Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

Updated Jun 22, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Havanese (n=1182)
1003	387 375 277 186	0.0444
1006	387 375 293 180	0.0546
1009	382 377 277 184	0.0004
1011	376 365 281 180	0.0008
1012	388 369 289 188	0.0106
1014	375 373 287 178	0.0182
1016	382 371 277 178	0.1912
1017	386 373 289 178	0.0004
1018	375 373 287 186	0.0068
1019	380 373 287 185	0.0008
1029	380 365 281 182	0.0355
1030	380 373 293 178	0.0025
1033	382 379 277 181	0.0013
1035	386 373 277 184	0.0038
1040	380 371 277 186	0.0148
1052	380 372 289 184	0.0089
1054	382 379 277 184	0.1231
1062	382 371 277 183	0.0004
1068	380 373 287 181	0.0127
1071	380 373 277 178	0.0004
1084	376 373 277 184	0.0013
1087	380 371 277 178	0.0034
1092	376 379 277 181	0.0990
1093	386 379 277 180	0.0135
1105	382 379 277 178	0.0008
1111	387 378 287 182	0.0030
1114	380 373 287 183	0.0165
1115	386 371 277 182	0.0918
1116	380 365 289 186	0.1049
1117	376 373 277 180	0.0478
1118	376 377 277 180	0.0008
1120	376 386 289 176	0.0008
1121	380 371 277 183	0.0047
1123	386 379 277 184	0.0013
1124	388 373 289 178	0.0055
1125	393 383 277 185	0.0212
1128	384 376 287 182	0.0008
1129	382 371 277 181	0.0008
1132	376 379 277 184	0.0013
1133	378 365 287 172	0.0169
1134	384 365 291 178	0.0008
1136	382 371 277 182	0.0004
1140	376 379 301 180	0.0038
1142	376 379 277 180	0.0047
1147	391 375 293 180	0.0025
1148	376 375 277 180	0.0021
1154	376 365 281 183	0.0097
1155	388 369 287 184	0.0004
1173	392 371 277 186	0.0038
1180	386 371 277 181	0.0004
1260	387 379 277 184	0.0004
1262	382 377 289 180	0.0008
1266	378 365 287 181	0.0008
1290	380 369 277 181	0.0008
1300	388 369 260 184	0.0004

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Havanese (n=1182)
2001	343 324 284	0.0491
2003	343 324 282	0.2153
2005	339 322 280	0.0021
2006	339 325 280	0.0013
2007	351 327 280	0.0571
2008	339 327 276	0.0004
2011	345 322 284	0.0004
2012	345 322 280	0.0025
2014	339 322 284	0.0034
2016	339 323 284	0.0258
2017	343 322 280	0.0097
2018	339 324 284	0.0250
2021	339 324 268	0.0047
2022	339 327 282	0.1159
2023	341 323 282	0.0025
2024	343 323 280	0.0038
2028	345 327 288	0.0008
2032	339 323 280	0.0182
2033	339 323 282	0.0013
2035	341 323 280	0.0021
2037	341 327 280	0.0182
2040	345 327 280	0.0038
2053	343 324 280	0.0275
2066	339 324 280	0.1629
2068	339 327 284	0.0004
2070	347 324 282	0.1045
2071	339 322 286	0.0047
2072	339 325 282	0.0165
2073	339 327 286	0.0085
2074	341 324 284	0.0478
2075	341 327 282	0.0364
2076	345 322 282	0.0055
2077	347 325 286	0.0169
2079	343 323 278	0.0008
2082	339 325 268	0.0038
2087	347 324 280	0.0004

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Havanese (n=1185)
1	AHT121	88	0.0004
		92	0.1059
		94	0.0768
		96	0.0021
		98	0.0097
		100	0.0464
		102	0.1059
		104	0.5312
		106	0.0350
		108	0.0823
		110	0.0013
		112	0.0030
2	AHT137	131	0.2329
		133	0.0620
		137	0.0823
		139	0.0397
		141	0.1785
		143	0.1122
		145	0.0080
		147	0.1996
		149	0.0646
		151	0.0194
		155	0.0008
3	AHTH130	117	0.0363
		119	0.2637
		121	0.0494
		123	0.0312
		125	0.3679
		127	0.1873
		129	0.0409
		131	0.0203
		133	0.0030
4	AHTh171-A	217	0.0017
		219	0.1599
		221	0.0013
		225	0.2557
		227	0.0291
		229	0.1873
		231	0.2776
		233	0.0207
		235	0.0388
		237	0.0278
5	AHTh260	238	0.1236
		242	0.0135
		244	0.2342
		246	0.2878
		248	0.2038
		250	0.1055
		252	0.0025
		254	0.0274
		258	0.0017
6	AHTk211	87	0.4747
		89	0.2266
		91	0.1464
		95	0.1414
		97	0.0110
7	AHTk253	284	0.0118
		286	0.0700
		288	0.6418
		290	0.0489
		292	0.2274
8	C22.279	116	0.1038
		118	0.2131
		120	0.0051
		122	0.0169
		124	0.2274
		126	0.1333
		128	0.0008
		130	0.2996
9	FH2001	124	0.0405
		128	0.0089
		132	0.4127
		136	0.0114
		140	0.0110
		144	0.4523
		148	0.0519
		152	0.0097
		158	0.0017
10	FH2054	148	0.0160
		152	0.0831
		156	0.2498
		160	0.1996
		164	0.0878
		168	0.1473
		172	0.1105
		176	0.1025
		180	0.0030
		184	0.0004
11	FH2848	230	0.0139
		232	0.3045
		234	0.0490
		236	0.0823
		238	0.0469
		240	0.2331
		242	0.2606
		244	0.0055
		246	0.0042
12	INRA21	91	0.1363
		95	0.0996
		97	0.3751
		99	0.0506
		101	0.1781
		103	0.1494
		105	0.0110
13	INU005	106	0.0008
		110	0.0304
		122	0.0135
		124	0.5882
		126	0.2177
		128	0.0089
		132	0.0266
		134	0.0038
		138	0.1101
14	INU030	144	0.6338
		146	0.0388
		148	0.0236
		150	0.1274
		152	0.1616
		154	0.0135
		156	0.0013
15	INU055	210	0.3747
		212	0.2059
		214	0.1004
		216	0.1287
		218	0.1848
		222	0.0055
16	LEI004	83	0.0004
		85	0.6409
		93	0.0004
		95	0.2257
		97	0.0135
		101	0.0017
		105	0.0004
		107	0.1097
		109	0.0072
17	REN105L03	227	0.0224
		229	0.0181
		231	0.2093
		233	0.0924
		235	0.0034
		237	0.1895
		239	0.0114
		241	0.4477
		245	0.0059
18	REN162C04	200	0.0350
		202	0.2194
		204	0.0489
		206	0.3962
		208	0.1291
		210	0.1713
19	REN169D01	202	0.0679
		204	0.0008
		210	0.1688
		212	0.0519
		214	0.0270
		216	0.4215
		218	0.0700
		220	0.1920
20	REN169O18	160	0.0696
		162	0.2046
		164	0.0422
		166	0.2329
		168	0.1852
		170	0.2346
		172	0.0308
21	REN247M23	266	0.0004
		268	0.4110
		270	0.1038
		272	0.1646
		274	0.0181
		276	0.2722
		278	0.0300
22	REN54P11	222	0.1679
		226	0.2667
		228	0.1101
		232	0.0907
		234	0.0603
		236	0.0409
		238	0.2633
23	REN64E19	139	0.1426
		143	0.0131
		145	0.0966
		147	0.3118
		149	0.0152
		151	0.0038
		153	0.3987
		155	0.0177
		157	0.0004
24	VGL0760	12	0.0321
		13	0.0612
		14	0.1034
		15	0.0097
		18.2	0.0983
		19.2	0.0025
		20.2	0.0169
		21.2	0.2321
		22.2	0.1709
		23.2	0.1608
		24.2	0.0502
		25.2	0.0291
		26.2	0.0325
		27.2	0.0004
25	VGL0910	13	0.0038
		14	0.0097
		16.1	0.0920
		17	0.0063
		17.1	0.1004
		18	0.0249
		18.1	0.0612
		19.1	0.1696
		20.1	0.0409
		20.3	0.0051
		21.1	0.3156
		22	0.0325
		22.1	0.1063
		23	0.0152
		23.1	0.0165
26	VGL1063	8	0.0236
		12	0.0844
		13	0.0401
		14	0.1979
		15	0.1034
		16	0.0072
		17	0.0865
		18	0.0692
		19	0.0439
		20	0.0861
		21	0.0890
		22	0.1561
		23	0.0127
27	VGL1165	14	0.0008
		15	0.0004
		16	0.0059
		17	0.0291
		18	0.1110
		19	0.0156
		20	0.0291
		21	0.1127
		22	0.0004
		23	0.0249
		25	0.0038
		26	0.3527
		27	0.0709
		28	0.1734
		29	0.0080
		30	0.0114
		31	0.0232
		32	0.0105
		33	0.0152
		34	0.0008
28	VGL1828	15	0.0143
		16	0.3055
		17	0.0051
		18	0.0215
		19	0.0321
		19.3	0.0030
		20	0.1101
		20.3	0.0004
		21	0.3608
		22	0.0641
		23	0.0823
		24	0.0008
29	VGL2009	9	0.0021
		10	0.0025
		11	0.1451
		12	0.0257
		13	0.2148
		14	0.2283
		15	0.2937
		16	0.0865
		17	0.0013
30	VGL2409	14	0.0118
		15	0.0696
		16	0.3278
		17	0.3241
		18	0.2122
		19	0.0030
		20	0.0422
		21	0.0093
31	VGL2918	12	0.0439
		13	0.2831
		14	0.1494
		15	0.0675
		16	0.0110
		16.3	0.0055
		17.3	0.0110
		18.3	0.0667
		19.3	0.0414
		20.3	0.0308
		21.3	0.0667
		22.3	0.2148
		23.3	0.0084
32	VGL3008	10	0.0004
		13	0.1278
		14	0.0084
		15	0.0709
		16	0.0266
		17	0.1097
		18	0.1536
		19	0.1776
		20	0.2034
		21	0.1038
		22	0.0105
		23	0.0072
33	VGL3235	11	0.0105
		12	0.0181
		13	0.1262
		14	0.2768
		15	0.3451
		16	0.0283
		17	0.0397
		18	0.0667
		19	0.0840
		20	0.0046

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1185	9.515	4.477	0.730	0.748	0.023
	SE		0.535	0.268	0.016	0.016	0.004

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1185	8.857	3.833	0.669	0.690	0.032
	SE		0.999	0.599	0.048	0.047	0.005

Standard genetic assessment for individual STR loci

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1185	12	3.117	0.673	0.679	0.010
2	AHT137	1185	11	6.438	0.832	0.845	0.015
3	AHTH130	1185	9	4.051	0.718	0.753	0.046
4	AHTh171-A	1185	10	4.838	0.786	0.793	0.009
5	AHTh260	1185	9	4.842	0.770	0.793	0.030
6	AHTk211	1185	5	3.143	0.651	0.682	0.044
7	AHTk253	1185	5	2.123	0.487	0.529	0.079
8	C22.279	1185	8	4.635	0.757	0.784	0.035
9	FH2001	1185	9	2.634	0.624	0.620	-0.005
10	FH2054	1185	10	6.191	0.831	0.838	0.009
11	FH2848	1185	9	4.414	0.753	0.773	0.027
12	INRA21	1185	7	4.427	0.743	0.774	0.040
13	INU005	1185	9	2.455	0.595	0.593	-0.004
14	INU030	1185	7	2.241	0.544	0.554	0.017
15	INU055	1185	6	4.105	0.729	0.756	0.036
16	LEI004	1185	9	2.110	0.534	0.526	-0.016
17	REN105L03	1185	9	3.452	0.684	0.710	0.038
18	REN162C04	1185	6	3.925	0.730	0.745	0.021
19	REN169D01	1185	8	3.907	0.733	0.744	0.014
20	REN169O18	1185	7	5.180	0.793	0.807	0.017
21	REN247M23	1185	7	3.546	0.704	0.718	0.020
22	REN54P11	1185	7	5.146	0.771	0.806	0.043
23	REN64E19	1185	9	3.489	0.712	0.713	0.002
24	VGL0760	1185	14	7.203	0.851	0.861	0.012
25	VGL0910	1185	15	6.024	0.813	0.834	0.026
26	VGL1063	1185	13	8.830	0.876	0.887	0.012
27	VGL1165	1185	20	5.313	0.762	0.812	0.061
28	VGL1828	1185	12	4.029	0.766	0.752	-0.019
29	VGL2009	1185	9	4.679	0.759	0.786	0.035
30	VGL2409	1185	8	3.782	0.713	0.736	0.031
31	VGL2918	1185	13	5.989	0.826	0.833	0.008
32	VGL3008	1185	12	7.061	0.848	0.858	0.012
33	VGL3235	1185	10	4.425	0.732	0.774	0.054

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1185	12	5.030	0.781	0.801	0.025
2	DLA I-4ACA	1185	12	4.692	0.761	0.787	0.033
3	DLA I-4BCT	1185	8	2.032	0.498	0.508	0.019
4	DLA1131	1185	11	6.656	0.833	0.850	0.020
5	5ACA	1185	6	3.579	0.700	0.721	0.029
6	5ACT	1185	5	2.129	0.499	0.530	0.060
7	5BCA	1185	8	2.716	0.610	0.632	0.035

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media