Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Italian Greyhound

Updated Jun 13, 2021

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Italian Greyhound (n=1126)
1008	386 373 289 182	0.1203
1012	388 369 289 188	0.0084
1016	382 371 277 178	0.0613
1030	380 373 293 178	0.0298
1036	389 365 289 180	0.0004
1040	380 371 277 186	0.0804
1044	375 373 291 178	0.2584
1048	380 370 289 184	0.0129
1049	380 370 289 186	0.0004
1050	380 371 289 182	0.0009
1051	380 371 289 184	0.0018
1052	380 372 289 184	0.1838
1053	382 377 277 186	0.1048
1054	382 379 277 184	0.0138
1055	386 373 289 180	0.0004
1056	386 373 289 190	0.0053
1058	387 378 287 186	0.0075
1059	390 371 291 182	0.1035
1065	380 371 277 181	0.0004
1104	386 373 289 186	0.0022
1228	390 373 289 176	0.0018
1235	388 369 289 190	0.0009
1269	375 373 277 186	0.0004

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Italian Greyhound (n=1126)
2003	343 324 282	0.0075
2014	339 322 284	0.0018
2015	339 327 280	0.0089
2017	343 322 280	0.2131
2023	341 323 282	0.0298
2029	337 324 268	0.1035
2030	339 322 268	0.0004
2031	339 322 282	0.0608
2032	339 323 280	0.0386
2033	339 323 282	0.0044
2034	341 322 280	0.2584
2035	341 323 280	0.0835
2036	341 327 276	0.0844
2037	341 327 280	0.0084
2038	345 324 280	0.0080
2039	345 327 276	0.0839
2040	345 327 280	0.0013
2041	349 321 280	0.0004
2044	343 324 268	0.0004
2067	343 322 284	0.0004
2081	343 322 282	0.0004
2102	341 327 268	0.0013

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Italian Greyhound (n=1141)
1	AHT121	94	0.0009
		96	0.1242
		98	0.1375
		100	0.2431
		102	0.2047
		104	0.0460
		106	0.1472
		108	0.0570
		110	0.0146
		112	0.0234
		114	0.0013
2	AHT137	131	0.0689
		133	0.1211
		135	0.0009
		137	0.1101
		141	0.0469
		143	0.4066
		147	0.1890
		151	0.0566
3	AHTH130	119	0.3267
		121	0.2088
		123	0.0009
		127	0.2318
		129	0.0869
		131	0.0350
		133	0.0004
		137	0.1090
		141	0.0004
4	AHTh171-A	219	0.0230
		225	0.0509
		227	0.3115
		233	0.0004
		235	0.0080
		237	0.6027
		241	0.0035
5	AHTh260	238	0.0044
		240	0.3317
		242	0.0004
		244	0.0636
		246	0.2208
		248	0.0013
		250	0.0782
		252	0.0163
		254	0.2827
		256	0.0004
6	AHTk211	87	0.6023
		89	0.0226
		91	0.1621
		95	0.2130
7	AHTk253	286	0.1976
		288	0.5535
		290	0.0645
		292	0.1844
8	C22.279	116	0.0633
		118	0.0093
		124	0.9252
		126	0.0009
		128	0.0013
9	FH2001	132	0.1575
		136	0.0093
		140	0.0022
		144	0.0839
		148	0.7174
		152	0.0293
		156	0.0004
10	FH2054	152	0.0004
		156	0.0302
		160	0.1264
		164	0.0807
		168	0.2702
		172	0.3194
		176	0.1548
		180	0.0155
		184	0.0022
11	FH2848	228	0.0307
		232	0.0189
		234	0.0035
		236	0.0404
		238	0.2019
		240	0.6440
		242	0.0009
		244	0.0597
12	INRA21	95	0.5465
		97	0.1306
		99	0.0062
		101	0.3167
13	INU005	106	0.0155
		120	0.0089
		122	0.0018
		124	0.4588
		126	0.4079
		128	0.0004
		130	0.1027
		132	0.0040
14	INU030	144	0.1398
		148	0.0049
		150	0.8451
		152	0.0102
15	INU055	204	0.0757
		210	0.3004
		214	0.3938
		218	0.2296
		222	0.0004
16	LEI004	95	0.6077
		103	0.0018
		107	0.3825
		109	0.0013
		111	0.0031
		113	0.0035
17	REN105L03	227	0.0487
		229	0.0009
		231	0.2215
		233	0.5456
		239	0.0004
		241	0.1829
18	REN162C04	202	0.2440
		204	0.0337
		206	0.7223
19	REN169D01	202	0.1079
		210	0.1544
		212	0.0232
		214	0.0009
		216	0.3978
		218	0.0004
		220	0.3154
20	REN169O18	162	0.2518
		164	0.0921
		166	0.0189
		168	0.4127
		170	0.2246
21	REN247M23	266	0.0018
		268	0.3123
		270	0.2382
		272	0.1601
		274	0.2504
		276	0.0373
22	REN54P11	222	0.1615
		226	0.0137
		228	0.0407
		232	0.3403
		234	0.0230
		236	0.0004
		238	0.4204
23	REN64E19	139	0.0252
		143	0.4491
		145	0.2801
		147	0.2009
		149	0.0438
		153	0.0009
24	VGL0760	19.2	0.0031
		20.2	0.1978
		21.2	0.4978
		22.2	0.1199
		23.2	0.1695
		24.2	0.0111
		25.2	0.0009
25	VGL0910	13	0.0703
		14	0.0208
		15	0.0190
		16.1	0.0955
		17.1	0.4005
		18.1	0.0619
		19.1	0.2427
		20.1	0.0645
		20.2	0.0009
		21.1	0.0239
26	VGL1063	8	0.1136
		11	0.0035
		12	0.0013
		13	0.2604
		14	0.3687
		15	0.0203
		17	0.0066
		18	0.0641
		19	0.1583
		20	0.0031
27	VGL1165	18	0.0212
		19	0.3298
		20	0.0385
		21	0.0128
		22	0.0009
		23	0.1273
		24	0.0553
		25	0.1680
		26	0.0027
		27	0.0018
		28	0.0018
		29	0.1830
		30	0.0539
		31	0.0031
28	VGL1828	14	0.0084
		15	0.0823
		16	0.0690
		17	0.0951
		18	0.3164
		19	0.3681
		20	0.0239
		21	0.0363
		22	0.0004
29	VGL2009	9	0.1096
		10	0.2396
		11	0.1534
		13	0.4134
		14	0.0756
		15	0.0066
		16	0.0018
30	VGL2409	13	0.0477
		14	0.0009
		15	0.0261
		16	0.0155
		17	0.1366
		18	0.4859
		19	0.2816
		20	0.0057
31	VGL2918	7	0.0128
		12	0.0673
		13	0.1704
		13.2	0.0058
		13.3	0.0004
		14	0.1889
		15	0.0659
		16	0.0009
		17.3	0.0106
		18.3	0.2265
		19.3	0.0465
		20.3	0.1062
		21.3	0.0788
		22.3	0.0084
		23.3	0.0097
		24.3	0.0009
32	VGL3008	15	0.1516
		16	0.1052
		17	0.1888
		18	0.2798
		19	0.2538
		20	0.0168
		21	0.0040
33	VGL3235	13	0.0004
		14	0.2925
		15	0.1301
		16	0.0071
		17	0.3748
		18	0.1748
		19	0.0195
		20	0.0004
		21	0.0004

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Italian Greyhound

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1141	7.455	3.354	0.613	0.650	0.058
	SE		0.483	0.222	0.026	0.027	0.005

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Italian Greyhound

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1141	6.714	3.359	0.653	0.690	0.051
	SE		0.661	0.252	0.021	0.025	0.006

Standard genetic assessment for individual STR loci

Italian Greyhound

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1141	11	6.129	0.794	0.837	0.051
2	AHT137	1141	8	4.202	0.704	0.762	0.076
3	AHTH130	1141	9	4.450	0.759	0.775	0.021
4	AHTh171-A	1141	7	2.158	0.494	0.537	0.080
5	AHTh260	1141	10	4.013	0.680	0.751	0.094
6	AHTk211	1141	4	2.299	0.523	0.565	0.074
7	AHTk253	1141	4	2.607	0.578	0.616	0.062
8	C22.279	1141	5	1.163	0.121	0.140	0.133
9	FH2001	1141	7	1.827	0.428	0.453	0.055
10	FH2054	1141	9	4.491	0.744	0.777	0.042
11	FH2848	1141	8	2.164	0.518	0.538	0.037
12	INRA21	1141	4	2.404	0.553	0.584	0.054
13	INU005	1141	8	2.579	0.605	0.612	0.012
14	INU030	1141	4	1.363	0.252	0.266	0.052
15	INU055	1141	5	3.292	0.619	0.696	0.110
16	LEI004	1141	6	1.939	0.492	0.484	-0.016
17	REN105L03	1141	6	2.614	0.587	0.617	0.050
18	REN162C04	1141	3	1.717	0.392	0.418	0.060
19	REN169D01	1141	7	3.405	0.654	0.706	0.073
20	REN169O18	1141	5	3.413	0.646	0.707	0.086
21	REN247M23	1141	6	4.099	0.721	0.756	0.046
22	REN54P11	1141	7	3.116	0.650	0.679	0.042
23	REN64E19	1141	6	3.095	0.675	0.677	0.003
24	VGL0760	1141	7	3.029	0.609	0.670	0.091
25	VGL0910	1141	10	4.119	0.740	0.757	0.023
26	VGL1063	1141	10	4.060	0.728	0.754	0.035
27	VGL1165	1141	14	5.134	0.784	0.805	0.026
28	VGL1828	1141	9	3.873	0.677	0.742	0.087
29	VGL2009	1141	7	3.709	0.667	0.730	0.087
30	VGL2409	1141	8	2.965	0.619	0.663	0.066
31	VGL2918	1141	16	6.895	0.805	0.855	0.058
32	VGL3008	1141	7	4.701	0.748	0.787	0.050
33	VGL3235	1141	9	3.651	0.654	0.726	0.099

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Italian Greyhound

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1141	8	4.478	0.729	0.777	0.061
2	DLA I-4ACA	1141	9	3.546	0.691	0.718	0.037
3	DLA I-4BCT	1141	5	3.170	0.647	0.685	0.055
4	DLA1131	1141	9	3.908	0.684	0.744	0.080
5	5ACA	1141	6	3.346	0.666	0.701	0.050
6	5ACT	1141	5	2.771	0.610	0.639	0.045
7	5BCA	1141	5	2.295	0.547	0.564	0.031

Veterinary Genetics Laboratory

Vet Med Links +

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Italian Greyhound

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Italian Greyhound

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media