Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Greater Swiss Mountain Dog

Updated Jul 24, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

#	Locus Name	Allele	Greater Swiss Mountain Dog (n=71)
1	AHT121	92	0.028
		96	0.063
		100	0.070
		102	0.408
		104	0.007
		108	0.415
		114	0.007
2	AHT137	131	0.028
		135	0.014
		137	0.599
		149	0.035
		151	0.296
		153	0.028
3	AHTH130	117	0.415
		125	0.148
		129	0.380
		131	0.007
		139	0.049
4	AHTh171-A	219	0.232
		225	0.415
		229	0.042
		235	0.310
5	AHTh260	238	0.176
		244	0.063
		246	0.662
		250	0.063
		252	0.007
		254	0.028
6	AHTk211	87	0.542
		89	0.246
		91	0.211
7	AHTk253	286	0.542
		288	0.331
		292	0.127
8	C22.279	116	0.782
		118	0.127
		120	0.092
9	FH2001	132	0.803
		140	0.007
		148	0.176
		152	0.014
10	FH2054	148	0.042
		152	0.852
		156	0.077
		164	0.028
11	FH2848	230	0.127
		232	0.254
		238	0.021
		240	0.585
		242	0.014
12	INRA21	95	0.190
12	INRA21	101	0.810
13	INU005	124	0.155
		126	0.831
		128	0.014
14	INU030	144	0.275
		150	0.514
		156	0.211
15	INU055	210	1.000
16	LEI004	85	0.599
		95	0.303
		97	0.077
		107	0.021
17	REN105L03	233	0.366
		237	0.204
		241	0.430
18	REN162C04	202	0.014
		204	0.014
		206	0.972
19	REN169D01	216	0.852
19	REN169D01	220	0.148
20	REN169O18	164	0.085
		166	0.007
		168	0.718
		170	0.190
21	REN247M23	268	0.620
21	REN247M23	274	0.380
22	REN54P11	222	0.035
		226	0.901
		234	0.063
23	REN64E19	147	0.106
		149	0.761
		153	0.134
24	VGL0760	12	0.099
		13	0.134
		19.2	0.007
		20.2	0.401
		22.2	0.007
		23.2	0.352
25	VGL0910	12	0.007
		16.1	0.007
		17.1	0.007
		18.1	0.761
		19.1	0.028
		20.1	0.155
		21.1	0.035
26	VGL1063	13	0.014
		14	0.775
		15	0.035
		18	0.063
		19	0.092
		20	0.021
27	VGL1165	19	0.430
		20	0.007
		23	0.035
		26	0.028
		27	0.007
		28	0.408
		29	0.085
28	VGL1828	14	0.049
		16	0.021
		18	0.007
		20	0.148
		21	0.408
		22	0.359
		23	0.007
29	VGL2009	9	0.155
		13	0.493
		14	0.324
		15	0.028
30	VGL2409	13	0.014
		15	0.239
		16	0.092
		17	0.141
		18	0.493
		19	0.014
		20	0.007
31	VGL2918	12	0.007
		13	0.437
		14	0.218
		16.3	0.007
		17.3	0.331
32	VGL3008	13	0.056
		17	0.056
		18	0.169
		19	0.380
		20	0.232
		21	0.106
33	VGL3235	13	0.113
		14	0.754
		15	0.014
		16	0.056
		17	0.007
		18	0.056

Greater Swiss Mountain Dog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	71	4.364	2.181	0.481	0.481	0.013
	SE		0.299	0.129	0.034	0.033	0.023

Greater Swiss Mountain Dog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	71	2.286	1.148	0.137	0.127	-0.070
	SE		0.171	0.019	0.017	0.016	0.009

Greater Swiss Mountain Dog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	71	7	2.863	0.690	0.651	-0.061
2	AHT137	71	6	2.228	0.549	0.551	0.003
3	AHTH130	71	5	2.927	0.563	0.658	0.144
4	AHTh171-A	71	4	3.082	0.690	0.676	-0.022
5	AHTh260	71	6	2.092	0.493	0.522	0.055
6	AHTk211	71	3	2.504	0.620	0.601	-0.032
7	AHTk253	71	3	2.383	0.577	0.580	0.005
8	C22.279	71	3	1.574	0.423	0.365	-0.159
9	FH2001	71	4	1.480	0.282	0.324	0.131
10	FH2054	71	4	1.361	0.239	0.265	0.098
11	FH2848	71	5	2.366	0.620	0.577	-0.073
12	INRA21	71	2	1.445	0.352	0.308	-0.143
13	INU005	71	3	1.399	0.324	0.285	-0.136
14	INU030	71	3	2.602	0.648	0.616	-0.052
15	INU055	71	1	1.000	0.000	0.000	0.000
16	LEI004	71	4	2.191	0.549	0.544	-0.011
17	REN105L03	71	3	2.775	0.704	0.640	-0.101
18	REN162C04	71	3	1.058	0.028	0.055	0.489
19	REN169D01	71	2	1.337	0.211	0.252	0.162
20	REN169O18	71	4	1.788	0.493	0.441	-0.119
21	REN247M23	71	2	1.892	0.507	0.471	-0.076
22	REN54P11	71	3	1.223	0.155	0.182	0.150
23	REN64E19	71	3	1.646	0.394	0.392	-0.005
24	VGL0760	71	6	3.197	0.732	0.687	-0.066
25	VGL0910	71	7	1.654	0.437	0.395	-0.104
26	VGL1063	71	6	1.628	0.380	0.386	0.014
27	VGL1165	71	7	2.773	0.577	0.639	0.097
28	VGL1828	71	7	3.118	0.620	0.679	0.088
29	VGL2009	71	4	2.683	0.606	0.627	0.034
30	VGL2409	71	7	3.039	0.718	0.671	-0.071
31	VGL2918	71	5	2.874	0.479	0.652	0.266
32	VGL3008	71	6	4.087	0.746	0.755	0.012
33	VGL3235	71	6	1.703	0.451	0.413	-0.092

Greater Swiss Mountain Dog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	71	3	1.186	0.169	0.157	-0.078
2	DLA I-4ACA	71	2	1.151	0.141	0.131	-0.076
3	DLA I-4BCT	71	2	1.151	0.141	0.131	-0.076
4	DLA1131	71	3	1.186	0.169	0.157	-0.078
5	5ACA	71	2	1.151	0.141	0.131	-0.076
6	5ACT	71	2	1.029	0.028	0.028	-0.014
7	5BCA	71	2	1.183	0.169	0.155	-0.092