Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Dec 1, 2022

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=4857)
1001	380 373 281 182	0.2676
1002	380 365 281 181	0.1603
1003	387 375 277 186	0.1714
1004	393 379 277 183	0.0859
1005	389 371 277 181	0.0680
1006	387 375 293 180	0.0474
1007	380 372 281 182	0.0335
1008	386 373 289 182	0.0137
1009	382 377 277 184	0.0150
1010	384 371 277 186	0.0118
1011	376 365 281 180	0.0195
1012	388 369 289 188	0.0142
1013	392 373 289 186	0.0085
1014	375 373 287 178	0.0115
1015	380 373 291 186	0.0014
1016	382 371 277 178	0.0221
1017	386 373 289 178	0.0027
1018	375 373 287 186	0.0086
1019	380 373 287 185	0.0034
1020	388 369 289 184	0.0033
1021	380 373 289 186	0.0019
1022	380 375 281 181	0.0001
1023	380 379 281 181	0.0001
1024	387 373 281 182	0.0001
1025	380 365 281 186	0.0002
1026	390 369 289 186	0.0034
1027	391 371 277 181	0.0005
1028	376 369 291 186	0.0009
1029	380 365 281 182	0.0018
1030	380 373 293 178	0.0022
1031	382 371 277 186	0.0010
1032	382 377 277 178	0.0001
1033	382 379 277 181	0.0032
1034	382 379 277 182	0.0002
1035	386 373 277 184	0.0001
1036	389 365 289 180	0.0016
1040	380 371 277 186	0.0006
1043	393 381 277 183	0.0014
1045	376 371 277 186	0.0007
1046	376 379 291 180	0.0003
1052	380 372 289 184	0.0003
1053	382 377 277 186	0.0002
1054	382 379 277 184	0.0002
1065	380 371 277 181	0.0002
1084	376 373 277 184	0.0003
1092	376 379 277 181	0.0002
1093	386 379 277 180	0.0005
1102	389 375 293 180	0.0001
1103	389 375 293 181	0.0002
1105	382 379 277 178	0.0037
1106	395 379 277 178	0.0001
1107	376 375 293 183	0.0001
1109	381 379 291 186	0.0008
1111	387 378 287 182	0.0001
1130	380 373 287 178	0.0001
1134	384 365 291 178	0.0002
1141	380 365 281 180	0.0002
1168	382 379 289 186	0.0001
1169	380 365 277 180	0.0011
1225	387 374 287 186	0.0001
1234	380 371 281 181	0.0002
1265	387 375 277 184	0.0001
1270	376 365 281 181	0.0001
1271	387 375 277 181	0.0002
1279	393 379 277 186	0.0001

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=4857)
2001	343 324 284	0.5974
2002	343 327 280	0.0872
2003	343 324 282	0.1032
2004	351 327 268	0.0286
2005	339 322 280	0.0167
2006	339 325 280	0.0335
2007	351 327 280	0.0170
2008	339 327 276	0.0150
2009	351 324 280	0.0080
2010	345 329 280	0.0118
2011	345 322 284	0.0196
2012	345 322 280	0.0067
2013	345 327 284	0.0111
2014	339 322 284	0.0205
2015	339 327 280	0.0043
2016	339 323 284	0.0035
2017	343 322 280	0.0022
2019	345 324 284	0.0001
2020	349 324 284	0.0002
2021	339 324 268	0.0038
2022	339 327 282	0.0005
2023	341 323 282	0.0022
2024	343 323 280	0.0003
2025	351 321 280	0.0016
2026	351 324 284	0.0010
2028	345 327 288	0.0006
2032	339 323 280	0.0005
2035	341 323 280	0.0001
2037	341 327 280	0.0005
2039	345 327 276	0.0006
2040	345 327 280	0.0001
2048	339 331 282	0.0002
2064	351 327 284	0.0009
2066	339 324 280	0.0001
2101	341 324 280	0.0002
2115	343 327 284	0.0001

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=4861)
1	AHT121	92	0.0121
		94	0.0233
		96	0.0127
		98	0.3186
		100	0.0874
		102	0.0062
		104	0.1953
		106	0.0804
		108	0.1741
		110	0.0660
		112	0.0236
		114	0.0002
2	AHT137	131	0.2295
		133	0.0109
		135	0.0001
		137	0.1751
		139	0.0005
		141	0.3716
		143	0.0119
		145	0.0479
		147	0.0561
		149	0.0023
		151	0.0938
		153	0.0002
3	AHTH130	111	0.0172
		117	0.0024
		119	0.3889
		121	0.1355
		123	0.0780
		125	0.0003
		127	0.1304
		129	0.2166
		131	0.0155
		133	0.0127
		135	0.0024
4	AHTh171-A	217	0.0068
		219	0.3673
		221	0.2355
		223	0.0061
		225	0.1467
		227	0.0091
		229	0.0481
		231	0.0195
		233	0.0011
		235	0.1392
		237	0.0206
5	AHTh260	238	0.5737
		240	0.0283
		242	0.0003
		244	0.0577
		246	0.1896
		248	0.0651
		250	0.0342
		252	0.0363
		254	0.0061
		256	0.0086
6	AHTk211	87	0.1856
		89	0.0387
		91	0.6719
		93	0.0034
		95	0.1002
		97	0.0002
7	AHTk253	280	0.0099
		284	0.1286
		286	0.1116
		288	0.4059
		290	0.2168
		292	0.1268
		296	0.0004
8	C22.279	116	0.0798
		118	0.4001
		120	0.0040
		124	0.3612
		126	0.0671
		128	0.0216
		130	0.0660
		134	0.0001
9	FH2001	124	0.0200
		132	0.4220
		136	0.0702
		140	0.0183
		144	0.2424
		148	0.2129
		152	0.0129
		158	0.0013
10	FH2054	148	0.0110
		152	0.0301
		156	0.5509
		160	0.0169
		164	0.0027
		168	0.2957
		172	0.0806
		176	0.0110
		180	0.0011
11	FH2848	230	0.0136
		232	0.0165
		234	0.0116
		236	0.0521
		238	0.1399
		240	0.6890
		242	0.0769
		244	0.0001
		246	0.0004
12	INRA21	91	0.3544
		93	0.0001
		95	0.4023
		97	0.0463
		99	0.0580
		101	0.1145
		103	0.0074
		105	0.0143
		109	0.0028
13	INU005	110	0.0184
		120	0.0001
		122	0.0006
		124	0.5139
		126	0.4507
		128	0.0020
		130	0.0118
		132	0.0003
		138	0.0022
14	INU030	144	0.3189
		146	0.1485
		148	0.0642
		150	0.0873
		152	0.3799
		154	0.0008
		156	0.0003
		158	0.0001
15	INU055	208	0.0015
		210	0.2194
		212	0.0604
		214	0.2959
		216	0.3688
		218	0.0380
		220	0.0147
		222	0.0013
16	LEI004	85	0.6574
		95	0.0978
		97	0.0040
		105	0.0008
		107	0.2090
		109	0.0310
17	REN105L03	227	0.0101
		231	0.2745
		233	0.2019
		235	0.0073
		237	0.0153
		239	0.0113
		241	0.4792
		243	0.0003
18	REN162C04	200	0.0214
		202	0.1726
		204	0.0651
		206	0.5457
		208	0.0906
		210	0.0657
		212	0.0390
19	REN169D01	202	0.0092
		210	0.0012
		212	0.0721
		214	0.0010
		216	0.4087
		218	0.2637
		220	0.0017
		222	0.0468
		224	0.1732
		226	0.0224
20	REN169O18	156	0.0014
		160	0.0342
		162	0.5729
		164	0.3146
		166	0.0149
		168	0.0230
		170	0.0310
		172	0.0079
21	REN247M23	266	0.0355
		268	0.5197
		270	0.2385
		272	0.1993
		274	0.0025
		278	0.0045
22	REN54P11	222	0.0020
		226	0.2606
		228	0.1695
		230	0.0023
		232	0.3387
		234	0.2120
		236	0.0045
		238	0.0097
		242	0.0007
23	REN64E19	139	0.0021
		143	0.0057
		145	0.4196
		147	0.2509
		149	0.0353
		153	0.2589
		155	0.0277
24	VGL0760	12	0.2963
		13	0.0008
		14	0.0143
		15	0.0090
		18	0.0015
		19	0.0872
		19.2	0.1365
		20	0.0356
		20.2	0.1642
		21	0.0014
		21.2	0.0513
		22.2	0.0162
		23.2	0.1107
		24.2	0.0595
		25.2	0.0149
		26.2	0.0005
25	VGL0910	12	0.0005
		13	0.0474
		14	0.0172
		15	0.0195
		15.1	0.0146
		16	0.0001
		16.1	0.0050
		17.1	0.1054
		18.1	0.2768
		19	0.0001
		19.1	0.1315
		20.1	0.0385
		21.1	0.2775
		22	0.0072
		22.1	0.0225
		23	0.0309
		23.1	0.0042
		24	0.0010
26	VGL1063	8	0.0265
		9	0.0026
		10	0.0001
		11	0.0013
		12	0.0343
		13	0.1557
		14	0.1407
		15	0.0825
		16	0.0995
		17	0.0311
		18	0.0437
		19	0.3042
		20	0.0430
		21	0.0258
		22	0.0072
		23	0.0017
		24	0.0001
27	VGL1165	13	0.0001
		14	0.0001
		15	0.0068
		16	0.0429
		17	0.0030
		18	0.0171
		19	0.0094
		20	0.0008
		21	0.0797
		22	0.0029
		23	0.0028
		24	0.0164
		25	0.1150
		25.3	0.0001
		26	0.4743
		27	0.1113
		28	0.1102
		29	0.0023
		30	0.0042
		31	0.0004
		32	0.0003
		34	0.0001
28	VGL1828	14	0.0368
		15	0.0004
		16	0.0492
		17	0.0217
		18	0.0869
		19	0.4312
		20	0.3338
		21	0.0334
		22	0.0065
		23	0.0001
29	VGL2009	9	0.4501
		10	0.0050
		11	0.0359
		12	0.0482
		13	0.2444
		14	0.1874
		15	0.0287
		16	0.0002
30	VGL2409	13	0.0399
		14	0.2635
		15	0.1907
		16	0.1521
		17	0.1922
		18	0.1362
		19	0.0248
		20	0.0005
31	VGL2918	7	0.0001
		12	0.0056
		13	0.1083
		14	0.2109
		15	0.1612
		16	0.0428
		16.3	0.0015
		17	0.0024
		17.3	0.0331
		18.3	0.0206
		19.3	0.1163
		20.3	0.1189
		21.3	0.1390
		22.3	0.0362
		23.3	0.0032
32	VGL3008	12	0.0001
		13	0.0111
		14	0.0352
		15	0.2343
		16	0.0376
		17	0.5033
		18	0.0242
		18.2	0.0002
		19	0.1274
		20	0.0243
		21	0.0022
		23	0.0001
33	VGL3235	12	0.1552
		13	0.0488
		14	0.1534
		15	0.0448
		16	0.3045
		17	0.2242
		18	0.0682
		19	0.0009

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	4861	10.061	3.721	0.679	0.699	0.031
	SE		0.641	0.227	0.017	0.017	0.004

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	4861	8.714	2.994	0.584	0.605	0.035
	SE		1.173	0.465	0.057	0.058	0.007

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	4861	12	5.267	0.788	0.810	0.027
2	AHT137	4861	12	4.238	0.750	0.764	0.019
3	AHTH130	4861	11	4.161	0.727	0.760	0.043
4	AHTh171-A	4861	11	4.263	0.755	0.765	0.013
5	AHTh260	4861	10	2.659	0.604	0.624	0.032
6	AHTk211	4861	6	2.010	0.470	0.503	0.064
7	AHTk253	4861	7	3.892	0.735	0.743	0.010
8	C22.279	4861	8	3.265	0.707	0.694	-0.020
9	FH2001	4861	8	3.472	0.690	0.712	0.031
10	FH2054	4861	9	2.507	0.601	0.601	0.000
11	FH2848	4861	9	1.986	0.471	0.497	0.052
12	INRA21	4861	9	3.265	0.675	0.694	0.027
13	INU005	4861	9	2.138	0.505	0.532	0.051
14	INU030	4861	8	3.574	0.692	0.720	0.039
15	INU055	4861	8	3.610	0.712	0.723	0.016
16	LEI004	4861	6	2.056	0.512	0.514	0.002
17	REN105L03	4861	8	2.888	0.616	0.654	0.057
18	REN162C04	4861	7	2.888	0.622	0.654	0.049
19	REN169D01	4861	10	3.642	0.687	0.725	0.053
20	REN169O18	4861	8	2.325	0.540	0.570	0.053
21	REN247M23	4861	6	2.718	0.606	0.632	0.041
22	REN54P11	4861	9	3.899	0.701	0.744	0.057
23	REN64E19	4861	7	3.246	0.670	0.692	0.032
24	VGL0760	4861	16	6.193	0.830	0.839	0.010
25	VGL0910	4861	18	5.313	0.803	0.812	0.010
26	VGL1063	4861	17	6.227	0.814	0.839	0.030
27	VGL1165	4861	22	3.681	0.690	0.728	0.052
28	VGL1828	4861	10	3.223	0.670	0.690	0.028
29	VGL2009	4861	8	3.312	0.659	0.698	0.056
30	VGL2409	4861	8	5.357	0.806	0.813	0.009
31	VGL2918	4861	15	7.470	0.857	0.866	0.011
32	VGL3008	4861	12	3.045	0.662	0.672	0.014
33	VGL3235	4861	8	5.009	0.770	0.800	0.038

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	4861	15	3.445	0.686	0.710	0.033
2	DLA I-4ACA	4861	11	4.801	0.770	0.792	0.027
3	DLA I-4BCT	4861	6	2.559	0.587	0.609	0.036
4	DLA1131	4861	9	4.654	0.758	0.785	0.035
5	5ACA	4861	6	1.562	0.355	0.360	0.012
6	5ACT	4861	8	1.840	0.445	0.457	0.024
7	5BCA	4861	6	2.095	0.485	0.523	0.073

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media