Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Irish Wolfhound

Updated Apr 16, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

#	Locus Name	Allele	Irish Wolfhound (n=78)
1	AHT121	94	0.321
		96	0.147
		98	0.192
		104	0.301
		106	0.038
2	AHT137	131	0.897
2	AHT137	133	0.103
3	AHTH130	119	0.154
		129	0.833
		139	0.006
		145	0.006
4	AHTh171-A	219	0.609
		225	0.244
		229	0.013
		233	0.077
		235	0.058
5	AHTh260	244	0.865
		246	0.128
		252	0.006
6	AHTk211	87	0.026
		89	0.365
		91	0.538
		95	0.064
		97	0.006
7	AHTk253	284	0.154
		286	0.019
		288	0.231
		292	0.596
8	C22.279	116	0.026
		118	0.321
		120	0.026
		122	0.391
		124	0.237
9	FH2001	132	0.167
		136	0.314
		144	0.128
		148	0.346
		152	0.045
10	FH2054	152	0.013
		156	0.731
		160	0.122
		172	0.135
11	FH2848	232	0.026
		236	0.083
		238	0.455
		240	0.019
		242	0.417
12	INRA21	91	0.058
		99	0.224
		101	0.609
		103	0.109
13	INU005	122	0.135
		124	0.404
		128	0.301
		132	0.160
14	INU030	144	0.865
		146	0.006
		152	0.128
15	INU055	208	0.090
		214	0.359
		218	0.372
		220	0.179
16	LEI004	85	0.276
16	LEI004	95	0.724
17	REN105L03	231	0.167
		233	0.385
		241	0.353
		243	0.096
18	REN162C04	202	0.679
		204	0.308
		206	0.013
19	REN169D01	212	0.064
		216	0.904
		220	0.032
20	REN169O18	162	0.224
		164	0.468
		168	0.256
		170	0.051
21	REN247M23	268	0.327
		270	0.250
		272	0.006
		278	0.417
22	REN54P11	228	0.109
		232	0.038
		236	0.833
		240	0.019
23	REN64E19	145	0.436
		147	0.365
		149	0.192
		153	0.006
24	VGL0760	19.2	0.006
		20.2	0.397
		21.2	0.571
		22.2	0.013
		23.2	0.013
25	VGL0910	16.1	0.090
		17.1	0.853
		18.1	0.058
26	VGL1063	8	0.032
		13	0.160
		14	0.006
		17	0.013
		18	0.641
		19	0.128
		20	0.019
27	VGL1165	15	0.006
		16	0.269
		17	0.013
		18	0.045
		27	0.179
		28	0.006
		29	0.083
		30	0.359
		31	0.038
28	VGL1828	20	0.250
		21	0.154
		22	0.583
		23	0.013
29	VGL2009	9	0.192
		13	0.128
		15	0.673
		16	0.006
30	VGL2409	16	0.019
		17	0.026
		18	0.442
		19	0.455
		20	0.058
31	VGL2918	14	0.006
		19.3	0.006
		20.3	0.449
		21.3	0.455
		22.3	0.058
		23.3	0.026
32	VGL3008	13	0.417
		17	0.564
		18	0.013
		19	0.006
33	VGL3235	12	0.397
		13	0.218
		14	0.071
		16	0.218
		17	0.090
		18	0.006

Irish Wolfhound

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	78	4.333	2.393	0.511	0.525	0.028
	SE		0.233	0.145	0.031	0.030	0.017

Irish Wolfhound

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	78	3.714	2.780	0.559	0.602	0.081
	SE		0.333	0.267	0.058	0.059	0.020

Irish Wolfhound

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	78	5	3.942	0.744	0.746	0.004
2	AHT137	78	2	1.226	0.205	0.184	-0.114
3	AHTH130	78	4	1.392	0.256	0.282	0.090
4	AHTh171-A	78	5	2.275	0.577	0.560	-0.029
5	AHTh260	78	3	1.307	0.244	0.235	-0.038
6	AHTk211	78	5	2.335	0.474	0.572	0.170
7	AHTk253	78	4	2.311	0.615	0.567	-0.085
8	C22.279	78	5	3.193	0.641	0.687	0.067
9	FH2001	78	5	3.778	0.679	0.735	0.076
10	FH2054	78	4	1.763	0.462	0.433	-0.066
11	FH2848	78	5	2.573	0.564	0.611	0.077
12	INRA21	78	4	2.292	0.526	0.564	0.067
13	INU005	78	4	3.359	0.628	0.702	0.106
14	INU030	78	3	1.307	0.192	0.235	0.180
15	INU055	78	4	3.253	0.577	0.693	0.167
16	LEI004	78	2	1.665	0.372	0.399	0.069
17	REN105L03	78	4	3.234	0.756	0.691	-0.095
18	REN162C04	78	3	1.797	0.410	0.443	0.075
19	REN169D01	78	3	1.216	0.167	0.178	0.063
20	REN169O18	78	4	2.961	0.705	0.662	-0.065
21	REN247M23	78	4	2.915	0.654	0.657	0.005
22	REN54P11	78	4	1.412	0.218	0.292	0.253
23	REN64E19	78	4	2.774	0.718	0.639	-0.123
24	VGL0760	78	5	2.067	0.564	0.516	-0.093
25	VGL0910	78	3	1.355	0.295	0.262	-0.127
26	VGL1063	78	7	2.200	0.603	0.545	-0.105
27	VGL1165	78	9	4.094	0.692	0.756	0.084
28	VGL1828	78	4	2.344	0.513	0.573	0.106
29	VGL2009	78	4	1.974	0.487	0.494	0.013
30	VGL2409	78	5	2.456	0.551	0.593	0.070
31	VGL2918	78	6	2.424	0.500	0.587	0.149
32	VGL3008	78	4	2.032	0.487	0.508	0.041
33	VGL3235	78	6	3.759	0.795	0.734	-0.083

Irish Wolfhound

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	78	4	2.696	0.628	0.629	0.001
2	DLA I-4ACA	78	4	3.544	0.654	0.718	0.089
3	DLA I-4BCT	78	4	2.530	0.590	0.605	0.025
4	DLA1131	78	5	3.565	0.667	0.720	0.073
5	5ACA	78	2	1.304	0.192	0.233	0.175
6	5ACT	78	3	2.807	0.564	0.644	0.124
7	5BCA	78	4	3.011	0.615	0.668	0.079