Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Oct 4, 2023

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=5177)
1001	380 373 281 182	0.26656
1002	380 365 281 181	0.15965
1003	387 375 277 186	0.17500
1004	393 379 277 183	0.08432
1005	389 371 277 181	0.06732
1006	387 375 293 180	0.04752
1007	380 372 281 182	0.03438
1008	386 373 289 182	0.01304
1009	382 377 277 184	0.01478
1010	384 371 277 186	0.01120
1011	376 365 281 180	0.01980
1012	388 369 289 188	0.01478
1013	392 373 289 186	0.00898
1014	375 373 287 178	0.01111
1015	380 373 291 186	0.00135
1016	382 371 277 178	0.02173
1017	386 373 289 178	0.00261
1018	375 373 287 186	0.00918
1019	380 373 287 185	0.00319
1020	388 369 289 184	0.00309
1021	380 373 289 186	0.00184
1022	380 375 281 181	0.00010
1023	380 379 281 181	0.00010
1024	387 373 281 182	0.00010
1025	380 365 281 186	0.00019
1026	390 369 289 186	0.00357
1027	391 371 277 181	0.00048
1028	376 369 291 186	0.00097
1029	380 365 281 182	0.00164
1030	380 373 293 178	0.00212
1031	382 371 277 186	0.00126
1032	382 377 277 178	0.00010
1033	382 379 277 181	0.00338
1034	382 379 277 182	0.00048
1035	386 373 277 184	0.00010
1036	389 365 289 180	0.00164
1040	380 371 277 186	0.00058
1043	393 381 277 183	0.00135
1045	376 371 277 186	0.00068
1046	376 379 291 180	0.00029
1052	380 372 289 184	0.00029
1053	382 377 277 186	0.00019
1054	382 379 277 184	0.00019
1065	380 371 277 181	0.00019
1069	380 365 281 184	0.00010
1084	376 373 277 184	0.00029
1092	376 379 277 181	0.00019
1093	386 379 277 180	0.00048
1102	389 375 293 180	0.00010
1103	389 375 293 181	0.00019
1105	382 379 277 178	0.00357
1106	395 379 277 178	0.00010
1107	376 375 293 183	0.00010
1109	381 379 291 186	0.00097
1111	387 378 287 182	0.00010
1130	380 373 287 178	0.00010
1134	384 365 291 178	0.00019
1141	380 365 281 180	0.00019
1168	382 379 289 186	0.00010
1169	380 365 277 180	0.00106
1225	387 374 287 186	0.00010
1234	380 371 281 181	0.00019
1265	387 375 277 184	0.00010
1270	376 365 281 181	0.00010
1271	387 375 277 181	0.00019
1279	393 379 277 186	0.00010

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=5177)
2001	343 324 284	0.59967
2002	343 327 280	0.08557
2003	343 324 282	0.10402
2004	351 327 268	0.02917
2005	339 322 280	0.01594
2006	339 325 280	0.03438
2007	351 327 280	0.01661
2008	339 327 276	0.01487
2009	351 324 280	0.00763
2010	345 329 280	0.01120
2011	345 322 284	0.01990
2012	345 322 280	0.00715
2013	345 327 284	0.01062
2014	339 322 284	0.01999
2015	339 327 280	0.00415
2016	339 323 284	0.00328
2017	343 322 280	0.00212
2019	345 324 284	0.00010
2020	349 324 284	0.00019
2021	339 324 268	0.00367
2022	339 327 282	0.00048
2023	341 323 282	0.00212
2024	343 323 280	0.00058
2025	351 321 280	0.00164
2026	351 324 284	0.00097
2028	345 327 288	0.00058
2032	339 323 280	0.00048
2035	341 323 280	0.00010
2037	341 327 280	0.00048
2039	345 327 276	0.00058
2040	345 327 280	0.00010
2048	339 331 282	0.00019
2050	341 327 284	0.00010
2064	351 327 284	0.00097
2066	339 324 280	0.00010
2101	341 324 280	0.00019
2115	343 327 284	0.00010

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=5178)
1	AHT121	92	0.01197
		94	0.02231
		96	0.01236
		98	0.31788
		100	0.08642
		102	0.00637
		104	0.19699
		106	0.08217
		108	0.17323
		110	0.06672
		112	0.02337
		114	0.00019
2	AHT137	131	0.23035
		133	0.01043
		135	0.00039
		137	0.17549
		139	0.00048
		141	0.36836
		143	0.01275
		145	0.04732
		147	0.05563
		149	0.00222
		151	0.09639
		153	0.00019
3	AHTH130	111	0.01694
		117	0.00255
		119	0.38504
		121	0.13866
		123	0.07834
		125	0.00078
		127	0.13141
		129	0.21553
		131	0.01586
		133	0.01263
		135	0.00225
4	AHTh171-A	217	0.00637
		219	0.36694
		221	0.23436
		223	0.00647
		225	0.14484
		227	0.00917
		229	0.04934
		231	0.02057
		233	0.00116
		235	0.14059
		237	0.02018
5	AHTh260	238	0.57119
		240	0.02850
		242	0.00029
		244	0.05844
		246	0.19030
		248	0.06520
		250	0.03468
		252	0.03700
		254	0.00589
		256	0.00850
6	AHTk211	87	0.18308
		89	0.03959
		91	0.67343
		93	0.00367
		95	0.10004
		97	0.00019
7	AHTk253	280	0.00946
		284	0.12939
		286	0.11356
		288	0.40711
		290	0.21456
		292	0.12534
		296	0.00058
8	C22.279	116	0.07937
		118	0.39919
		120	0.00425
		124	0.36027
		126	0.06769
		128	0.02153
		130	0.06759
		134	0.00010
9	FH2001	124	0.02019
		132	0.42224
		136	0.07129
		140	0.01797
		144	0.24179
		148	0.21252
		152	0.01275
		158	0.00126
10	FH2054	148	0.01053
		152	0.03110
		156	0.55003
		160	0.01719
		164	0.00290
		168	0.29660
		172	0.07949
		176	0.01111
		180	0.00106
11	FH2848	230	0.01517
		232	0.01613
		234	0.01140
		236	0.05323
		238	0.13804
		240	0.68789
		242	0.07757
		244	0.00019
		246	0.00039
12	INRA21	91	0.35409
		93	0.00010
		95	0.40295
		97	0.04732
		99	0.05630
		101	0.11452
		103	0.00763
		105	0.01419
		109	0.00290
13	INU005	110	0.01941
		120	0.00010
		122	0.00058
		124	0.51497
		126	0.44892
		128	0.00183
		130	0.01149
		132	0.00029
		138	0.00241
14	INU030	144	0.31837
		146	0.14938
		148	0.06499
		150	0.08729
		152	0.37881
		154	0.00077
		156	0.00029
		158	0.00010
15	INU055	208	0.00164
		210	0.21871
		212	0.06074
		214	0.29616
		216	0.36839
		218	0.03843
		220	0.01458
		222	0.00135
16	LEI004	85	0.65556
		95	0.09917
		97	0.00454
		105	0.00077
		107	0.20857
		109	0.03138
17	REN105L03	227	0.00995
		231	0.27545
		233	0.20089
		235	0.00715
		237	0.01497
		239	0.01198
		241	0.47933
		243	0.00029
18	REN162C04	200	0.02048
		202	0.17172
		204	0.06558
		206	0.54636
		208	0.09079
		210	0.06587
		212	0.03921
19	REN169D01	202	0.00929
		210	0.00126
		212	0.07094
		214	0.00097
		216	0.40786
		218	0.26278
		220	0.00184
		222	0.04897
		224	0.17383
		226	0.02226
20	REN169O18	156	0.00135
		160	0.03380
		162	0.57089
		164	0.31398
		166	0.01536
		168	0.02366
		170	0.03255
		172	0.00840
21	REN247M23	266	0.03438
		268	0.52260
		270	0.23585
		272	0.20012
		274	0.00251
		278	0.00454
22	REN54P11	222	0.00183
		226	0.26574
		228	0.16889
		230	0.00338
		232	0.33420
		234	0.21128
		236	0.00435
		238	0.00956
		242	0.00077
23	REN64E19	139	0.00222
		143	0.00541
		145	0.42410
		147	0.24778
		149	0.03418
		153	0.25888
		155	0.02742
24	VGL0760	12	0.29737
		13	0.00116
		14	0.01468
		15	0.00869
		18	0.00164
		19	0.08683
		19.2	0.13724
		20	0.03602
		20.2	0.16216
		21	0.00135
		21.2	0.05128
		22.2	0.01642
		23.2	0.11010
		24.2	0.05988
		25.2	0.01468
		26.2	0.00048
25	VGL0910	12	0.00048
		13	0.04780
		14	0.01728
		15	0.01931
		15.1	0.01603
		16	0.00019
		16.1	0.00512
		17.1	0.10525
		18.1	0.27462
		19	0.00010
		19.1	0.12968
		20.1	0.03998
		21.1	0.27935
		22	0.00753
		22.1	0.02163
		23	0.03051
		23.1	0.00396
		24	0.00116
26	VGL1063	8	0.02733
		9	0.00241
		10	0.00010
		11	0.00145
		12	0.03467
		13	0.15856
		14	0.13924
		15	0.08430
		16	0.09946
		17	0.03071
		18	0.04413
		19	0.30137
		20	0.04249
		21	0.02520
		22	0.00686
		23	0.00164
		24	0.00010
27	VGL1165	13	0.00010
		14	0.00010
		15	0.00676
		16	0.04316
		17	0.00328
		18	0.01777
		19	0.00946
		20	0.00077
		21	0.07918
		22	0.00309
		23	0.00270
		24	0.01584
		25	0.11375
		25.3	0.00010
		26	0.47721
		27	0.10941
		28	0.10941
		29	0.00241
		30	0.00425
		31	0.00087
		32	0.00029
		34	0.00010
28	VGL1828	14	0.03737
		15	0.00048
		16	0.04751
		17	0.02182
		18	0.08710
		19	0.42835
		20	0.33642
		21	0.03428
		22	0.00657
		23	0.00010
29	VGL2009	9	0.45124
		10	0.00589
		11	0.03525
		12	0.04799
		13	0.24401
		14	0.18743
		15	0.02800
		16	0.00019
30	VGL2409	13	0.03922
		14	0.26265
		15	0.18943
		16	0.15224
		17	0.19513
		18	0.13727
		19	0.02357
		20	0.00048
31	VGL2918	7	0.00010
		12	0.00521
		13	0.11143
		14	0.20761
		15	0.15827
		16	0.04316
		16.3	0.00145
		17	0.00222
		17.3	0.03283
		18.3	0.02192
		19.3	0.11636
		20.3	0.11906
		21.3	0.14195
		22.3	0.03525
		23.3	0.00319
32	VGL3008	12	0.00010
		13	0.01120
		14	0.03505
		15	0.23397
		16	0.03776
		17	0.50183
		18	0.02462
		18.2	0.00019
		19	0.12949
		20	0.02356
		21	0.00212
		23	0.00010
33	VGL3235	12	0.15353
		13	0.04886
		14	0.15604
		15	0.04587
		16	0.30427
		17	0.22132
		18	0.06924
		19	0.00087

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5178	10.061	3.728	0.680	0.700	0.030
	SE		0.641	0.228	0.017	0.017	0.003

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5178	8.714	2.990	0.583	0.604	0.035
	SE		1.173	0.465	0.057	0.059	0.006

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	5178	12	5.265	0.793	0.810	0.021
2	AHT137	5178	12	4.265	0.752	0.766	0.018
3	AHTH130	5178	11	4.201	0.732	0.762	0.040
4	AHTh171-A	5178	11	4.278	0.756	0.766	0.014
5	AHTh260	5178	10	2.676	0.607	0.626	0.031
6	AHTk211	5178	6	2.006	0.468	0.501	0.066
7	AHTk253	5178	7	3.888	0.735	0.743	0.011
8	C22.279	5178	8	3.278	0.707	0.695	-0.018
9	FH2001	5178	8	3.474	0.691	0.712	0.029
10	FH2054	5178	9	2.510	0.598	0.602	0.006
11	FH2848	5178	9	1.993	0.473	0.498	0.050
12	INRA21	5178	9	3.262	0.672	0.693	0.031
13	INU005	5178	9	2.140	0.510	0.533	0.043
14	INU030	5178	8	3.584	0.693	0.721	0.038
15	INU055	5178	8	3.615	0.712	0.723	0.016
16	LEI004	5178	6	2.066	0.514	0.516	0.004
17	REN105L03	5178	8	2.886	0.620	0.653	0.052
18	REN162C04	5178	7	2.883	0.620	0.653	0.050
19	REN169D01	5178	10	3.654	0.692	0.726	0.048
20	REN169O18	5178	8	2.339	0.546	0.572	0.045
21	REN247M23	5178	6	2.703	0.604	0.630	0.041
22	REN54P11	5178	9	3.912	0.700	0.744	0.060
23	REN64E19	5178	7	3.223	0.669	0.690	0.030
24	VGL0760	5178	16	6.191	0.829	0.838	0.012
25	VGL0910	5178	18	5.329	0.806	0.812	0.008
26	VGL1063	5178	17	6.262	0.817	0.840	0.028
27	VGL1165	5178	22	3.656	0.688	0.727	0.052
28	VGL1828	5178	10	3.230	0.669	0.690	0.032
29	VGL2009	5178	8	3.304	0.661	0.697	0.052
30	VGL2409	5178	8	5.346	0.805	0.813	0.009
31	VGL2918	5178	15	7.511	0.857	0.867	0.011
32	VGL3008	5178	12	3.055	0.661	0.673	0.018
33	VGL3235	5178	8	5.031	0.774	0.801	0.034

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	5178	15	3.445	0.687	0.710	0.032
2	DLA I-4ACA	5178	11	4.802	0.772	0.792	0.024
3	DLA I-4BCT	5178	6	2.560	0.587	0.609	0.037
4	DLA1131	5178	9	4.643	0.758	0.785	0.034
5	5ACA	5178	6	1.556	0.352	0.357	0.016
6	5ACT	5178	8	1.831	0.442	0.454	0.027
7	5BCA	5178	6	2.090	0.484	0.522	0.072

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media