Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

Updated Oct 29, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Havanese (n=1186)
1003	387 375 277 186	0.0384
1006	387 375 293 180	0.0565
1009	382 377 277 184	0.0004
1011	376 365 281 180	0.0008
1012	388 369 289 188	0.0110
1014	375 373 287 178	0.0185
1016	382 371 277 178	0.1918
1017	386 373 289 178	0.0008
1018	375 373 287 186	0.0067
1019	380 373 287 185	0.0008
1029	380 365 281 182	0.0354
1030	380 373 293 178	0.0025
1033	382 379 277 181	0.0013
1035	386 373 277 184	0.0038
1040	380 371 277 186	0.0160
1052	380 372 289 184	0.0089
1054	382 379 277 184	0.1223
1062	382 371 277 183	0.0004
1068	380 373 287 181	0.0126
1071	380 373 277 178	0.0004
1084	376 373 277 184	0.0013
1087	380 371 277 178	0.0034
1092	376 379 277 181	0.0961
1093	386 379 277 180	0.0135
1105	382 379 277 178	0.0008
1111	387 378 287 182	0.0025
1114	380 373 287 183	0.0169
1115	386 371 277 182	0.0927
1116	380 365 289 186	0.1083
1117	376 373 277 180	0.0472
1118	376 377 277 180	0.0008
1120	376 386 289 176	0.0008
1121	380 371 277 183	0.0046
1123	386 379 277 184	0.0013
1124	388 373 289 178	0.0055
1125	393 383 277 185	0.0228
1128	384 376 287 182	0.0008
1129	382 371 277 181	0.0008
1132	376 379 277 184	0.0013
1133	378 365 287 172	0.0169
1134	384 365 291 178	0.0008
1136	382 371 277 182	0.0004
1140	376 379 301 180	0.0038
1142	376 379 277 180	0.0046
1147	391 375 293 180	0.0025
1148	376 375 277 180	0.0021
1154	376 365 281 183	0.0097
1155	388 369 287 184	0.0004
1173	392 371 277 186	0.0038
1180	386 371 277 181	0.0004
1260	387 379 277 184	0.0004
1262	382 377 289 180	0.0008
1266	378 365 287 181	0.0008
1290	380 369 277 181	0.0008
1300	388 369 260 184	0.0004

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Havanese (n=1186)
2001	343 324 284	0.0426
2003	343 324 282	0.2142
2005	339 322 280	0.0025
2006	339 325 280	0.0013
2007	351 327 280	0.0590
2008	339 327 276	0.0004
2011	345 322 284	0.0004
2012	345 322 280	0.0025
2014	339 322 284	0.0034
2016	339 323 284	0.0274
2017	343 322 280	0.0097
2018	339 324 284	0.0249
2021	339 324 268	0.0046
2022	339 327 282	0.1151
2023	341 323 282	0.0025
2024	343 323 280	0.0034
2028	345 327 288	0.0008
2032	339 323 280	0.0181
2033	339 323 282	0.0013
2035	341 323 280	0.0021
2037	341 327 280	0.0185
2040	345 327 280	0.0038
2053	343 324 280	0.0287
2066	339 324 280	0.1636
2068	339 327 284	0.0004
2070	347 324 282	0.1079
2071	339 322 286	0.0046
2072	339 325 282	0.0169
2073	339 327 286	0.0084
2074	341 324 284	0.0472
2075	341 327 282	0.0363
2076	345 322 282	0.0055
2077	347 325 286	0.0169
2079	343 323 278	0.0008
2082	339 325 268	0.0038
2087	347 324 280	0.0004

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Havanese (n=1202)
1	AHT121	88	0.0004
		92	0.1069
		94	0.0774
		96	0.0021
		98	0.0096
		100	0.0470
		102	0.1057
		104	0.5300
		106	0.0349
		108	0.0819
		110	0.0012
		112	0.0029
2	AHT137	131	0.2346
		133	0.0624
		137	0.0815
		139	0.0399
		141	0.1780
		143	0.1123
		145	0.0079
		147	0.1984
		149	0.0649
		151	0.0191
		155	0.0008
3	AHTH130	117	0.0358
		119	0.2666
		121	0.0499
		123	0.0316
		125	0.3665
		127	0.1855
		129	0.0408
		131	0.0204
		133	0.0029
4	AHTh171-A	217	0.0017
		219	0.1618
		221	0.0012
		225	0.2546
		227	0.0304
		229	0.1868
		231	0.2770
		233	0.0204
		235	0.0383
		237	0.0279
5	AHTh260	238	0.1231
		242	0.0133
		244	0.2329
		246	0.2895
		248	0.2034
		250	0.1057
		252	0.0025
		254	0.0279
		258	0.0017
6	AHTk211	87	0.4746
		89	0.2259
		91	0.1456
		95	0.1427
		97	0.0112
7	AHTk253	284	0.0116
		286	0.0695
		288	0.6448
		290	0.0487
		292	0.2255
8	C22.279	116	0.1032
		118	0.2117
		120	0.0050
		122	0.0171
		124	0.2309
		126	0.1327
		128	0.0008
		130	0.2987
9	FH2001	124	0.0403
		128	0.0092
		132	0.4118
		136	0.0112
		140	0.0112
		144	0.4534
		148	0.0512
		152	0.0100
		158	0.0017
10	FH2054	148	0.0158
		152	0.0840
		156	0.2512
		160	0.1984
		164	0.0878
		168	0.1456
		172	0.1111
		176	0.1023
		180	0.0033
		184	0.0004
11	FH2848	230	0.0137
		232	0.3041
		234	0.0483
		236	0.0819
		238	0.0462
		240	0.2329
		242	0.2629
		244	0.0058
		246	0.0042
12	INRA21	91	0.1377
		95	0.0994
		97	0.3760
		99	0.0499
		101	0.1772
		103	0.1489
		105	0.0108
13	INU005	106	0.0008
		110	0.0308
		122	0.0133
		124	0.5874
		126	0.2176
		128	0.0087
		132	0.0275
		134	0.0046
		138	0.1094
14	INU030	144	0.6323
		146	0.0391
		148	0.0237
		150	0.1269
		152	0.1635
		154	0.0133
		156	0.0012
15	INU055	210	0.3735
		212	0.2059
		214	0.1007
		216	0.1302
		218	0.1843
		222	0.0054
16	LEI004	83	0.0004
		85	0.6414
		93	0.0004
		95	0.2255
		97	0.0146
		101	0.0017
		105	0.0004
		107	0.1086
		109	0.0071
17	REN105L03	227	0.0225
		229	0.0183
		231	0.2092
		233	0.0923
		235	0.0042
		237	0.1901
		239	0.0112
		241	0.4463
		245	0.0058
18	REN162C04	200	0.0345
		202	0.2196
		204	0.0495
		206	0.3968
		208	0.1285
		210	0.1710
19	REN169D01	202	0.0695
		204	0.0008
		210	0.1681
		212	0.0524
		214	0.0266
		216	0.4189
		218	0.0707
		220	0.1930
20	REN169O18	160	0.0707
		162	0.2042
		164	0.0437
		166	0.2317
		168	0.1847
		170	0.2346
		172	0.0304
21	REN247M23	266	0.0004
		268	0.4114
		270	0.1027
		272	0.1664
		274	0.0187
		276	0.2704
		278	0.0300
22	REN54P11	222	0.1685
		226	0.2675
		228	0.1115
		232	0.0899
		234	0.0595
		236	0.0412
		238	0.2621
23	REN64E19	139	0.1410
		143	0.0133
		145	0.0982
		147	0.3107
		149	0.0150
		151	0.0037
		153	0.4002
		155	0.0175
		157	0.0004
24	VGL0760	12	0.0316
		13	0.0607
		14	0.1027
		15	0.0096
		18.2	0.0969
		19.2	0.0025
		20.2	0.0171
		21.2	0.2334
		22.2	0.1701
		23.2	0.1618
		24.2	0.0499
		25.2	0.0300
		26.2	0.0333
		27.2	0.0004
25	VGL0910	13	0.0037
		14	0.0096
		16.1	0.0923
		17	0.0062
		17.1	0.1007
		18	0.0245
		18.1	0.0616
		19.1	0.1701
		20.1	0.0403
		20.3	0.0050
		21.1	0.3157
		22	0.0324
		22.1	0.1057
		23	0.0154
		23.1	0.0166
26	VGL1063	8	0.0233
		12	0.0840
		13	0.0395
		14	0.1984
		15	0.1027
		16	0.0071
		17	0.0878
		18	0.0686
		19	0.0437
		20	0.0861
		21	0.0894
		22	0.1568
		23	0.0125
27	VGL1165	14	0.0008
		15	0.0004
		16	0.0058
		17	0.0291
		18	0.1115
		19	0.0154
		20	0.0291
		21	0.1123
		22	0.0004
		23	0.0245
		25	0.0037
		26	0.3536
		27	0.0707
		28	0.1730
		29	0.0079
		30	0.0121
		31	0.0233
		32	0.0104
		33	0.0150
		34	0.0008
28	VGL1828	15	0.0146
		16	0.3082
		17	0.0050
		18	0.0212
		19	0.0324
		19.3	0.0029
		20	0.1086
		20.3	0.0004
		21	0.3611
		22	0.0632
		23	0.0815
		24	0.0008
29	VGL2009	9	0.0021
		10	0.0025
		11	0.1452
		12	0.0254
		13	0.2138
		14	0.2280
		15	0.2966
		16	0.0853
		17	0.0012
30	VGL2409	14	0.0116
		15	0.0703
		16	0.3270
		17	0.3249
		18	0.2126
		19	0.0029
		20	0.0416
		21	0.0092
31	VGL2918	12	0.0445
		13	0.2804
		14	0.1498
		15	0.0682
		16	0.0108
		16.3	0.0054
		17.3	0.0108
		18.3	0.0666
		19.3	0.0408
		20.3	0.0304
		21.3	0.0666
		22.3	0.2176
		23.3	0.0083
32	VGL3008	10	0.0004
		13	0.1285
		14	0.0083
		15	0.0703
		16	0.0262
		17	0.1106
		18	0.1543
		19	0.1768
		20	0.2030
		21	0.1040
		22	0.0104
		23	0.0071
33	VGL3235	11	0.0112
		12	0.0187
		13	0.1265
		14	0.2779
		15	0.3432
		16	0.0295
		17	0.0395
		18	0.0657
		19	0.0832
		20	0.0046

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1202	9.515	4.476	0.731	0.748	0.023
	SE		0.535	0.267	0.016	0.016	0.004

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1202	8.857	3.845	0.670	0.691	0.030
	SE		0.999	0.602	0.047	0.047	0.005

Standard genetic assessment for individual STR loci

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1202	12	3.128	0.676	0.680	0.007
2	AHT137	1202	11	6.431	0.833	0.845	0.014
3	AHTH130	1202	9	4.054	0.715	0.753	0.050
4	AHTh171-A	1202	10	4.849	0.786	0.794	0.010
5	AHTh260	1202	9	4.837	0.770	0.793	0.030
6	AHTk211	1202	5	3.145	0.652	0.682	0.044
7	AHTk253	1202	5	2.110	0.484	0.526	0.080
8	C22.279	1202	8	4.632	0.758	0.784	0.033
9	FH2001	1202	9	2.633	0.626	0.620	-0.010
10	FH2054	1202	10	6.191	0.833	0.838	0.007
11	FH2848	1202	9	4.400	0.753	0.773	0.026
12	INRA21	1202	7	4.416	0.744	0.774	0.039
13	INU005	1202	9	2.461	0.595	0.594	-0.002
14	INU030	1202	7	2.248	0.545	0.555	0.018
15	INU055	1202	6	4.115	0.730	0.757	0.035
16	LEI004	1202	9	2.108	0.534	0.526	-0.016
17	REN105L03	1202	9	3.464	0.685	0.711	0.037
18	REN162C04	1202	6	3.920	0.731	0.745	0.018
19	REN169D01	1202	8	3.933	0.735	0.746	0.015
20	REN169O18	1202	7	5.198	0.794	0.808	0.017
21	REN247M23	1202	7	3.548	0.703	0.718	0.021
22	REN54P11	1202	7	5.146	0.771	0.806	0.043
23	REN64E19	1202	9	3.485	0.711	0.713	0.002
24	VGL0760	1202	14	7.189	0.851	0.861	0.011
25	VGL0910	1202	15	6.017	0.814	0.834	0.024
26	VGL1063	1202	13	8.801	0.877	0.886	0.011
27	VGL1165	1202	20	5.300	0.763	0.811	0.060
28	VGL1828	1202	12	4.007	0.762	0.750	-0.015
29	VGL2009	1202	9	4.659	0.757	0.785	0.036
30	VGL2409	1202	8	3.780	0.714	0.735	0.029
31	VGL2918	1202	13	5.996	0.826	0.833	0.009
32	VGL3008	1202	12	7.056	0.849	0.858	0.010
33	VGL3235	1202	10	4.442	0.734	0.775	0.053

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1202	12	5.057	0.784	0.802	0.023
2	DLA I-4ACA	1202	12	4.710	0.761	0.788	0.034
3	DLA I-4BCT	1202	8	2.043	0.502	0.511	0.016
4	DLA1131	1202	11	6.671	0.834	0.850	0.019
5	5ACA	1202	6	3.590	0.701	0.721	0.028
6	5ACT	1202	5	2.133	0.502	0.531	0.056
7	5BCA	1202	8	2.710	0.609	0.631	0.035

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media