Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

Updated Aug 27, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Havanese (n=1175)
1003	387 375 277 186	0.0387
1006	387 375 293 180	0.0549
1009	382 377 277 184	0.0004
1011	376 365 281 180	0.0009
1012	388 369 289 188	0.0111
1014	375 373 287 178	0.0183
1016	382 371 277 178	0.1923
1017	386 373 289 178	0.0009
1018	375 373 287 186	0.0068
1019	380 373 287 185	0.0009
1029	380 365 281 182	0.0357
1030	380 373 293 178	0.0026
1033	382 379 277 181	0.0013
1035	386 373 277 184	0.0038
1040	380 371 277 186	0.0157
1052	380 372 289 184	0.0089
1054	382 379 277 184	0.1230
1062	382 371 277 183	0.0004
1068	380 373 287 181	0.0128
1071	380 373 277 178	0.0004
1084	376 373 277 184	0.0013
1087	380 371 277 178	0.0034
1092	376 379 277 181	0.0962
1093	386 379 277 180	0.0136
1105	382 379 277 178	0.0009
1111	387 378 287 182	0.0026
1114	380 373 287 183	0.0170
1115	386 371 277 182	0.0923
1116	380 365 289 186	0.1081
1117	376 373 277 180	0.0477
1118	376 377 277 180	0.0009
1120	376 386 289 176	0.0009
1121	380 371 277 183	0.0047
1123	386 379 277 184	0.0013
1124	388 373 289 178	0.0055
1125	393 383 277 185	0.0217
1128	384 376 287 182	0.0009
1129	382 371 277 181	0.0009
1132	376 379 277 184	0.0013
1133	378 365 287 172	0.0170
1134	384 365 291 178	0.0009
1136	382 371 277 182	0.0004
1140	376 379 301 180	0.0038
1142	376 379 277 180	0.0047
1147	391 375 293 180	0.0026
1148	376 375 277 180	0.0021
1154	376 365 281 183	0.0098
1155	388 369 287 184	0.0004
1173	392 371 277 186	0.0038
1180	386 371 277 181	0.0004
1260	387 379 277 184	0.0004
1262	382 377 289 180	0.0009
1266	378 365 287 181	0.0009
1290	380 369 277 181	0.0009
1300	388 369 260 184	0.0004

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Havanese (n=1175)
2001	343 324 284	0.0430
2003	343 324 282	0.2140
2005	339 322 280	0.0026
2006	339 325 280	0.0013
2007	351 327 280	0.0574
2008	339 327 276	0.0004
2011	345 322 284	0.0004
2012	345 322 280	0.0026
2014	339 322 284	0.0034
2016	339 323 284	0.0264
2017	343 322 280	0.0098
2018	339 324 284	0.0251
2021	339 324 268	0.0047
2022	339 327 282	0.1157
2023	341 323 282	0.0026
2024	343 323 280	0.0034
2028	345 327 288	0.0009
2032	339 323 280	0.0183
2033	339 323 282	0.0013
2035	341 323 280	0.0021
2037	341 327 280	0.0183
2040	345 327 280	0.0038
2053	343 324 280	0.0285
2066	339 324 280	0.1638
2068	339 327 284	0.0004
2070	347 324 282	0.1077
2071	339 322 286	0.0047
2072	339 325 282	0.0170
2073	339 327 286	0.0085
2074	341 324 284	0.0477
2075	341 327 282	0.0366
2076	345 322 282	0.0055
2077	347 325 286	0.0170
2079	343 323 278	0.0009
2082	339 325 268	0.0038
2087	347 324 280	0.0004

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Havanese (n=1191)
1	AHT121	88	0.0004
		92	0.1062
		94	0.0764
		96	0.0021
		98	0.0097
		100	0.0470
		102	0.1058
		104	0.5311
		106	0.0348
		108	0.0823
		110	0.0013
		112	0.0029
2	AHT137	131	0.2334
		133	0.0617
		137	0.0819
		139	0.0399
		141	0.1788
		143	0.1117
		145	0.0080
		147	0.2003
		149	0.0642
		151	0.0193
		155	0.0008
3	AHTH130	117	0.0361
		119	0.2662
		121	0.0495
		123	0.0311
		125	0.3669
		127	0.1864
		129	0.0407
		131	0.0202
		133	0.0029
4	AHTh171-A	217	0.0017
		219	0.1608
		221	0.0013
		225	0.2552
		227	0.0294
		229	0.1864
		231	0.2779
		233	0.0206
		235	0.0386
		237	0.0281
5	AHTh260	238	0.1243
		242	0.0134
		244	0.2343
		246	0.2876
		248	0.2040
		250	0.1050
		252	0.0025
		254	0.0273
		258	0.0017
6	AHTk211	87	0.4740
		89	0.2254
		91	0.1465
		95	0.1432
		97	0.0109
7	AHTk253	284	0.0118
		286	0.0697
		288	0.6432
		290	0.0487
		292	0.2267
8	C22.279	116	0.1037
		118	0.2128
		120	0.0050
		122	0.0168
		124	0.2288
		126	0.1327
		128	0.0008
		130	0.2993
9	FH2001	124	0.0403
		128	0.0088
		132	0.4127
		136	0.0113
		140	0.0109
		144	0.4530
		148	0.0516
		152	0.0097
		158	0.0017
10	FH2054	148	0.0160
		152	0.0844
		156	0.2510
		160	0.1986
		164	0.0882
		168	0.1465
		172	0.1100
		176	0.1020
		180	0.0029
		184	0.0004
11	FH2848	230	0.0139
		232	0.3044
		234	0.0487
		236	0.0823
		238	0.0466
		240	0.2343
		242	0.2603
		244	0.0055
		246	0.0042
12	INRA21	91	0.1373
		95	0.0995
		97	0.3749
		99	0.0504
		101	0.1776
		103	0.1495
		105	0.0109
13	INU005	106	0.0008
		110	0.0306
		122	0.0134
		124	0.5882
		126	0.2175
		128	0.0088
		132	0.0273
		134	0.0038
		138	0.1096
14	INU030	144	0.6343
		146	0.0386
		148	0.0235
		150	0.1276
		152	0.1612
		154	0.0134
		156	0.0013
15	INU055	210	0.3736
		212	0.2061
		214	0.1003
		216	0.1297
		218	0.1847
		222	0.0055
16	LEI004	83	0.0004
		85	0.6419
		93	0.0004
		95	0.2254
		97	0.0134
		101	0.0017
		105	0.0004
		107	0.1092
		109	0.0071
17	REN105L03	227	0.0223
		229	0.0181
		231	0.2091
		233	0.0924
		235	0.0034
		237	0.1906
		239	0.0113
		241	0.4471
		245	0.0059
18	REN162C04	200	0.0348
		202	0.2200
		204	0.0491
		206	0.3967
		208	0.1285
		210	0.1709
19	REN169D01	202	0.0684
		204	0.0008
		210	0.1683
		212	0.0516
		214	0.0269
		216	0.4215
		218	0.0701
		220	0.1923
20	REN169O18	160	0.0697
		162	0.2045
		164	0.0424
		166	0.2322
		168	0.1860
		170	0.2347
		172	0.0306
21	REN247M23	266	0.0004
		268	0.4110
		270	0.1037
		272	0.1654
		274	0.0185
		276	0.2712
		278	0.0298
22	REN54P11	222	0.1683
		226	0.2670
		228	0.1104
		232	0.0903
		234	0.0600
		236	0.0407
		238	0.2632
23	REN64E19	139	0.1423
		143	0.0130
		145	0.0974
		147	0.3107
		149	0.0151
		151	0.0038
		153	0.3997
		155	0.0176
		157	0.0004
24	VGL0760	12	0.0319
		13	0.0609
		14	0.1029
		15	0.0097
		18.2	0.0978
		19.2	0.0025
		20.2	0.0168
		21.2	0.2330
		22.2	0.1709
		23.2	0.1612
		24.2	0.0504
		25.2	0.0290
		26.2	0.0327
		27.2	0.0004
25	VGL0910	13	0.0038
		14	0.0097
		16.1	0.0919
		17	0.0063
		17.1	0.1012
		18	0.0248
		18.1	0.0609
		19.1	0.1700
		20.1	0.0407
		20.3	0.0050
		21.1	0.3149
		22	0.0327
		22.1	0.1062
		23	0.0155
		23.1	0.0164
26	VGL1063	8	0.0235
		12	0.0844
		13	0.0399
		14	0.1982
		15	0.1029
		16	0.0071
		17	0.0877
		18	0.0688
		19	0.0437
		20	0.0856
		21	0.0894
		22	0.1562
		23	0.0126
27	VGL1165	14	0.0008
		15	0.0004
		16	0.0059
		17	0.0294
		18	0.1108
		19	0.0155
		20	0.0290
		21	0.1125
		22	0.0004
		23	0.0248
		25	0.0038
		26	0.3526
		27	0.0705
		28	0.1746
		29	0.0080
		30	0.0113
		31	0.0231
		32	0.0105
		33	0.0151
		34	0.0008
28	VGL1828	15	0.0143
		16	0.3073
		17	0.0050
		18	0.0214
		19	0.0319
		19.3	0.0029
		20	0.1096
		20.3	0.0004
		21	0.3606
		22	0.0638
		23	0.0819
		24	0.0008
29	VGL2009	9	0.0021
		10	0.0025
		11	0.1457
		12	0.0256
		13	0.2145
		14	0.2284
		15	0.2939
		16	0.0861
		17	0.0013
30	VGL2409	14	0.0118
		15	0.0701
		16	0.3279
		17	0.3241
		18	0.2120
		19	0.0029
		20	0.0420
		21	0.0092
31	VGL2918	12	0.0441
		13	0.2821
		14	0.1486
		15	0.0680
		16	0.0109
		16.3	0.0055
		17.3	0.0109
		18.3	0.0668
		19.3	0.0411
		20.3	0.0306
		21.3	0.0672
		22.3	0.2158
		23.3	0.0084
32	VGL3008	10	0.0004
		13	0.1276
		14	0.0084
		15	0.0709
		16	0.0264
		17	0.1100
		18	0.1537
		19	0.1767
		20	0.2040
		21	0.1041
		22	0.0105
		23	0.0071
33	VGL3235	11	0.0109
		12	0.0181
		13	0.1264
		14	0.2783
		15	0.3438
		16	0.0285
		17	0.0395
		18	0.0663
		19	0.0835
		20	0.0046

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1191	9.515	4.475	0.730	0.747	0.023
	SE		0.535	0.268	0.016	0.016	0.004

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1191	8.857	3.837	0.669	0.690	0.032
	SE		0.999	0.600	0.047	0.047	0.005

Standard genetic assessment for individual STR loci

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1191	12	3.119	0.673	0.679	0.009
2	AHT137	1191	11	6.422	0.832	0.844	0.014
3	AHTH130	1191	9	4.048	0.715	0.753	0.050
4	AHTh171-A	1191	10	4.841	0.787	0.793	0.008
5	AHTh260	1191	9	4.840	0.769	0.793	0.031
6	AHTk211	1191	5	3.149	0.652	0.682	0.045
7	AHTk253	1191	5	2.117	0.485	0.528	0.080
8	C22.279	1191	8	4.632	0.757	0.784	0.034
9	FH2001	1191	9	2.630	0.625	0.620	-0.008
10	FH2054	1191	10	6.189	0.831	0.838	0.009
11	FH2848	1191	9	4.409	0.752	0.773	0.027
12	INRA21	1191	7	4.428	0.743	0.774	0.040
13	INU005	1191	9	2.456	0.594	0.593	-0.003
14	INU030	1191	7	2.238	0.544	0.553	0.016
15	INU055	1191	6	4.113	0.730	0.757	0.036
16	LEI004	1191	9	2.105	0.533	0.525	-0.016
17	REN105L03	1191	9	3.455	0.683	0.711	0.038
18	REN162C04	1191	6	3.920	0.730	0.745	0.019
19	REN169D01	1191	8	3.907	0.733	0.744	0.015
20	REN169O18	1191	7	5.183	0.793	0.807	0.017
21	REN247M23	1191	7	3.548	0.703	0.718	0.021
22	REN54P11	1191	7	5.141	0.772	0.805	0.041
23	REN64E19	1191	9	3.488	0.712	0.713	0.002
24	VGL0760	1191	14	7.185	0.851	0.861	0.012
25	VGL0910	1191	15	6.033	0.814	0.834	0.025
26	VGL1063	1191	13	8.820	0.877	0.887	0.011
27	VGL1165	1191	20	5.307	0.762	0.812	0.062
28	VGL1828	1191	12	4.016	0.766	0.751	-0.020
29	VGL2009	1191	9	4.677	0.759	0.786	0.035
30	VGL2409	1191	8	3.782	0.713	0.736	0.031
31	VGL2918	1191	13	5.997	0.827	0.833	0.007
32	VGL3008	1191	12	7.059	0.848	0.858	0.012
33	VGL3235	1191	10	4.427	0.732	0.774	0.054

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1191	12	5.036	0.782	0.801	0.025
2	DLA I-4ACA	1191	12	4.700	0.759	0.787	0.036
3	DLA I-4BCT	1191	8	2.039	0.500	0.510	0.020
4	DLA1131	1191	11	6.663	0.833	0.850	0.020
5	5ACA	1191	6	3.581	0.699	0.721	0.031
6	5ACT	1191	5	2.130	0.499	0.531	0.060
7	5BCA	1191	8	2.710	0.610	0.631	0.034

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media