Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Greater Swiss Mountain Dog

Updated Jun 28, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

#	Locus Name	Allele	Greater Swiss Mountain Dog (n=70)
1	AHT121	92	0.021
		96	0.064
		100	0.071
		102	0.407
		104	0.007
		108	0.421
		114	0.007
2	AHT137	131	0.029
		135	0.014
		137	0.593
		149	0.036
		151	0.300
		153	0.029
3	AHTH130	117	0.421
		125	0.150
		129	0.371
		131	0.007
		139	0.050
4	AHTh171-A	219	0.236
		225	0.414
		229	0.043
		235	0.307
5	AHTh260	238	0.179
		244	0.064
		246	0.657
		250	0.064
		252	0.007
		254	0.029
6	AHTk211	87	0.550
		89	0.243
		91	0.207
7	AHTk253	286	0.550
		288	0.321
		292	0.129
8	C22.279	116	0.779
		118	0.129
		120	0.093
9	FH2001	132	0.807
		140	0.007
		148	0.171
		152	0.014
10	FH2054	148	0.043
		152	0.850
		156	0.079
		164	0.029
11	FH2848	230	0.129
		232	0.250
		238	0.021
		240	0.593
		242	0.007
12	INRA21	95	0.186
12	INRA21	101	0.814
13	INU005	124	0.157
		126	0.829
		128	0.014
14	INU030	144	0.264
		150	0.521
		156	0.214
15	INU055	210	1.000
16	LEI004	85	0.600
		95	0.300
		97	0.079
		107	0.021
17	REN105L03	233	0.371
		237	0.207
		241	0.421
18	REN162C04	202	0.014
		204	0.014
		206	0.971
19	REN169D01	216	0.850
19	REN169D01	220	0.150
20	REN169O18	164	0.086
		166	0.007
		168	0.721
		170	0.186
21	REN247M23	268	0.629
21	REN247M23	274	0.371
22	REN54P11	222	0.029
		226	0.914
		234	0.057
23	REN64E19	147	0.093
		149	0.771
		153	0.136
24	VGL0760	12	0.100
		13	0.136
		19.2	0.007
		20.2	0.393
		22.2	0.007
		23.2	0.357
25	VGL0910	12	0.007
		16.1	0.007
		17.1	0.007
		18.1	0.757
		19.1	0.029
		20.1	0.157
		21.1	0.036
26	VGL1063	13	0.014
		14	0.779
		15	0.036
		18	0.064
		19	0.086
		20	0.021
27	VGL1165	19	0.436
		20	0.007
		23	0.036
		26	0.029
		27	0.007
		28	0.400
		29	0.086
28	VGL1828	14	0.043
		16	0.021
		18	0.007
		20	0.150
		21	0.414
		22	0.357
		23	0.007
29	VGL2009	9	0.157
		13	0.493
		14	0.321
		15	0.029
30	VGL2409	13	0.014
		15	0.243
		16	0.093
		17	0.136
		18	0.500
		19	0.007
		20	0.007
31	VGL2918	12	0.007
		13	0.436
		14	0.221
		16.3	0.007
		17.3	0.329
32	VGL3008	13	0.057
		17	0.057
		18	0.171
		19	0.371
		20	0.236
		21	0.107
33	VGL3235	13	0.114
		14	0.750
		15	0.014
		16	0.057
		17	0.007
		18	0.057

Greater Swiss Mountain Dog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	70	4.364	2.177	0.481	0.479	0.008
	SE		0.299	0.130	0.034	0.033	0.023

Greater Swiss Mountain Dog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	70	2.286	1.150	0.139	0.129	-0.071
	SE		0.171	0.020	0.018	0.016	0.009

Greater Swiss Mountain Dog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	70	7	2.832	0.686	0.647	-0.060
2	AHT137	70	6	2.249	0.557	0.555	-0.003
3	AHTH130	70	5	2.936	0.571	0.659	0.133
4	AHTh171-A	70	4	3.092	0.686	0.677	-0.013
5	AHTh260	70	6	2.115	0.500	0.527	0.051
6	AHTk211	70	3	2.473	0.614	0.596	-0.031
7	AHTk253	70	3	2.368	0.586	0.578	-0.014
8	C22.279	70	3	1.584	0.429	0.369	-0.162
9	FH2001	70	4	1.468	0.271	0.319	0.149
10	FH2054	70	4	1.367	0.243	0.269	0.096
11	FH2848	70	5	2.320	0.614	0.569	-0.080
12	INRA21	70	2	1.434	0.343	0.302	-0.134
13	INU005	70	3	1.406	0.329	0.289	-0.139
14	INU030	70	3	2.580	0.657	0.612	-0.073
15	INU055	70	1	1.000	0.000	0.000	0.000
16	LEI004	70	4	2.190	0.543	0.543	0.001
17	REN105L03	70	3	2.790	0.714	0.642	-0.113
18	REN162C04	70	3	1.059	0.029	0.056	0.489
19	REN169D01	70	2	1.342	0.214	0.255	0.160
20	REN169O18	70	4	1.778	0.486	0.438	-0.110
21	REN247M23	70	2	1.876	0.514	0.467	-0.101
22	REN54P11	70	3	1.190	0.143	0.160	0.107
23	REN64E19	70	3	1.607	0.400	0.378	-0.059
24	VGL0760	70	6	3.222	0.743	0.690	-0.077
25	VGL0910	70	7	1.666	0.443	0.400	-0.108
26	VGL1063	70	6	1.614	0.371	0.380	0.024
27	VGL1165	70	7	2.783	0.586	0.641	0.086
28	VGL1828	70	7	3.086	0.614	0.676	0.091
29	VGL2009	70	4	2.690	0.600	0.628	0.045
30	VGL2409	70	7	2.973	0.714	0.664	-0.076
31	VGL2918	70	5	2.882	0.471	0.653	0.278
32	VGL3008	70	6	4.151	0.757	0.759	0.003
33	VGL3235	70	6	1.717	0.457	0.418	-0.095

Greater Swiss Mountain Dog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	70	3	1.189	0.171	0.159	-0.080
2	DLA I-4ACA	70	2	1.153	0.143	0.133	-0.077
3	DLA I-4BCT	70	2	1.153	0.143	0.133	-0.077
4	DLA1131	70	3	1.189	0.171	0.159	-0.080
5	5ACA	70	2	1.153	0.143	0.133	-0.077
6	5ACT	70	2	1.029	0.029	0.028	-0.014
7	5BCA	70	2	1.186	0.171	0.157	-0.094