Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

Updated Jul 10, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Havanese (n=1186)
1003	387 375 277 186	0.0443
1006	387 375 293 180	0.0544
1009	382 377 277 184	0.0004
1011	376 365 281 180	0.0008
1012	388 369 289 188	0.0105
1014	375 373 287 178	0.0181
1016	382 371 277 178	0.1906
1017	386 373 289 178	0.0004
1018	375 373 287 186	0.0067
1019	380 373 287 185	0.0008
1029	380 365 281 182	0.0354
1030	380 373 293 178	0.0025
1033	382 379 277 181	0.0013
1035	386 373 277 184	0.0038
1040	380 371 277 186	0.0152
1052	380 372 289 184	0.0089
1054	382 379 277 184	0.1235
1062	382 371 277 183	0.0004
1068	380 373 287 181	0.0126
1071	380 373 277 178	0.0004
1084	376 373 277 184	0.0013
1087	380 371 277 178	0.0034
1092	376 379 277 181	0.0999
1093	386 379 277 180	0.0135
1105	382 379 277 178	0.0008
1111	387 378 287 182	0.0030
1114	380 373 287 183	0.0164
1115	386 371 277 182	0.0915
1116	380 365 289 186	0.1054
1117	376 373 277 180	0.0476
1118	376 377 277 180	0.0008
1120	376 386 289 176	0.0008
1121	380 371 277 183	0.0046
1123	386 379 277 184	0.0013
1124	388 373 289 178	0.0055
1125	393 383 277 185	0.0211
1128	384 376 287 182	0.0008
1129	382 371 277 181	0.0008
1132	376 379 277 184	0.0013
1133	378 365 287 172	0.0169
1134	384 365 291 178	0.0008
1136	382 371 277 182	0.0004
1140	376 379 301 180	0.0038
1142	376 379 277 180	0.0046
1147	391 375 293 180	0.0025
1148	376 375 277 180	0.0021
1154	376 365 281 183	0.0097
1155	388 369 287 184	0.0004
1173	392 371 277 186	0.0038
1180	386 371 277 181	0.0004
1260	387 379 277 184	0.0004
1262	382 377 289 180	0.0008
1266	378 365 287 181	0.0008
1290	380 369 277 181	0.0008
1300	388 369 260 184	0.0004

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Havanese (n=1186)
2001	343 324 284	0.0489
2003	343 324 282	0.2159
2005	339 322 280	0.0021
2006	339 325 280	0.0013
2007	351 327 280	0.0569
2008	339 327 276	0.0004
2011	345 322 284	0.0004
2012	345 322 280	0.0025
2014	339 322 284	0.0034
2016	339 323 284	0.0257
2017	343 322 280	0.0097
2018	339 324 284	0.0249
2021	339 324 268	0.0046
2022	339 327 282	0.1164
2023	341 323 282	0.0025
2024	343 323 280	0.0038
2028	345 327 288	0.0008
2032	339 323 280	0.0181
2033	339 323 282	0.0013
2035	341 323 280	0.0021
2037	341 327 280	0.0181
2040	345 327 280	0.0038
2053	343 324 280	0.0278
2066	339 324 280	0.1623
2068	339 327 284	0.0004
2070	347 324 282	0.1050
2071	339 322 286	0.0046
2072	339 325 282	0.0164
2073	339 327 286	0.0084
2074	341 324 284	0.0476
2075	341 327 282	0.0363
2076	345 322 282	0.0055
2077	347 325 286	0.0169
2079	343 323 278	0.0008
2082	339 325 268	0.0038
2087	347 324 280	0.0004

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Havanese (n=1186)
1	AHT121	88	0.0004
		92	0.1062
		94	0.0767
		96	0.0021
		98	0.0097
		100	0.0464
		102	0.1058
		104	0.5312
		106	0.0350
		108	0.0822
		110	0.0013
		112	0.0030
2	AHT137	131	0.2336
		133	0.0620
		137	0.0822
		139	0.0396
		141	0.1783
		143	0.1121
		145	0.0080
		147	0.1994
		149	0.0645
		151	0.0194
		155	0.0008
3	AHTH130	117	0.0363
		119	0.2643
		121	0.0493
		123	0.0312
		125	0.3676
		127	0.1872
		129	0.0409
		131	0.0202
		133	0.0030
4	AHTh171-A	217	0.0017
		219	0.1602
		221	0.0013
		225	0.2555
		227	0.0291
		229	0.1872
		231	0.2778
		233	0.0207
		235	0.0388
		237	0.0278
5	AHTh260	238	0.1235
		242	0.0135
		244	0.2340
		246	0.2879
		248	0.2040
		250	0.1054
		252	0.0025
		254	0.0274
		258	0.0017
6	AHTk211	87	0.4747
		89	0.2264
		91	0.1463
		95	0.1417
		97	0.0110
7	AHTk253	284	0.0118
		286	0.0700
		288	0.6421
		290	0.0489
		292	0.2272
8	C22.279	116	0.1037
		118	0.2133
		120	0.0051
		122	0.0169
		124	0.2277
		126	0.1332
		128	0.0008
		130	0.2993
9	FH2001	124	0.0405
		128	0.0089
		132	0.4127
		136	0.0114
		140	0.0110
		144	0.4524
		148	0.0519
		152	0.0097
		158	0.0017
10	FH2054	148	0.0160
		152	0.0831
		156	0.2500
		160	0.1994
		164	0.0881
		168	0.1471
		172	0.1105
		176	0.1024
		180	0.0030
		184	0.0004
11	FH2848	230	0.0139
		232	0.3040
		234	0.0489
		236	0.0826
		238	0.0468
		240	0.2340
		242	0.2601
		244	0.0055
		246	0.0042
12	INRA21	91	0.1362
		95	0.0995
		97	0.3752
		99	0.0506
		101	0.1779
		103	0.1497
		105	0.0110
13	INU005	106	0.0008
		110	0.0308
		122	0.0135
		124	0.5881
		126	0.2175
		128	0.0089
		132	0.0266
		134	0.0038
		138	0.1100
14	INU030	144	0.6336
		146	0.0388
		148	0.0236
		150	0.1277
		152	0.1615
		154	0.0135
		156	0.0013
15	INU055	210	0.3748
		212	0.2057
		214	0.1003
		216	0.1290
		218	0.1847
		222	0.0055
16	LEI004	83	0.0004
		85	0.6412
		93	0.0004
		95	0.2255
		97	0.0135
		101	0.0017
		105	0.0004
		107	0.1096
		109	0.0072
17	REN105L03	227	0.0223
		229	0.0181
		231	0.2091
		233	0.0923
		235	0.0034
		237	0.1901
		239	0.0114
		241	0.4473
		245	0.0059
18	REN162C04	200	0.0350
		202	0.2192
		204	0.0489
		206	0.3967
		208	0.1290
		210	0.1712
19	REN169D01	202	0.0679
		204	0.0008
		210	0.1691
		212	0.0519
		214	0.0270
		216	0.4212
		218	0.0700
		220	0.1922
20	REN169O18	160	0.0700
		162	0.2045
		164	0.0426
		166	0.2327
		168	0.1851
		170	0.2344
		172	0.0308
21	REN247M23	266	0.0004
		268	0.4115
		270	0.1037
		272	0.1644
		274	0.0181
		276	0.2719
		278	0.0299
22	REN54P11	222	0.1682
		226	0.2669
		228	0.1100
		232	0.0906
		234	0.0603
		236	0.0409
		238	0.2631
23	REN64E19	139	0.1425
		143	0.0131
		145	0.0965
		147	0.3116
		149	0.0152
		151	0.0038
		153	0.3992
		155	0.0177
		157	0.0004
24	VGL0760	12	0.0320
		13	0.0611
		14	0.1033
		15	0.0097
		18.2	0.0982
		19.2	0.0025
		20.2	0.0169
		21.2	0.2323
		22.2	0.1707
		23.2	0.1610
		24.2	0.0502
		25.2	0.0291
		26.2	0.0325
		27.2	0.0004
25	VGL0910	13	0.0038
		14	0.0097
		16.1	0.0923
		17	0.0063
		17.1	0.1008
		18	0.0249
		18.1	0.0611
		19.1	0.1695
		20.1	0.0409
		20.3	0.0051
		21.1	0.3153
		22	0.0325
		22.1	0.1062
		23	0.0152
		23.1	0.0164
26	VGL1063	8	0.0236
		12	0.0843
		13	0.0401
		14	0.1981
		15	0.1033
		16	0.0072
		17	0.0868
		18	0.0691
		19	0.0438
		20	0.0860
		21	0.0890
		22	0.1560
		23	0.0126
27	VGL1165	14	0.0008
		15	0.0004
		16	0.0059
		17	0.0291
		18	0.1113
		19	0.0156
		20	0.0291
		21	0.1130
		22	0.0004
		23	0.0249
		25	0.0038
		26	0.3524
		27	0.0708
		28	0.1733
		29	0.0080
		30	0.0114
		31	0.0232
		32	0.0105
		33	0.0152
		34	0.0008
28	VGL1828	15	0.0143
		16	0.3056
		17	0.0051
		18	0.0215
		19	0.0320
		19.3	0.0030
		20	0.1100
		20.3	0.0004
		21	0.3609
		22	0.0641
		23	0.0822
		24	0.0008
29	VGL2009	9	0.0021
		10	0.0025
		11	0.1459
		12	0.0257
		13	0.2146
		14	0.2281
		15	0.2934
		16	0.0864
		17	0.0013
30	VGL2409	14	0.0118
		15	0.0696
		16	0.3280
		17	0.3242
		18	0.2121
		19	0.0030
		20	0.0422
		21	0.0093
31	VGL2918	12	0.0438
		13	0.2829
		14	0.1492
		15	0.0679
		16	0.0110
		16.3	0.0055
		17.3	0.0110
		18.3	0.0666
		19.3	0.0413
		20.3	0.0308
		21.3	0.0666
		22.3	0.2150
		23.3	0.0084
32	VGL3008	10	0.0004
		13	0.1277
		14	0.0084
		15	0.0708
		16	0.0266
		17	0.1100
		18	0.1539
		19	0.1775
		20	0.2032
		21	0.1037
		22	0.0105
		23	0.0072
33	VGL3235	11	0.0105
		12	0.0181
		13	0.1261
		14	0.2770
		15	0.3449
		16	0.0287
		17	0.0396
		18	0.0666
		19	0.0839
		20	0.0046

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1186	9.515	4.477	0.730	0.748	0.023
	SE		0.535	0.268	0.016	0.016	0.004

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Havanese

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1186	8.857	3.833	0.669	0.690	0.032
	SE		0.999	0.599	0.048	0.047	0.005

Standard genetic assessment for individual STR loci

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1186	12	3.117	0.673	0.679	0.009
2	AHT137	1186	11	6.432	0.831	0.845	0.016
3	AHTH130	1186	9	4.051	0.718	0.753	0.047
4	AHTh171-A	1186	10	4.838	0.787	0.793	0.008
5	AHTh260	1186	9	4.840	0.770	0.793	0.030
6	AHTk211	1186	5	3.143	0.652	0.682	0.044
7	AHTk253	1186	5	2.122	0.487	0.529	0.080
8	C22.279	1186	8	4.635	0.757	0.784	0.035
9	FH2001	1186	9	2.633	0.624	0.620	-0.006
10	FH2054	1186	10	6.191	0.831	0.838	0.008
11	FH2848	1186	9	4.416	0.752	0.774	0.028
12	INRA21	1186	7	4.426	0.744	0.774	0.039
13	INU005	1186	9	2.456	0.595	0.593	-0.004
14	INU030	1186	7	2.241	0.545	0.554	0.017
15	INU055	1186	6	4.105	0.729	0.756	0.036
16	LEI004	1186	9	2.108	0.534	0.526	-0.015
17	REN105L03	1186	9	3.454	0.683	0.711	0.039
18	REN162C04	1186	6	3.922	0.729	0.745	0.021
19	REN169D01	1186	8	3.909	0.734	0.744	0.014
20	REN169O18	1186	7	5.186	0.793	0.807	0.017
21	REN247M23	1186	7	3.543	0.703	0.718	0.020
22	REN54P11	1186	7	5.145	0.772	0.806	0.042
23	REN64E19	1186	9	3.487	0.712	0.713	0.002
24	VGL0760	1186	14	7.198	0.851	0.861	0.012
25	VGL0910	1186	15	6.028	0.813	0.834	0.026
26	VGL1063	1186	13	8.826	0.876	0.887	0.012
27	VGL1165	1186	20	5.317	0.762	0.812	0.061
28	VGL1828	1186	12	4.026	0.766	0.752	-0.020
29	VGL2009	1186	9	4.682	0.758	0.786	0.036
30	VGL2409	1186	8	3.781	0.713	0.735	0.030
31	VGL2918	1186	13	5.991	0.826	0.833	0.008
32	VGL3008	1186	12	7.062	0.848	0.858	0.012
33	VGL3235	1186	10	4.427	0.733	0.774	0.054

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Havanese

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1186	12	5.030	0.782	0.801	0.024
2	DLA I-4ACA	1186	12	4.689	0.760	0.787	0.034
3	DLA I-4BCT	1186	8	2.032	0.498	0.508	0.019
4	DLA1131	1186	11	6.656	0.833	0.850	0.020
5	5ACA	1186	6	3.580	0.700	0.721	0.029
6	5ACT	1186	5	2.128	0.498	0.530	0.060
7	5BCA	1186	8	2.714	0.610	0.631	0.035

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Havanese

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media