Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Nov 4, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=5587)
1001	380 373 281 182	0.26562
1002	380 365 281 181	0.16073
1003	387 375 277 186	0.17433
1004	393 379 277 183	0.08403
1005	389 371 277 181	0.06954
1006	387 375 293 180	0.04931
1007	380 372 281 182	0.03356
1008	386 373 289 182	0.01244
1009	382 377 277 184	0.01503
1010	384 371 277 186	0.01137
1011	376 365 281 180	0.01924
1012	388 369 289 188	0.01450
1013	392 373 289 186	0.00850
1014	375 373 287 178	0.01092
1015	380 373 291 186	0.00125
1016	382 371 277 178	0.02085
1017	386 373 289 178	0.00242
1018	375 373 287 186	0.00975
1019	380 373 287 185	0.00295
1020	388 369 289 184	0.00286
1021	380 373 289 186	0.00170
1022	380 375 281 181	0.00009
1023	380 379 281 181	0.00009
1024	387 373 281 182	0.00009
1025	380 365 281 186	0.00018
1026	390 369 289 186	0.00331
1027	391 371 277 181	0.00045
1028	376 369 291 186	0.00107
1029	380 365 281 182	0.00161
1030	380 373 293 178	0.00215
1031	382 371 277 186	0.00125
1032	382 377 277 178	0.00009
1033	382 379 277 181	0.00340
1034	382 379 277 182	0.00054
1035	386 373 277 184	0.00009
1036	389 365 289 180	0.00161
1040	380 371 277 186	0.00054
1043	393 381 277 183	0.00143
1045	376 371 277 186	0.00063
1046	376 379 291 180	0.00036
1052	380 372 289 184	0.00036
1053	382 377 277 186	0.00018
1054	382 379 277 184	0.00018
1065	380 371 277 181	0.00018
1069	380 365 281 184	0.00009
1084	376 373 277 184	0.00027
1092	376 379 277 181	0.00018
1093	386 379 277 180	0.00045
1102	389 375 293 180	0.00009
1103	389 375 293 181	0.00018
1105	382 379 277 178	0.00376
1106	395 379 277 178	0.00009
1107	376 375 293 183	0.00018
1109	381 379 291 186	0.00152
1111	387 378 287 182	0.00009
1130	380 373 287 178	0.00009
1134	384 365 291 178	0.00018
1141	380 365 281 180	0.00018
1168	382 379 289 186	0.00018
1169	380 365 277 180	0.00098
1225	387 374 287 186	0.00009
1234	380 371 281 181	0.00018
1265	387 375 277 184	0.00009
1270	376 365 281 181	0.00009
1271	387 375 277 181	0.00018
1279	393 379 277 186	0.00009

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=5587)
2001	343 324 284	0.59970
2002	343 327 280	0.08538
2003	343 324 282	0.10596
2004	351 327 268	0.03034
2005	339 322 280	0.01512
2006	339 325 280	0.03356
2007	351 327 280	0.01727
2008	339 327 276	0.01512
2009	351 324 280	0.00707
2010	345 329 280	0.01137
2011	345 322 284	0.01933
2012	345 322 280	0.00734
2013	345 327 284	0.01038
2014	339 322 284	0.01906
2015	339 327 280	0.00403
2016	339 323 284	0.00313
2017	343 322 280	0.00206
2019	345 324 284	0.00009
2020	349 324 284	0.00018
2021	339 324 268	0.00385
2022	339 327 282	0.00045
2023	341 323 282	0.00215
2024	343 323 280	0.00063
2025	351 321 280	0.00161
2026	351 324 284	0.00098
2028	345 327 288	0.00054
2032	339 323 280	0.00045
2035	341 323 280	0.00009
2037	341 327 280	0.00045
2039	345 327 276	0.00054
2040	345 327 280	0.00009
2048	339 331 282	0.00018
2050	341 327 284	0.00018
2053	343 324 280	0.00009
2064	351 327 284	0.00089
2066	339 324 280	0.00009
2101	341 324 280	0.00018
2115	343 327 284	0.00009

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=5588)
1	AHT121	92	0.01253
		94	0.02246
		96	0.01244
		98	0.31639
		100	0.08554
		102	0.00635
		104	0.19766
		106	0.08321
		108	0.17233
		110	0.06702
		112	0.02317
		114	0.00081
		116	0.00009
2	AHT137	131	0.23116
		133	0.01038
		135	0.00045
		137	0.17577
		139	0.00045
		141	0.36657
		143	0.01316
		145	0.04654
		147	0.05799
		149	0.00260
		151	0.09468
		153	0.00027
3	AHTH130	111	0.01686
		117	0.00236
		119	0.38044
		121	0.14113
		123	0.07814
		125	0.00118
		127	0.13289
		129	0.21737
		131	0.01505
		133	0.01251
		135	0.00208
4	AHTh171-A	217	0.00608
		219	0.36972
		221	0.23130
		223	0.00617
		225	0.14173
		227	0.00904
		229	0.04939
		231	0.02192
		233	0.00152
		235	0.14379
		237	0.01933
5	AHTh260	238	0.57447
		240	0.03097
		242	0.00027
		244	0.05818
		246	0.18690
		248	0.06445
		250	0.03401
		252	0.03661
		254	0.00618
		256	0.00797
6	AHTk211	87	0.18289
		89	0.03928
		91	0.67403
		93	0.00412
		95	0.09950
		97	0.00018
7	AHTk253	280	0.00886
		284	0.12849
		286	0.11382
		288	0.40489
		290	0.21349
		292	0.12974
		296	0.00072
8	C22.279	116	0.07955
		118	0.40104
		120	0.00474
		124	0.35648
		126	0.06827
		128	0.02165
		130	0.06818
		134	0.00009
9	FH2001	124	0.01996
		132	0.42750
		136	0.07089
		140	0.01799
		144	0.24069
		148	0.20936
		152	0.01244
		158	0.00116
10	FH2054	148	0.01065
		152	0.03141
		156	0.55164
		160	0.01763
		164	0.00349
		168	0.29604
		172	0.07732
		176	0.01083
		180	0.00098
11	FH2848	230	0.01531
		232	0.01549
		234	0.01253
		236	0.05335
		238	0.13713
		240	0.68869
		242	0.07698
		244	0.00018
		246	0.00036
12	INRA21	91	0.35460
		93	0.00009
		95	0.40399
		97	0.04760
		99	0.05530
		101	0.11444
		103	0.00752
		105	0.01351
		109	0.00295
13	INU005	110	0.01977
		120	0.00009
		122	0.00054
		124	0.51423
		126	0.44828
		128	0.00179
		130	0.01181
		132	0.00116
		138	0.00233
14	INU030	144	0.32310
		146	0.14952
		148	0.06478
		150	0.08697
		152	0.37446
		154	0.00081
		156	0.00027
		158	0.00009
15	INU055	208	0.00161
		210	0.21850
		212	0.05959
		214	0.29420
		216	0.36981
		218	0.03964
		220	0.01539
		222	0.00125
16	LEI004	85	0.65327
		95	0.10138
		97	0.00492
		105	0.00072
		107	0.20732
		109	0.03239
17	REN105L03	227	0.01029
		231	0.27931
		233	0.19733
		235	0.00743
		237	0.01495
		239	0.01181
		241	0.47861
		243	0.00027
18	REN162C04	200	0.02049
		202	0.17084
		204	0.06793
		206	0.54367
		208	0.08976
		210	0.06426
		212	0.04296
		214	0.00009
19	REN169D01	202	0.00977
		210	0.00126
		212	0.07066
		214	0.00090
		216	0.41141
		218	0.25673
		220	0.00197
		222	0.05066
		224	0.17468
		226	0.02197
20	REN169O18	156	0.00125
		160	0.03401
		162	0.56542
		164	0.31511
		166	0.01763
		168	0.02434
		170	0.03284
		172	0.00940
21	REN247M23	266	0.03365
		268	0.52801
		270	0.23286
		272	0.19832
		274	0.00251
		278	0.00465
22	REN54P11	222	0.00322
		226	0.26772
		228	0.16714
		230	0.00394
		232	0.33518
		234	0.20812
		236	0.00412
		238	0.00975
		242	0.00081
23	REN64E19	139	0.00242
		143	0.00510
		145	0.42734
		147	0.24597
		149	0.03543
		153	0.25734
		155	0.02640
24	VGL0760	12	0.29667
		13	0.00125
		14	0.01387
		15	0.00850
		18	0.00152
		19	0.08466
		19.2	0.14086
		20	0.03651
		20.2	0.16136
		21	0.00134
		21.2	0.05388
		22.2	0.01682
		23.2	0.10865
		24.2	0.05960
		25.2	0.01405
		26.2	0.00045
25	VGL0910	12	0.00045
		13	0.04868
		14	0.01718
		15	0.01897
		15.1	0.01584
		16	0.00027
		16.1	0.00483
		17.1	0.10755
		18.1	0.27228
		19	0.00009
		19.1	0.13019
		20.1	0.04205
		21.1	0.27586
		22	0.00734
		22.1	0.02282
		23	0.03060
		23.1	0.00376
		24	0.00125
26	VGL1063	8	0.02810
		9	0.00224
		10	0.00009
		11	0.00161
		12	0.03454
		13	0.16303
		14	0.13842
		15	0.08697
		16	0.09780
		17	0.03203
		18	0.04402
		19	0.29760
		20	0.04080
		21	0.02452
		22	0.00662
		23	0.00152
		24	0.00009
27	VGL1165	13	0.00009
		14	0.00018
		15	0.00653
		16	0.04196
		17	0.00403
		18	0.01816
		19	0.00913
		20	0.00081
		21	0.07910
		22	0.00304
		23	0.00286
		24	0.01593
		25	0.11408
		25.3	0.00009
		26	0.47691
		27	0.10845
		28	0.11086
		29	0.00224
		30	0.00421
		31	0.00098
		32	0.00027
		34	0.00009
28	VGL1828	14	0.03713
		15	0.00054
		16	0.04715
		17	0.02309
		18	0.08751
		19	0.42555
		20	0.33867
		21	0.03346
		22	0.00680
		23	0.00009
29	VGL2009	9	0.45347
		10	0.00608
		11	0.03481
		12	0.04671
		13	0.24392
		14	0.18683
		15	0.02801
		16	0.00018
30	VGL2409	13	0.03947
		14	0.26378
		15	0.18564
		16	0.15414
		17	0.19808
		18	0.13471
		19	0.02372
		20	0.00045
31	VGL2918	7	0.00009
		12	0.00510
		13	0.11426
		14	0.20535
		15	0.15739
		16	0.04331
		16.3	0.00143
		17	0.00224
		17.3	0.03203
		18.3	0.02174
		19.3	0.11838
		20.3	0.11829
		21.3	0.14227
		22.3	0.03499
		23.3	0.00313
32	VGL3008	12	0.00009
		13	0.01172
		14	0.03400
		15	0.23515
		16	0.03785
		17	0.50081
		18	0.02523
		18.2	0.00018
		19	0.12849
		20	0.02407
		21	0.00233
		23	0.00009
33	VGL3235	12	0.15524
		13	0.04939
		14	0.15838
		15	0.04671
		16	0.29948
		17	0.22003
		18	0.06970
		19	0.00107

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5588	10.121	3.735	0.680	0.700	0.030
	SE		0.641	0.230	0.017	0.017	0.003

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5588	8.714	2.993	0.583	0.604	0.034
	SE		1.173	0.467	0.058	0.059	0.007

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	5588	13	5.291	0.795	0.811	0.020
2	AHT137	5588	12	4.283	0.756	0.767	0.014
3	AHTH130	5588	11	4.231	0.735	0.764	0.037
4	AHTh171-A	5588	11	4.266	0.756	0.766	0.013
5	AHTh260	5588	10	2.659	0.605	0.624	0.030
6	AHTk211	5588	6	2.003	0.473	0.501	0.055
7	AHTk253	5588	7	3.908	0.737	0.744	0.009
8	C22.279	5588	8	3.289	0.704	0.696	-0.011
9	FH2001	5588	8	3.443	0.690	0.710	0.028
10	FH2054	5588	9	2.503	0.600	0.601	0.001
11	FH2848	5588	9	1.990	0.472	0.498	0.050
12	INRA21	5588	9	3.251	0.666	0.692	0.037
13	INU005	5588	9	2.146	0.511	0.534	0.044
14	INU030	5588	8	3.588	0.690	0.721	0.044
15	INU055	5588	8	3.618	0.712	0.724	0.016
16	LEI004	5588	6	2.079	0.515	0.519	0.007
17	REN105L03	5588	8	2.886	0.621	0.653	0.050
18	REN162C04	5588	8	2.908	0.621	0.656	0.054
19	REN169D01	5588	10	3.652	0.685	0.726	0.057
20	REN169O18	5588	8	2.368	0.554	0.578	0.041
21	REN247M23	5588	6	2.677	0.596	0.626	0.048
22	REN54P11	5588	9	3.915	0.701	0.745	0.059
23	REN64E19	5588	7	3.212	0.669	0.689	0.028
24	VGL0760	5588	16	6.196	0.827	0.839	0.013
25	VGL0910	5588	18	5.395	0.808	0.815	0.008
26	VGL1063	5588	17	6.301	0.819	0.841	0.027
27	VGL1165	5588	22	3.659	0.690	0.727	0.050
28	VGL1828	5588	10	3.239	0.670	0.691	0.031
29	VGL2009	5588	8	3.287	0.660	0.696	0.052
30	VGL2409	5588	8	5.339	0.805	0.813	0.010
31	VGL2918	5588	15	7.525	0.859	0.867	0.010
32	VGL3008	5588	12	3.062	0.663	0.673	0.016
33	VGL3235	5588	8	5.082	0.775	0.803	0.035

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	5588	15	3.452	0.687	0.710	0.033
2	DLA I-4ACA	5588	11	4.814	0.775	0.792	0.021
3	DLA I-4BCT	5588	6	2.565	0.588	0.610	0.037
4	DLA1131	5588	9	4.644	0.760	0.785	0.032
5	5ACA	5588	6	1.550	0.350	0.355	0.015
6	5ACT	5588	8	1.823	0.439	0.451	0.027
7	5BCA	5588	6	2.101	0.486	0.524	0.073

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media