.463	0.178	0.014	0.013	0.006

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

		N	Na	Ne	Ho	He	F
Golden Retriever	Mean	740	7.286	2.932	0.597	0.612	0.023
	SE		0.661	0.339	0.057	0.059	0.007

Standard genetic assessment for individual STR loci

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	740	10	3.252	0.643	0.692	0.071
2	AHT137	740	12	7.516	0.839	0.867	0.032
3	AHTH130	740	9	3.257	0.654	0.693	0.057
4	AHTh171-A	740	9	2.363	0.540	0.577	0.064
5	AHTh260	740	10	2.684	0.537	0.627	0.144
6	AHTk211	740	6	2.106	0.521	0.525	0.008
7	AHTk253	740	5	3.033	0.650	0.670	0.031
8	C22.279	740	6	2.858	0.586	0.650	0.098
9	FH2001	740	10	4.612	0.739	0.783	0.056
10	FH2054	740	9	4.392	0.755	0.772	0.022
11	FH2848	740	7	2.644	0.552	0.622	0.112
12	INRA21	740	7	4.064	0.760	0.754	-0.009
13	INU005	740	6	2.859	0.635	0.650	0.023
14	INU030	740	3	2.305	0.536	0.566	0.054
15	INU055	740	5	3.185	0.664	0.686	0.033
16	LEI004	740	8	2.766	0.612	0.638	0.041
17	REN105L03	740	7	2.650	0.568	0.623	0.087
18	REN162C04	740	5	3.445	0.652	0.710	0.081
19	REN169D01	740	6	3.328	0.647	0.700	0.075
20	REN169O18	740	8	3.312	0.723	0.698	-0.035
21	REN247M23	740	6	2.871	0.612	0.652	0.061
22	REN54P11	740	8	3.166	0.635	0.684	0.072
23	REN64E19	740	7	3.858	0.688	0.741	0.072
24	VGL0760	740	11	4.591	0.754	0.782	0.036
25	VGL0910	740	15	3.300	0.654	0.697	0.062
26	VGL1063	740	10	2.301	0.551	0.565	0.026
27	VGL1165	740	14	5.028	0.758	0.801	0.054
28	VGL1828	740	10	4.097	0.719	0.756	0.049
29	VGL2009	740	9	3.987	0.727	0.749	0.030
30	VGL2409	740	8	3.567	0.690	0.720	0.042
31	VGL2918	740	10	2.747	0.629	0.636	0.011
32	VGL3008	740	13	3.952	0.703	0.747	0.059
33	VGL3235	740	8	2.808	0.589	0.644	0.085

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	740	11	3.511	0.700	0.715	0.022
2	DLA I-4ACA	740	6	2.802	0.636	0.643	0.011
3	DLA I-4BCT	740	6	1.426	0.303	0.299	-0.014
4	DLA1131	740	8	3.513	0.685	0.715	0.043
5	5ACA	740	6	1.835	0.438	0.455	0.038
6	5ACT	740	8	4.069	0.728	0.754	0.035
7	5BCA	740	6	3.365	0.687	0.703	0.023

Veterinary Genetics Laboratory

Vet Med Links +

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Golden Retriever

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Golden Retriever

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media