Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Apr 22, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=5355)
1001	380 373 281 182	0.26657
1002	380 365 281 181	0.15929
1003	387 375 277 186	0.17498
1004	393 379 277 183	0.08413
1005	389 371 277 181	0.06704
1006	387 375 293 180	0.04883
1007	380 372 281 182	0.03408
1008	386 373 289 182	0.01289
1009	382 377 277 184	0.01447
1010	384 371 277 186	0.01139
1011	376 365 281 180	0.01970
1012	388 369 289 188	0.01494
1013	392 373 289 186	0.00878
1014	375 373 287 178	0.01102
1015	380 373 291 186	0.00131
1016	382 371 277 178	0.02129
1017	386 373 289 178	0.00252
1018	375 373 287 186	0.00896
1019	380 373 287 185	0.00308
1020	388 369 289 184	0.00299
1021	380 373 289 186	0.00177
1022	380 375 281 181	0.00009
1023	380 379 281 181	0.00009
1024	387 373 281 182	0.00009
1025	380 365 281 186	0.00019
1026	390 369 289 186	0.00345
1027	391 371 277 181	0.00047
1028	376 369 291 186	0.00112
1029	380 365 281 182	0.00168
1030	380 373 293 178	0.00224
1031	382 371 277 186	0.00131
1032	382 377 277 178	0.00009
1033	382 379 277 181	0.00345
1034	382 379 277 182	0.00056
1035	386 373 277 184	0.00009
1036	389 365 289 180	0.00159
1040	380 371 277 186	0.00056
1043	393 381 277 183	0.00149
1045	376 371 277 186	0.00065
1046	376 379 291 180	0.00037
1052	380 372 289 184	0.00037
1053	382 377 277 186	0.00019
1054	382 379 277 184	0.00019
1065	380 371 277 181	0.00019
1069	380 365 281 184	0.00009
1084	376 373 277 184	0.00028
1092	376 379 277 181	0.00019
1093	386 379 277 180	0.00047
1102	389 375 293 180	0.00009
1103	389 375 293 181	0.00019
1105	382 379 277 178	0.00373
1106	395 379 277 178	0.00009
1107	376 375 293 183	0.00019
1109	381 379 291 186	0.00159
1111	387 378 287 182	0.00009
1130	380 373 287 178	0.00009
1134	384 365 291 178	0.00019
1141	380 365 281 180	0.00019
1168	382 379 289 186	0.00019
1169	380 365 277 180	0.00103
1225	387 374 287 186	0.00009
1234	380 371 281 181	0.00019
1265	387 375 277 184	0.00009
1270	376 365 281 181	0.00009
1271	387 375 277 181	0.00019
1279	393 379 277 186	0.00009

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=5355)
2001	343 324 284	0.59953
2002	343 327 280	0.08553
2003	343 324 282	0.10364
2004	351 327 268	0.02951
2005	339 322 280	0.01578
2006	339 325 280	0.03408
2007	351 327 280	0.01755
2008	339 327 276	0.01457
2009	351 324 280	0.00738
2010	345 329 280	0.01139
2011	345 322 284	0.01979
2012	345 322 280	0.00766
2013	345 327 284	0.01055
2014	339 322 284	0.01942
2015	339 327 280	0.00420
2016	339 323 284	0.00327
2017	343 322 280	0.00215
2019	345 324 284	0.00009
2020	349 324 284	0.00019
2021	339 324 268	0.00383
2022	339 327 282	0.00047
2023	341 323 282	0.00224
2024	343 323 280	0.00065
2025	351 321 280	0.00159
2026	351 324 284	0.00103
2028	345 327 288	0.00056
2032	339 323 280	0.00047
2035	341 323 280	0.00009
2037	341 327 280	0.00047
2039	345 327 276	0.00056
2040	345 327 280	0.00009
2048	339 331 282	0.00019
2050	341 327 284	0.00009
2053	343 324 280	0.00009
2064	351 327 284	0.00093
2066	339 324 280	0.00009
2101	341 324 280	0.00019
2115	343 327 284	0.00009

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=5357)
1	AHT121	92	0.01242
		94	0.02222
		96	0.01223
		98	0.31796
		100	0.08682
		102	0.00625
		104	0.19595
		106	0.08234
		108	0.17308
		110	0.06731
		112	0.02315
		114	0.00019
		116	0.00009
2	AHT137	131	0.22997
		133	0.01027
		135	0.00037
		137	0.17600
		139	0.00047
		141	0.36788
		143	0.01298
		145	0.04734
		147	0.05621
		149	0.00224
		151	0.09608
		153	0.00019
3	AHTH130	111	0.01684
		117	0.00246
		119	0.38314
		121	0.13948
		123	0.07892
		125	0.00085
		127	0.13162
		129	0.21631
		131	0.01561
		133	0.01259
		135	0.00218
4	AHTh171-A	217	0.00635
		219	0.36987
		221	0.23254
		223	0.00635
		225	0.14414
		227	0.00924
		229	0.04920
		231	0.02054
		233	0.00112
		235	0.14087
		237	0.01979
5	AHTh260	238	0.57079
		240	0.02942
		242	0.00028
		244	0.05827
		246	0.19089
		248	0.06472
		250	0.03409
		252	0.03698
		254	0.00626
		256	0.00831
6	AHTk211	87	0.18400
		89	0.03930
		91	0.67261
		93	0.00401
		95	0.09989
		97	0.00019
7	AHTk253	280	0.00924
		284	0.12920
		286	0.11352
		288	0.40674
		290	0.21471
		292	0.12584
		296	0.00075
8	C22.279	116	0.08010
		118	0.40039
		120	0.00420
		124	0.35801
		126	0.06815
		128	0.02138
		130	0.06768
		134	0.00009
9	FH2001	124	0.02045
		132	0.42118
		136	0.07154
		140	0.01802
		144	0.24309
		148	0.21190
		152	0.01261
		158	0.00121
10	FH2054	148	0.01018
		152	0.03212
		156	0.54930
		160	0.01765
		164	0.00345
		168	0.29683
		172	0.07824
		176	0.01120
		180	0.00103
11	FH2848	230	0.01578
		232	0.01588
		234	0.01121
		236	0.05314
		238	0.13793
		240	0.68846
		242	0.07705
		244	0.00019
		246	0.00037
12	INRA21	91	0.35496
		93	0.00009
		95	0.40321
		97	0.04713
		99	0.05572
		101	0.11424
		103	0.00765
		105	0.01409
		109	0.00289
13	INU005	110	0.02016
		120	0.00009
		122	0.00056
		124	0.51363
		126	0.44866
		128	0.00187
		130	0.01214
		132	0.00047
		138	0.00243
14	INU030	144	0.31828
		146	0.14971
		148	0.06496
		150	0.08755
		152	0.37829
		154	0.00084
		156	0.00028
		158	0.00009
15	INU055	208	0.00168
		210	0.22093
		212	0.05992
		214	0.29569
		216	0.36690
		218	0.03864
		220	0.01493
		222	0.00131
16	LEI004	85	0.65478
		95	0.09961
		97	0.00485
		105	0.00075
		107	0.20827
		109	0.03174
17	REN105L03	227	0.01055
		231	0.27600
		233	0.19944
		235	0.00728
		237	0.01522
		239	0.01204
		241	0.47918
		243	0.00028
18	REN162C04	200	0.02063
		202	0.17068
		204	0.06648
		206	0.54669
		208	0.09076
		210	0.06527
		212	0.03950
19	REN169D01	202	0.00982
		210	0.00122
		212	0.07101
		214	0.00094
		216	0.40634
		218	0.26057
		220	0.00187
		222	0.05015
		224	0.17534
		226	0.02274
20	REN169O18	156	0.00131
		160	0.03306
		162	0.56939
		164	0.31500
		166	0.01662
		168	0.02353
		170	0.03250
		172	0.00859
21	REN247M23	266	0.03436
		268	0.52437
		270	0.23501
		272	0.19907
		274	0.00252
		278	0.00467
22	REN54P11	222	0.00205
		226	0.26475
		228	0.16813
		230	0.00345
		232	0.33532
		234	0.21182
		236	0.00420
		238	0.00943
		242	0.00084
23	REN64E19	139	0.00243
		143	0.00532
		145	0.42682
		147	0.24687
		149	0.03416
		153	0.25733
		155	0.02707
24	VGL0760	12	0.29655
		13	0.00112
		14	0.01429
		15	0.00840
		18	0.00159
		19	0.08581
		19.2	0.13838
		20	0.03679
		20.2	0.16256
		21	0.00131
		21.2	0.05257
		22.2	0.01643
		23.2	0.10924
		24.2	0.05994
		25.2	0.01457
		26.2	0.00047
25	VGL0910	12	0.00047
		13	0.04789
		14	0.01736
		15	0.01876
		15.1	0.01578
		16	0.00019
		16.1	0.00504
		17.1	0.10605
		18.1	0.27418
		19	0.00009
		19.1	0.13013
		20.1	0.04005
		21.1	0.27894
		22	0.00737
		22.1	0.02222
		23	0.03034
		23.1	0.00392
		24	0.00121
26	VGL1063	8	0.02791
		9	0.00233
		10	0.00009
		11	0.00168
		12	0.03445
		13	0.16094
		14	0.13872
		15	0.08504
		16	0.09914
		17	0.03090
		18	0.04444
		19	0.29910
		20	0.04182
		21	0.02493
		22	0.00681
		23	0.00159
		24	0.00009
27	VGL1165	13	0.00009
		14	0.00009
		15	0.00672
		16	0.04248
		17	0.00336
		18	0.01858
		19	0.00943
		20	0.00075
		21	0.07954
		22	0.00317
		23	0.00271
		24	0.01550
		25	0.11473
		25.3	0.00009
		26	0.47638
		27	0.10941
		28	0.10894
		29	0.00233
		30	0.00429
		31	0.00103
		32	0.00028
		34	0.00009
28	VGL1828	14	0.03762
		15	0.00056
		16	0.04696
		17	0.02184
		18	0.08785
		19	0.42812
		20	0.33645
		21	0.03361
		22	0.00691
		23	0.00009
29	VGL2009	9	0.44950
		10	0.00616
		11	0.03585
		12	0.04752
		13	0.24365
		14	0.18895
		15	0.02819
		16	0.00019
30	VGL2409	13	0.03932
		14	0.26373
		15	0.18790
		16	0.15204
		17	0.19630
		18	0.13681
		19	0.02344
		20	0.00047
31	VGL2918	7	0.00009
		12	0.00523
		13	0.11249
		14	0.20659
		15	0.15879
		16	0.04304
		16.3	0.00149
		17	0.00224
		17.3	0.03230
		18.3	0.02175
		19.3	0.11660
		20.3	0.11903
		21.3	0.14208
		22.3	0.03510
		23.3	0.00317
32	VGL3008	12	0.00009
		13	0.01130
		14	0.03435
		15	0.23460
		16	0.03799
		17	0.50168
		18	0.02530
		18.2	0.00019
		19	0.12873
		20	0.02324
		21	0.00243
		23	0.00009
33	VGL3235	12	0.15282
		13	0.04957
		14	0.15609
		15	0.04574
		16	0.30330
		17	0.22125
		18	0.07011
		19	0.00112

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5357	10.091	3.732	0.680	0.700	0.029
	SE		0.645	0.229	0.017	0.017	0.003

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5357	8.714	2.993	0.584	0.605	0.034
	SE		1.173	0.465	0.057	0.059	0.006

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	5357	13	5.272	0.795	0.810	0.019
2	AHT137	5357	12	4.271	0.753	0.766	0.017
3	AHTH130	5357	11	4.214	0.734	0.763	0.038
4	AHTh171-A	5357	11	4.257	0.756	0.765	0.011
5	AHTh260	5357	10	2.679	0.609	0.627	0.028
6	AHTk211	5357	6	2.009	0.473	0.502	0.059
7	AHTk253	5357	7	3.890	0.735	0.743	0.010
8	C22.279	5357	8	3.283	0.707	0.695	-0.017
9	FH2001	5357	8	3.479	0.694	0.713	0.026
10	FH2054	5357	9	2.515	0.600	0.602	0.004
11	FH2848	5357	9	1.991	0.473	0.498	0.049
12	INRA21	5357	9	3.255	0.671	0.693	0.032
13	INU005	5357	9	2.147	0.512	0.534	0.042
14	INU030	5357	8	3.588	0.693	0.721	0.039
15	INU055	5357	8	3.621	0.712	0.724	0.017
16	LEI004	5357	6	2.070	0.514	0.517	0.006
17	REN105L03	5357	8	2.889	0.622	0.654	0.049
18	REN162C04	5357	7	2.883	0.619	0.653	0.052
19	REN169D01	5357	10	3.677	0.689	0.728	0.053
20	REN169O18	5357	8	2.345	0.548	0.574	0.044
21	REN247M23	5357	6	2.695	0.601	0.629	0.045
22	REN54P11	5357	9	3.909	0.699	0.744	0.061
23	REN64E19	5357	7	3.213	0.667	0.689	0.032
24	VGL0760	5357	16	6.200	0.829	0.839	0.012
25	VGL0910	5357	18	5.334	0.805	0.813	0.009
26	VGL1063	5357	17	6.290	0.817	0.841	0.029
27	VGL1165	5357	22	3.665	0.689	0.727	0.053
28	VGL1828	5357	10	3.231	0.670	0.691	0.030
29	VGL2009	5357	8	3.317	0.663	0.699	0.050
30	VGL2409	5357	8	5.338	0.805	0.813	0.010
31	VGL2918	5357	15	7.511	0.858	0.867	0.010
32	VGL3008	5357	12	3.056	0.662	0.673	0.016
33	VGL3235	5357	8	5.047	0.776	0.802	0.032

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	5357	15	3.447	0.687	0.710	0.032
2	DLA I-4ACA	5357	11	4.804	0.774	0.792	0.023
3	DLA I-4BCT	5357	6	2.568	0.588	0.611	0.037
4	DLA1131	5357	9	4.647	0.758	0.785	0.034
5	5ACA	5357	6	1.558	0.352	0.358	0.016
6	5ACT	5357	8	1.833	0.442	0.454	0.027
7	5BCA	5357	6	2.094	0.486	0.522	0.070

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media