Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Jul 26, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=5480)
1001	380 373 281 182	0.26496
1002	380 365 281 181	0.16004
1003	387 375 277 186	0.17409
1004	393 379 277 183	0.08522
1005	389 371 277 181	0.06898
1006	387 375 293 180	0.04909
1007	380 372 281 182	0.03358
1008	386 373 289 182	0.01268
1009	382 377 277 184	0.01496
1010	384 371 277 186	0.01113
1011	376 365 281 180	0.01943
1012	388 369 289 188	0.01478
1013	392 373 289 186	0.00867
1014	375 373 287 178	0.01086
1015	380 373 291 186	0.00128
1016	382 371 277 178	0.02089
1017	386 373 289 178	0.00246
1018	375 373 287 186	0.00976
1019	380 373 287 185	0.00301
1020	388 369 289 184	0.00292
1021	380 373 289 186	0.00173
1022	380 375 281 181	0.00009
1023	380 379 281 181	0.00009
1024	387 373 281 182	0.00009
1025	380 365 281 186	0.00018
1026	390 369 289 186	0.00338
1027	391 371 277 181	0.00046
1028	376 369 291 186	0.00109
1029	380 365 281 182	0.00164
1030	380 373 293 178	0.00219
1031	382 371 277 186	0.00128
1032	382 377 277 178	0.00009
1033	382 379 277 181	0.00338
1034	382 379 277 182	0.00055
1035	386 373 277 184	0.00009
1036	389 365 289 180	0.00164
1040	380 371 277 186	0.00055
1043	393 381 277 183	0.00146
1045	376 371 277 186	0.00064
1046	376 379 291 180	0.00036
1052	380 372 289 184	0.00036
1053	382 377 277 186	0.00018
1054	382 379 277 184	0.00018
1065	380 371 277 181	0.00018
1069	380 365 281 184	0.00009
1084	376 373 277 184	0.00027
1092	376 379 277 181	0.00018
1093	386 379 277 180	0.00046
1102	389 375 293 180	0.00009
1103	389 375 293 181	0.00018
1105	382 379 277 178	0.00374
1106	395 379 277 178	0.00009
1107	376 375 293 183	0.00018
1109	381 379 291 186	0.00155
1111	387 378 287 182	0.00009
1130	380 373 287 178	0.00009
1134	384 365 291 178	0.00018
1141	380 365 281 180	0.00018
1168	382 379 289 186	0.00018
1169	380 365 277 180	0.00100
1225	387 374 287 186	0.00009
1234	380 371 281 181	0.00018
1265	387 375 277 184	0.00009
1270	376 365 281 181	0.00009
1271	387 375 277 181	0.00018
1279	393 379 277 186	0.00009

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=5480)
2001	343 324 284	0.59781
2002	343 327 280	0.08659
2003	343 324 282	0.10611
2004	351 327 268	0.03002
2005	339 322 280	0.01542
2006	339 325 280	0.03358
2007	351 327 280	0.01734
2008	339 327 276	0.01505
2009	351 324 280	0.00721
2010	345 329 280	0.01113
2011	345 322 284	0.01953
2012	345 322 280	0.00748
2013	345 327 284	0.01040
2014	339 322 284	0.01907
2015	339 327 280	0.00411
2016	339 323 284	0.00319
2017	343 322 280	0.00210
2019	345 324 284	0.00009
2020	349 324 284	0.00018
2021	339 324 268	0.00383
2022	339 327 282	0.00046
2023	341 323 282	0.00219
2024	343 323 280	0.00064
2025	351 321 280	0.00164
2026	351 324 284	0.00100
2028	345 327 288	0.00055
2032	339 323 280	0.00046
2035	341 323 280	0.00009
2037	341 327 280	0.00046
2039	345 327 276	0.00055
2040	345 327 280	0.00009
2048	339 331 282	0.00018
2050	341 327 284	0.00009
2053	343 324 280	0.00009
2064	351 327 284	0.00091
2066	339 324 280	0.00009
2101	341 324 280	0.00018
2115	343 327 284	0.00009

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=5483)
1	AHT121	92	0.01240
		94	0.02235
		96	0.01268
		98	0.31576
		100	0.08637
		102	0.00629
		104	0.19719
		106	0.08327
		108	0.17256
		110	0.06722
		112	0.02317
		114	0.00064
		116	0.00009
2	AHT137	131	0.23121
		133	0.01003
		135	0.00046
		137	0.17512
		139	0.00046
		141	0.36775
		143	0.01304
		145	0.04670
		147	0.05792
		149	0.00228
		151	0.09486
		153	0.00018
3	AHTH130	111	0.01673
		117	0.00240
		119	0.38191
		121	0.14064
		123	0.07845
		125	0.00120
		127	0.13260
		129	0.21632
		131	0.01525
		133	0.01238
		135	0.00213
4	AHTh171-A	217	0.00620
		219	0.36848
		221	0.23285
		223	0.00629
		225	0.14247
		227	0.00903
		229	0.04953
		231	0.02162
		233	0.00146
		235	0.14256
		237	0.01952
5	AHTh260	238	0.57344
		240	0.03047
		242	0.00027
		244	0.05784
		246	0.18883
		248	0.06440
		250	0.03403
		252	0.03631
		254	0.00629
		256	0.00812
6	AHTk211	87	0.18415
		89	0.03904
		91	0.67275
		93	0.00392
		95	0.09996
		97	0.00018
7	AHTk253	280	0.00903
		284	0.12888
		286	0.11447
		288	0.40505
		290	0.21361
		292	0.12824
		296	0.00073
8	C22.279	116	0.08035
		118	0.39912
		120	0.00474
		124	0.35635
		126	0.06841
		128	0.02180
		130	0.06914
		134	0.00009
9	FH2001	124	0.02035
		132	0.42582
		136	0.07117
		140	0.01816
		144	0.24024
		148	0.21040
		152	0.01268
		158	0.00119
10	FH2054	148	0.01076
		152	0.03184
		156	0.55045
		160	0.01761
		164	0.00356
		168	0.29602
		172	0.07772
		176	0.01104
		180	0.00100
11	FH2848	230	0.01551
		232	0.01560
		234	0.01250
		236	0.05255
		238	0.13820
		240	0.68829
		242	0.07681
		244	0.00018
		246	0.00036
12	INRA21	91	0.35389
		93	0.00009
		95	0.40396
		97	0.04706
		99	0.05555
		101	0.11501
		103	0.00766
		105	0.01377
		109	0.00301
13	INU005	110	0.01988
		120	0.00009
		122	0.00055
		124	0.51377
		126	0.44847
		128	0.00182
		130	0.01186
		132	0.00119
		138	0.00237
14	INU030	144	0.32333
		146	0.14922
		148	0.06503
		150	0.08692
		152	0.37432
		154	0.00082
		156	0.00027
		158	0.00009
15	INU055	208	0.00164
		210	0.21926
		212	0.05928
		214	0.29341
		216	0.36994
		218	0.03949
		220	0.01569
		222	0.00128
16	LEI004	85	0.65460
		95	0.10170
		97	0.00474
		105	0.00073
		107	0.20640
		109	0.03183
17	REN105L03	227	0.01031
		231	0.27745
		233	0.19838
		235	0.00757
		237	0.01514
		239	0.01204
		241	0.47884
		243	0.00027
18	REN162C04	200	0.02062
		202	0.17123
		204	0.06787
		206	0.54306
		208	0.08967
		210	0.06477
		212	0.04278
19	REN169D01	202	0.00987
		210	0.00119
		212	0.07083
		214	0.00091
		216	0.41044
		218	0.25891
		220	0.00192
		222	0.05027
		224	0.17337
		226	0.02230
20	REN169O18	156	0.00128
		160	0.03329
		162	0.56558
		164	0.31567
		166	0.01733
		168	0.02463
		170	0.03274
		172	0.00949
21	REN247M23	266	0.03402
		268	0.52691
		270	0.23285
		272	0.19901
		274	0.00246
		278	0.00474
22	REN54P11	222	0.00319
		226	0.26833
		228	0.16718
		230	0.00356
		232	0.33491
		234	0.20832
		236	0.00420
		238	0.00949
		242	0.00082
23	REN64E19	139	0.00237
		143	0.00520
		145	0.42685
		147	0.24653
		149	0.03539
		153	0.25711
		155	0.02654
24	VGL0760	12	0.29639
		13	0.00119
		14	0.01414
		15	0.00867
		18	0.00155
		19	0.08447
		19.2	0.14067
		20	0.03622
		20.2	0.16238
		21	0.00128
		21.2	0.05373
		22.2	0.01651
		23.2	0.10892
		24.2	0.05920
		25.2	0.01423
		26.2	0.00046
25	VGL0910	12	0.00046
		13	0.04870
		14	0.01696
		15	0.01879
		15.1	0.01596
		16	0.00018
		16.1	0.00493
		17.1	0.10589
		18.1	0.27298
		19	0.00009
		19.1	0.13079
		20.1	0.04150
		21.1	0.27691
		22	0.00730
		22.1	0.02271
		23	0.03083
		23.1	0.00383
		24	0.00119
26	VGL1063	8	0.02782
		9	0.00228
		10	0.00009
		11	0.00164
		12	0.03475
		13	0.16354
		14	0.13918
		15	0.08619
		16	0.09869
		17	0.03138
		18	0.04405
		19	0.29606
		20	0.04141
		21	0.02463
		22	0.00666
		23	0.00155
		24	0.00009
27	VGL1165	13	0.00009
		14	0.00009
		15	0.00657
		16	0.04214
		17	0.00410
		18	0.01833
		19	0.00930
		20	0.00082
		21	0.07880
		22	0.00310
		23	0.00292
		24	0.01523
		25	0.11419
		25.3	0.00009
		26	0.47820
		27	0.10835
		28	0.10972
		29	0.00228
		30	0.00429
		31	0.00100
		32	0.00027
		34	0.00009
28	VGL1828	14	0.03712
		15	0.00055
		16	0.04752
		17	0.02298
		18	0.08738
		19	0.42503
		20	0.33874
		21	0.03366
		22	0.00693
		23	0.00009
29	VGL2009	9	0.45166
		10	0.00602
		11	0.03502
		12	0.04697
		13	0.24498
		14	0.18698
		15	0.02818
		16	0.00018
30	VGL2409	13	0.03923
		14	0.26405
		15	0.18641
		16	0.15374
		17	0.19672
		18	0.13586
		19	0.02354
		20	0.00046
31	VGL2918	7	0.00009
		12	0.00511
		13	0.11419
		14	0.20640
		15	0.15761
		16	0.04305
		16.3	0.00146
		17	0.00228
		17.3	0.03201
		18.3	0.02180
		19.3	0.11793
		20.3	0.11802
		21.3	0.14183
		22.3	0.03502
		23.3	0.00319
32	VGL3008	12	0.00009
		13	0.01140
		14	0.03402
		15	0.23449
		16	0.03803
		17	0.50164
		18	0.02545
		18.2	0.00018
		19	0.12796
		20	0.02426
		21	0.00237
		23	0.00009
33	VGL3235	12	0.15487
		13	0.04916
		14	0.15733
		15	0.04652
		16	0.30016
		17	0.22173
		18	0.06914
		19	0.00109

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5483	10.091	3.736	0.680	0.700	0.030
	SE		0.645	0.230	0.017	0.017	0.003

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5483	8.714	3.000	0.584	0.605	0.035
	SE		1.173	0.468	0.057	0.059	0.007

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	5483	13	5.300	0.796	0.811	0.019
2	AHT137	5483	12	4.270	0.754	0.766	0.016
3	AHTH130	5483	11	4.222	0.736	0.763	0.035
4	AHTh171-A	5483	11	4.272	0.757	0.766	0.012
5	AHTh260	5483	10	2.663	0.605	0.625	0.031
6	AHTk211	5483	6	2.008	0.475	0.502	0.054
7	AHTk253	5483	7	3.907	0.736	0.744	0.010
8	C22.279	5483	8	3.304	0.706	0.697	-0.013
9	FH2001	5483	8	3.457	0.692	0.711	0.027
10	FH2054	5483	9	2.511	0.600	0.602	0.003
11	FH2848	5483	9	1.991	0.473	0.498	0.050
12	INRA21	5483	9	3.255	0.669	0.693	0.035
13	INU005	5483	9	2.148	0.511	0.534	0.044
14	INU030	5483	8	3.588	0.690	0.721	0.044
15	INU055	5483	8	3.619	0.711	0.724	0.017
16	LEI004	5483	6	2.073	0.513	0.518	0.008
17	REN105L03	5483	8	2.889	0.622	0.654	0.049
18	REN162C04	5483	7	2.913	0.621	0.657	0.055
19	REN169D01	5483	10	3.654	0.686	0.726	0.056
20	REN169O18	5483	8	2.366	0.553	0.577	0.042
21	REN247M23	5483	6	2.684	0.597	0.627	0.049
22	REN54P11	5483	9	3.912	0.700	0.744	0.060
23	REN64E19	5483	7	3.215	0.667	0.689	0.032
24	VGL0760	5483	16	6.194	0.827	0.839	0.013
25	VGL0910	5483	18	5.374	0.807	0.814	0.009
26	VGL1063	5483	17	6.320	0.818	0.842	0.028
27	VGL1165	5483	22	3.646	0.688	0.726	0.051
28	VGL1828	5483	10	3.243	0.671	0.692	0.030
29	VGL2009	5483	8	3.298	0.660	0.697	0.053
30	VGL2409	5483	8	5.337	0.805	0.813	0.009
31	VGL2918	5483	15	7.516	0.857	0.867	0.011
32	VGL3008	5483	12	3.058	0.664	0.673	0.014
33	VGL3235	5483	8	5.067	0.775	0.803	0.034

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	5483	15	3.465	0.688	0.711	0.034
2	DLA I-4ACA	5483	11	4.821	0.775	0.793	0.023
3	DLA I-4BCT	5483	6	2.571	0.588	0.611	0.037
4	DLA1131	5483	9	4.658	0.758	0.785	0.034
5	5ACA	5483	6	1.552	0.350	0.356	0.015
6	5ACT	5483	8	1.829	0.441	0.453	0.027
7	5BCA	5483	6	2.107	0.487	0.525	0.074

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media