Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Greater Swiss Mountain Dog

Updated Jul 31, 2025

DLA Class I Haplotype Frequencies

#	Locus Name	Allele	Greater Swiss Mountain Dog (n=90)
1	AHT121	92	0.044
		96	0.067
		100	0.083
		102	0.356
		104	0.006
		108	0.439
		114	0.006
2	AHT137	131	0.022
		135	0.022
		137	0.611
		149	0.028
		151	0.289
		153	0.028
3	AHTH130	117	0.389
		125	0.206
		129	0.322
		131	0.039
		139	0.044
4	AHTh171-A	219	0.283
		225	0.394
		229	0.050
		235	0.272
5	AHTh260	238	0.150
		244	0.050
		246	0.722
		250	0.050
		252	0.006
		254	0.022
6	AHTk211	87	0.544
		89	0.272
		91	0.183
7	AHTk253	286	0.511
		288	0.378
		292	0.111
8	C22.279	116	0.822
		118	0.106
		120	0.072
9	FH2001	132	0.783
		140	0.006
		148	0.200
		152	0.011
10	FH2054	148	0.033
		152	0.811
		156	0.122
		164	0.033
11	FH2848	230	0.122
		232	0.278
		238	0.028
		240	0.561
		242	0.011
12	INRA21	95	0.222
12	INRA21	101	0.778
13	INU005	124	0.128
		126	0.861
		128	0.011
14	INU030	144	0.250
		150	0.544
		156	0.206
15	INU055	210	1.000
16	LEI004	85	0.583
		95	0.322
		97	0.078
		107	0.017
17	REN105L03	233	0.400
		237	0.183
		241	0.417
18	REN162C04	202	0.033
		204	0.017
		206	0.950
19	REN169D01	216	0.878
19	REN169D01	220	0.122
20	REN169O18	164	0.117
		166	0.006
		168	0.678
		170	0.200
21	REN247M23	268	0.578
21	REN247M23	274	0.422
22	REN54P11	222	0.044
		226	0.883
		234	0.072
23	REN64E19	147	0.111
		149	0.761
		153	0.128
24	VGL0760	12	0.094
		13	0.144
		19.2	0.006
		20.2	0.422
		22.2	0.022
		23.2	0.311
25	VGL0910	12	0.039
		16.1	0.006
		17.1	0.022
		18.1	0.728
		19.1	0.022
		20.1	0.156
		21.1	0.028
26	VGL1063	13	0.011
		14	0.767
		15	0.028
		18	0.056
		19	0.106
		20	0.033
27	VGL1165	19	0.494
		20	0.006
		23	0.033
		26	0.028
		27	0.006
		28	0.356
		29	0.078
28	VGL1828	14	0.067
		16	0.017
		18	0.006
		20	0.150
		21	0.439
		22	0.317
		23	0.006
29	VGL2009	9	0.144
		13	0.561
		14	0.267
		15	0.028
30	VGL2409	13	0.011
		15	0.222
		16	0.100
		17	0.167
		18	0.489
		19	0.006
		20	0.006
31	VGL2918	12	0.006
		13	0.422
		14	0.206
		16.3	0.006
		17.3	0.361
32	VGL3008	13	0.067
		14	0.006
		17	0.061
		18	0.139
		19	0.328
		20	0.261
		21	0.139
33	VGL3235	13	0.100
		14	0.728
		15	0.011
		16	0.111
		17	0.006
		18	0.044

Greater Swiss Mountain Dog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	90	4.394	2.211	0.485	0.486	0.009
	SE		0.306	0.137	0.034	0.033	0.016

Greater Swiss Mountain Dog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	90	2.286	1.144	0.133	0.125	-0.065
	SE		0.171	0.018	0.016	0.014	0.007

Greater Swiss Mountain Dog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	90	7	3.008	0.700	0.668	-0.049
2	AHT137	90	6	2.177	0.556	0.541	-0.028
3	AHTH130	90	5	3.324	0.622	0.699	0.110
4	AHTh171-A	90	4	3.200	0.678	0.688	0.014
5	AHTh260	90	6	1.819	0.411	0.450	0.087
6	AHTk211	90	3	2.474	0.600	0.596	-0.007
7	AHTk253	90	3	2.402	0.622	0.584	-0.066
8	C22.279	90	3	1.444	0.344	0.308	-0.120
9	FH2001	90	4	1.530	0.344	0.346	0.005
10	FH2054	90	4	1.481	0.267	0.325	0.179
11	FH2848	90	5	2.452	0.611	0.592	-0.032
12	INRA21	90	2	1.528	0.311	0.346	0.100
13	INU005	90	3	1.319	0.267	0.242	-0.102
14	INU030	90	3	2.493	0.667	0.599	-0.113
15	INU055	90	1	1.000	0.000	0.000	0.000
16	LEI004	90	4	2.220	0.567	0.550	-0.031
17	REN105L03	90	3	2.723	0.711	0.633	-0.124
18	REN162C04	90	3	1.106	0.078	0.096	0.191
19	REN169D01	90	2	1.273	0.178	0.215	0.171
20	REN169O18	90	4	1.949	0.511	0.487	-0.050
21	REN247M23	90	2	1.953	0.511	0.488	-0.048
22	REN54P11	90	3	1.270	0.200	0.213	0.059
23	REN64E19	90	3	1.645	0.400	0.392	-0.020
24	VGL0760	90	6	3.275	0.733	0.695	-0.056
25	VGL0910	90	7	1.795	0.467	0.443	-0.054
26	VGL1063	90	6	1.656	0.411	0.396	-0.038
27	VGL1165	90	7	2.639	0.578	0.621	0.070
28	VGL1828	90	7	3.123	0.600	0.680	0.117
29	VGL2009	90	4	2.453	0.533	0.592	0.100
30	VGL2409	90	7	3.064	0.733	0.674	-0.089
31	VGL2918	90	5	2.849	0.533	0.649	0.178
32	VGL3008	90	7	4.496	0.800	0.778	-0.029
33	VGL3235	90	6	1.805	0.467	0.446	-0.047

Greater Swiss Mountain Dog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	90	3	1.199	0.178	0.166	-0.073
2	DLA I-4ACA	90	2	1.117	0.111	0.105	-0.059
3	DLA I-4BCT	90	2	1.117	0.111	0.105	-0.059
4	DLA1131	90	3	1.199	0.178	0.166	-0.073
5	5ACA	90	2	1.117	0.111	0.105	-0.059
6	5ACT	90	2	1.069	0.067	0.064	-0.034
7	5BCA	90	2	1.193	0.178	0.162	-0.098