Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Aug 9, 2020

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=3257)
1001	380 373 281 182	0.2728
1002	380 365 281 181	0.1701
1003	387 375 277 186	0.1710
1004	393 379 277 183	0.0877
1005	389 371 277 181	0.0611
1006	387 375 293 180	0.0467
1007	380 372 281 182	0.0336
1008	386 373 289 182	0.0149
1009	382 377 277 184	0.0166
1010	384 371 277 186	0.0107
1011	376 365 281 180	0.0187
1012	388 369 289 188	0.0095
1013	392 373 289 186	0.0106
1014	375 373 287 178	0.0097
1015	380 373 291 186	0.0021
1016	382 371 277 178	0.0198
1017	386 373 289 178	0.0031
1018	375 373 287 186	0.0072
1019	380 373 287 185	0.0029
1020	388 369 289 184	0.0045
1021	380 373 289 186	0.0025
1022	380 375 281 181	0.0002
1023	380 379 281 181	0.0002
1024	387 373 281 182	0.0002
1025	380 365 281 186	0.0003
1026	390 369 289 186	0.0014
1027	391 371 277 181	0.0008
1028	376 369 291 186	0.0012
1029	380 365 281 182	0.0025
1030	380 373 293 178	0.0025
1031	382 371 277 186	0.0014
1032	382 377 277 178	0.0002
1033	382 379 277 181	0.0018
1034	382 379 277 182	0.0002
1035	386 373 277 184	0.0002
1036	389 365 289 180	0.0021
1040	380 371 277 186	0.0005
1043	393 381 277 183	0.0017
1045	376 371 277 186	0.0011
1046	376 379 291 180	0.0003
1053	382 377 277 186	0.0003
1092	376 379 277 181	0.0002
1102	389 375 293 180	0.0002
1103	389 375 293 181	0.0003
1105	382 379 277 178	0.0026
1106	395 379 277 178	0.0002
1134	384 365 291 178	0.0002
1141	380 365 281 180	0.0003
1169	380 365 277 180	0.0011
1220	387 375 277 178	0.0002
1225	387 374 287 186	0.0002
1234	380 371 281 181	0.0003

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=3257)
2001	343 324 284	0.6088
2002	343 327 280	0.0892
2003	343 324 282	0.0909
2004	351 327 268	0.0301
2005	339 322 280	0.0181
2006	339 325 280	0.0336
2007	351 327 280	0.0158
2008	339 327 276	0.0166
2009	351 324 280	0.0115
2010	345 329 280	0.0107
2011	345 322 284	0.0189
2012	345 322 280	0.0049
2013	345 327 284	0.0097
2014	339 322 284	0.0184
2015	339 327 280	0.0057
2016	339 323 284	0.0029
2017	343 322 280	0.0025
2019	345 324 284	0.0002
2020	349 324 284	0.0003
2021	339 324 268	0.0029
2022	339 327 282	0.0002
2023	341 323 282	0.0025
2024	343 323 280	0.0002
2025	351 321 280	0.0021
2026	351 324 284	0.0011
2028	345 327 288	0.0005
2035	341 323 280	0.0002
2039	345 327 276	0.0009
2040	345 327 280	0.0002
2066	339 324 280	0.0002
2101	341 324 280	0.0003
2115	343 327 284	0.0002

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=3259)
1	AHT121	92	0.0115
		94	0.0229
		96	0.0146
		98	0.3290
		100	0.0881
		102	0.0046
		104	0.1880
		106	0.0743
		108	0.1819
		110	0.0641
		112	0.0207
		114	0.0003
2	AHT137	131	0.2363
		133	0.0094
		135	0.0002
		137	0.1671
		139	0.0005
		141	0.3762
		143	0.0110
		145	0.0494
		147	0.0548
		149	0.0025
		151	0.0927
3	AHTH130	111	0.0162
		117	0.0014
		119	0.3950
		121	0.1371
		123	0.0835
		125	0.0002
		127	0.1225
		129	0.2109
		131	0.0158
		133	0.0140
		135	0.0035
4	AHTh171-A	217	0.0081
		219	0.3646
		221	0.2436
		223	0.0075
		225	0.1519
		227	0.0078
		229	0.0454
		231	0.0181
		233	0.0009
		235	0.1341
		237	0.0178
5	AHTh260	238	0.5800
		240	0.0261
		242	0.0003
		244	0.0474
		246	0.1996
		248	0.0656
		250	0.0307
		252	0.0375
		254	0.0040
		256	0.0089
6	AHTk211	87	0.1829
		89	0.0391
		91	0.6700
		93	0.0018
		95	0.1059
		97	0.0002
7	AHTk253	280	0.0134
		284	0.1289
		286	0.0996
		288	0.4110
		290	0.2204
		292	0.1266
		296	0.0002
8	C22.279	116	0.0777
		118	0.4059
		120	0.0037
		124	0.3709
		126	0.0565
		128	0.0261
		130	0.0591
		134	0.0002
9	FH2001	124	0.0170
		132	0.4314
		136	0.0594
		140	0.0220
		144	0.2443
		148	0.2128
		152	0.0114
		158	0.0017
10	FH2054	148	0.0103
		152	0.0305
		156	0.5539
		160	0.0166
		164	0.0023
		168	0.2929
		172	0.0834
		176	0.0095
		180	0.0006
11	FH2848	230	0.0118
		232	0.0187
		234	0.0121
		236	0.0481
		238	0.1296
		240	0.6963
		242	0.0831
		244	0.0002
		246	0.0002
12	INRA21	91	0.3714
		93	0.0002
		95	0.4075
		97	0.0421
		99	0.0545
		101	0.1034
		103	0.0055
		105	0.0137
		109	0.0018
13	INU005	110	0.0169
		120	0.0002
		122	0.0002
		124	0.5127
		126	0.4550
		128	0.0025
		130	0.0095
		132	0.0003
		138	0.0028
14	INU030	144	0.3184
		146	0.1447
		148	0.0614
		150	0.0864
		152	0.3878
		154	0.0008
		156	0.0003
		158	0.0002
15	INU055	208	0.0011
		210	0.2182
		212	0.0582
		214	0.3005
		216	0.3743
		218	0.0344
		220	0.0115
		222	0.0018
16	LEI004	85	0.6641
		95	0.0941
		97	0.0014
		105	0.0011
		107	0.2072
		109	0.0322
17	REN105L03	227	0.0091
		231	0.2660
		233	0.2000
		235	0.0049
		237	0.0137
		239	0.0115
		241	0.4945
		243	0.0005
18	REN162C04	200	0.0207
		202	0.1729
		204	0.0593
		206	0.5573
		208	0.0893
		210	0.0651
		212	0.0355
19	REN169D01	202	0.0072
		210	0.0012
		212	0.0739
		214	0.0015
		216	0.4142
		218	0.2693
		220	0.0017
		222	0.0408
		224	0.1711
		226	0.0189
20	REN169O18	156	0.0005
		160	0.0335
		162	0.5861
		164	0.3095
		166	0.0126
		168	0.0236
		170	0.0262
		172	0.0080
21	REN247M23	266	0.0397
		268	0.5149
		270	0.2314
		272	0.2073
		274	0.0029
		278	0.0037
22	REN54P11	222	0.0018
		226	0.2545
		228	0.1797
		230	0.0020
		232	0.3378
		234	0.2121
		236	0.0038
		238	0.0077
		242	0.0006
23	REN64E19	139	0.0015
		143	0.0072
		145	0.4173
		147	0.2580
		149	0.0342
		153	0.2591
		155	0.0227
24	VGL0760	12	0.3015
		13	0.0011
		14	0.0134
		15	0.0120
		18	0.0012
		19	0.0852
		19.2	0.1279
		20	0.0356
		20.2	0.1707
		21	0.0020
		21.2	0.0513
		22.2	0.0150
		23.2	0.1076
		24.2	0.0596
		25.2	0.0157
		26.2	0.0003
25	VGL0910	12	0.0008
		13	0.0488
		14	0.0157
		15	0.0138
		15.1	0.0114
		16	0.0002
		16.1	0.0055
		17.1	0.1080
		18.1	0.2810
		19	0.0002
		19.1	0.1383
		20.1	0.0338
		21.1	0.2776
		22	0.0075
		22.1	0.0201
		23	0.0308
		23.1	0.0058
		24	0.0008
26	VGL1063	8	0.0209
		9	0.0034
		10	0.0002
		11	0.0015
		12	0.0312
		13	0.1579
		14	0.1406
		15	0.0677
		16	0.1056
		17	0.0342
		18	0.0445
		19	0.3109
		20	0.0411
		21	0.0279
		22	0.0098
		23	0.0025
		24	0.0002
27	VGL1165	13	0.0002
		14	0.0002
		15	0.0060
		16	0.0457
		17	0.0011
		18	0.0137
		19	0.0103
		20	0.0011
		21	0.0829
		22	0.0017
		23	0.0031
		24	0.0172
		25	0.1128
		25.3	0.0002
		26	0.4751
		27	0.1093
		28	0.1116
		29	0.0032
		30	0.0041
		31	0.0002
		32	0.0005
		34	0.0002
28	VGL1828	14	0.0338
		15	0.0005
		16	0.0468
		17	0.0193
		18	0.0890
		19	0.4452
		20	0.3200
		21	0.0399
		22	0.0054
		23	0.0002
29	VGL2009	9	0.4378
		10	0.0049
		11	0.0350
		12	0.0470
		13	0.2479
		14	0.1957
		15	0.0316
		16	0.0002
30	VGL2409	13	0.0322
		14	0.2607
		15	0.2002
		16	0.1443
		17	0.1944
		18	0.1397
		19	0.0278
		20	0.0005
31	VGL2918	7	0.0002
		12	0.0072
		13	0.1048
		14	0.2069
		15	0.1680
		16	0.0465
		16.3	0.0011
		17	0.0025
		17.3	0.0316
		18.3	0.0180
		19.3	0.1149
		20.3	0.1223
		21.3	0.1389
		22.3	0.0342
		23.3	0.0029
32	VGL3008	12	0.0002
		13	0.0081
		14	0.0353
		15	0.2281
		16	0.0302
		17	0.5221
		18	0.0226
		18.2	0.0002
		19	0.1280
		20	0.0229
		21	0.0025
33	VGL3235	12	0.1562
		13	0.0471
		14	0.1440
		15	0.0347
		16	0.3181
		17	0.2290
		18	0.0698
		19	0.0011

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

		N	Na	Ne	Ho	He	F
Poodle	Mean	3259	10.000	3.664	0.673	0.695	0.032
	SE		0.637	0.225	0.018	0.017	0.004

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

		N	Na	Ne	Ho	He	F
Poodle	Mean	3259	8.286	2.928	0.577	0.599	0.038
	SE		1.044	0.449	0.058	0.058	0.008

Standard genetic assessment for individual STR loci

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	3259	12	5.118	0.777	0.805	0.034
2	AHT137	3259	11	4.175	0.740	0.760	0.027
3	AHTH130	3259	11	4.132	0.727	0.758	0.041
4	AHTh171-A	3259	11	4.233	0.755	0.764	0.011
5	AHTh260	3259	10	2.592	0.585	0.614	0.048
6	AHTk211	3259	6	2.020	0.466	0.505	0.076
7	AHTk253	3259	7	3.843	0.736	0.740	0.005
8	C22.279	3259	8	3.167	0.696	0.684	-0.016
9	FH2001	3259	8	3.384	0.684	0.705	0.029
10	FH2054	3259	9	2.494	0.601	0.599	-0.004
11	FH2848	3259	9	1.955	0.460	0.488	0.058
12	INRA21	3259	9	3.129	0.669	0.680	0.016
13	INU005	3259	9	2.126	0.510	0.530	0.036
14	INU030	3259	8	3.521	0.697	0.716	0.026
15	INU055	3259	8	3.537	0.702	0.717	0.021
16	LEI004	3259	6	2.025	0.504	0.506	0.004
17	REN105L03	3259	8	2.812	0.610	0.644	0.053
18	REN162C04	3259	7	2.795	0.607	0.642	0.055
19	REN169D01	3259	10	3.560	0.673	0.719	0.064
20	REN169O18	3259	8	2.263	0.519	0.558	0.071
21	REN247M23	3259	6	2.753	0.617	0.637	0.032
22	REN54P11	3259	9	3.903	0.706	0.744	0.051
23	REN64E19	3259	7	3.231	0.671	0.690	0.029
24	VGL0760	3259	16	6.117	0.823	0.837	0.016
25	VGL0910	3259	18	5.198	0.797	0.808	0.013
26	VGL1063	3259	17	6.088	0.812	0.836	0.028
27	VGL1165	3259	22	3.670	0.692	0.728	0.048
28	VGL1828	3259	10	3.186	0.659	0.686	0.039
29	VGL2009	3259	8	3.380	0.664	0.704	0.058
30	VGL2409	3259	8	5.317	0.792	0.812	0.024
31	VGL2918	3259	15	7.451	0.850	0.866	0.019
32	VGL3008	3259	11	2.905	0.649	0.656	0.010
33	VGL3235	3259	8	4.829	0.766	0.793	0.035

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	3259	14	3.281	0.674	0.695	0.030
2	DLA I-4ACA	3259	10	4.688	0.766	0.787	0.026
3	DLA I-4BCT	3259	6	2.513	0.583	0.602	0.031
4	DLA1131	3259	9	4.560	0.760	0.781	0.027
5	5ACA	3259	6	1.557	0.346	0.358	0.033
6	5ACT	3259	7	1.829	0.441	0.453	0.028
7	5BCA	3259	6	2.065	0.469	0.516	0.090

Veterinary Genetics Laboratory

Vet Med Links +

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media