Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Greater Swiss Mountain Dog

Updated Oct 1, 2025

DLA Class I Haplotype Frequencies

#	Locus Name	Allele	Greater Swiss Mountain Dog (n=97)
1	AHT121	92	0.041
		96	0.062
		100	0.077
		102	0.361
		104	0.005
		108	0.448
		114	0.005
2	AHT137	131	0.021
		135	0.021
		137	0.619
		149	0.026
		151	0.289
		153	0.026
3	AHTH130	117	0.397
		125	0.191
		129	0.335
		131	0.036
		139	0.041
4	AHTh171-A	219	0.278
		225	0.392
		229	0.046
		235	0.284
5	AHTh260	238	0.149
		244	0.057
		246	0.716
		248	0.005
		250	0.046
		252	0.005
		254	0.021
6	AHTk211	87	0.552
		89	0.263
		91	0.186
7	AHTk253	286	0.510
		288	0.387
		292	0.103
8	C22.279	116	0.835
		118	0.098
		120	0.067
9	FH2001	132	0.778
		140	0.005
		148	0.186
		152	0.031
10	FH2054	148	0.041
		152	0.799
		156	0.124
		164	0.036
11	FH2848	230	0.119
		232	0.263
		238	0.026
		240	0.582
		242	0.010
12	INRA21	95	0.227
12	INRA21	101	0.773
13	INU005	124	0.165
		126	0.825
		128	0.010
14	INU030	144	0.247
		150	0.546
		156	0.206
15	INU055	210	1.000
16	LEI004	85	0.562
		95	0.325
		97	0.093
		107	0.021
17	REN105L03	233	0.381
		237	0.196
		241	0.423
18	REN162C04	202	0.031
		204	0.015
		206	0.954
19	REN169D01	216	0.881
19	REN169D01	220	0.119
20	REN169O18	164	0.108
		166	0.005
		168	0.686
		170	0.201
21	REN247M23	268	0.588
21	REN247M23	274	0.412
22	REN54P11	222	0.041
		226	0.892
		234	0.067
23	REN64E19	147	0.108
		149	0.768
		153	0.124
24	VGL0760	12	0.108
		13	0.134
		19.2	0.005
		20.2	0.423
		22.2	0.021
		23.2	0.309
25	VGL0910	12	0.036
		16.1	0.015
		17.1	0.021
		18.1	0.737
		19.1	0.021
		20.1	0.144
		21.1	0.026
26	VGL1063	13	0.010
		14	0.784
		15	0.026
		18	0.052
		19	0.098
		20	0.031
27	VGL1165	19	0.469
		20	0.005
		23	0.036
		26	0.026
		27	0.021
		28	0.361
		29	0.082
28	VGL1828	14	0.067
		16	0.015
		18	0.005
		20	0.144
		21	0.438
		22	0.325
		23	0.005
29	VGL2009	9	0.144
		13	0.572
		14	0.253
		15	0.031
30	VGL2409	13	0.010
		15	0.222
		16	0.093
		17	0.160
		18	0.505
		19	0.005
		20	0.005
31	VGL2918	12	0.005
		13	0.428
		14	0.191
		16.3	0.005
		17.3	0.371
32	VGL3008	13	0.062
		14	0.005
		17	0.057
		18	0.144
		19	0.340
		20	0.258
		21	0.134
33	VGL3235	13	0.103
		14	0.722
		15	0.010
		16	0.119
		17	0.005
		18	0.041

Greater Swiss Mountain Dog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	97	4.424	2.198	0.487	0.485	0.004
	SE		0.312	0.134	0.034	0.032	0.015

Greater Swiss Mountain Dog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	97	2.286	1.164	0.150	0.139	-0.075
	SE		0.171	0.020	0.017	0.015	0.008

Greater Swiss Mountain Dog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	97	7	2.917	0.711	0.657	-0.082
2	AHT137	97	6	2.136	0.557	0.532	-0.047
3	AHTH130	97	5	3.234	0.629	0.691	0.090
4	AHTh171-A	97	4	3.190	0.691	0.687	-0.006
5	AHTh260	97	7	1.847	0.433	0.458	0.056
6	AHTk211	97	3	2.452	0.588	0.592	0.008
7	AHTk253	97	3	2.378	0.629	0.579	-0.085
8	C22.279	97	3	1.406	0.320	0.289	-0.107
9	FH2001	97	4	1.559	0.361	0.359	-0.006
10	FH2054	97	4	1.523	0.299	0.343	0.129
11	FH2848	97	5	2.363	0.588	0.577	-0.019
12	INRA21	97	2	1.540	0.330	0.351	0.059
13	INU005	97	3	1.413	0.278	0.292	0.048
14	INU030	97	3	2.486	0.670	0.598	-0.121
15	INU055	97	1	1.000	0.000	0.000	0.000
16	LEI004	97	4	2.325	0.598	0.570	-0.049
17	REN105L03	97	3	2.758	0.711	0.637	-0.116
18	REN162C04	97	3	1.098	0.072	0.089	0.193
19	REN169D01	97	2	1.264	0.175	0.209	0.161
20	REN169O18	97	4	1.915	0.505	0.478	-0.057
21	REN247M23	97	2	1.940	0.515	0.485	-0.064
22	REN54P11	97	3	1.248	0.186	0.199	0.066
23	REN64E19	97	3	1.621	0.392	0.383	-0.023
24	VGL0760	97	6	3.285	0.732	0.696	-0.052
25	VGL0910	97	7	1.763	0.454	0.433	-0.048
26	VGL1063	97	6	1.593	0.381	0.372	-0.025
27	VGL1165	97	7	2.782	0.598	0.641	0.067
28	VGL1828	97	7	3.096	0.619	0.677	0.086
29	VGL2009	97	4	2.422	0.526	0.587	0.104
30	VGL2409	97	7	2.953	0.722	0.661	-0.091
31	VGL2918	97	5	2.799	0.546	0.643	0.150
32	VGL3008	97	7	4.385	0.784	0.772	-0.015
33	VGL3235	97	6	1.827	0.485	0.453	-0.070

Greater Swiss Mountain Dog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	97	3	1.221	0.196	0.181	-0.083
2	DLA I-4ACA	97	2	1.143	0.134	0.125	-0.072
3	DLA I-4BCT	97	2	1.143	0.134	0.125	-0.072
4	DLA1131	97	3	1.221	0.196	0.181	-0.083
5	5ACA	97	2	1.143	0.134	0.125	-0.072
6	5ACT	97	2	1.064	0.062	0.060	-0.032
7	5BCA	97	2	1.215	0.196	0.177	-0.109