Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Nov 21, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=5602)
1001	380 373 281 182	0.26598
1002	380 365 281 181	0.16092
1003	387 375 277 186	0.17422
1004	393 379 277 183	0.08390
1005	389 371 277 181	0.06935
1006	387 375 293 180	0.04927
1007	380 372 281 182	0.03347
1008	386 373 289 182	0.01241
1009	382 377 277 184	0.01499
1010	384 371 277 186	0.01134
1011	376 365 281 180	0.01919
1012	388 369 289 188	0.01464
1013	392 373 289 186	0.00848
1014	375 373 287 178	0.01089
1015	380 373 291 186	0.00125
1016	382 371 277 178	0.02080
1017	386 373 289 178	0.00241
1018	375 373 287 186	0.00991
1019	380 373 287 185	0.00295
1020	388 369 289 184	0.00286
1021	380 373 289 186	0.00170
1022	380 375 281 181	0.00009
1023	380 379 281 181	0.00009
1024	387 373 281 182	0.00009
1025	380 365 281 186	0.00018
1026	390 369 289 186	0.00330
1027	391 371 277 181	0.00045
1028	376 369 291 186	0.00107
1029	380 365 281 182	0.00161
1030	380 373 293 178	0.00214
1031	382 371 277 186	0.00125
1032	382 377 277 178	0.00009
1033	382 379 277 181	0.00339
1034	382 379 277 182	0.00054
1035	386 373 277 184	0.00009
1036	389 365 289 180	0.00161
1040	380 371 277 186	0.00054
1043	393 381 277 183	0.00143
1045	376 371 277 186	0.00062
1046	376 379 291 180	0.00036
1052	380 372 289 184	0.00036
1053	382 377 277 186	0.00018
1054	382 379 277 184	0.00018
1065	380 371 277 181	0.00018
1069	380 365 281 184	0.00009
1084	376 373 277 184	0.00027
1092	376 379 277 181	0.00018
1093	386 379 277 180	0.00045
1102	389 375 293 180	0.00009
1103	389 375 293 181	0.00018
1105	382 379 277 178	0.00375
1106	395 379 277 178	0.00009
1107	376 375 293 183	0.00018
1109	381 379 291 186	0.00152
1111	387 378 287 182	0.00009
1130	380 373 287 178	0.00009
1134	384 365 291 178	0.00018
1141	380 365 281 180	0.00018
1168	382 379 289 186	0.00018
1169	380 365 277 180	0.00098
1225	387 374 287 186	0.00009
1234	380 371 281 181	0.00018
1265	387 375 277 184	0.00009
1270	376 365 281 181	0.00009
1271	387 375 277 181	0.00018
1279	393 379 277 186	0.00009
null		0.00009

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=5602)
2001	343 324 284	0.60014
2002	343 327 280	0.08524
2003	343 324 282	0.10612
2004	351 327 268	0.03035
2005	339 322 280	0.01508
2006	339 325 280	0.03347
2007	351 327 280	0.01723
2008	339 327 276	0.01508
2009	351 324 280	0.00705
2010	345 329 280	0.01134
2011	345 322 284	0.01928
2012	345 322 280	0.00732
2013	345 327 284	0.01035
2014	339 322 284	0.01901
2015	339 327 280	0.00402
2016	339 323 284	0.00312
2017	343 322 280	0.00205
2019	345 324 284	0.00009
2020	349 324 284	0.00018
2021	339 324 268	0.00384
2022	339 327 282	0.00045
2023	341 323 282	0.00214
2024	343 323 280	0.00062
2025	351 321 280	0.00161
2026	351 324 284	0.00098
2028	345 327 288	0.00054
2032	339 323 280	0.00045
2035	341 323 280	0.00009
2037	341 327 280	0.00045
2039	345 327 276	0.00054
2040	345 327 280	0.00009
2048	339 331 282	0.00018
2050	341 327 284	0.00018
2053	343 324 280	0.00009
2064	351 327 284	0.00089
2066	339 324 280	0.00009
2101	341 324 280	0.00018
2115	343 327 284	0.00009

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=5604)
1	AHT121	92	0.01267
		94	0.02240
		96	0.01240
		98	0.31635
		100	0.08549
		102	0.00634
		104	0.19748
		106	0.08335
		108	0.17268
		110	0.06684
		112	0.02311
		114	0.00080
		116	0.00009
2	AHT137	131	0.23095
		133	0.01035
		135	0.00045
		137	0.17553
		139	0.00045
		141	0.36650
		143	0.01321
		145	0.04649
		147	0.05836
		149	0.00259
		151	0.09486
		153	0.00027
3	AHTH130	111	0.01699
		117	0.00235
		119	0.38024
		121	0.14163
		123	0.07809
		125	0.00117
		127	0.13304
		129	0.21683
		131	0.01509
		133	0.01247
		135	0.00208
4	AHTh171-A	217	0.00607
		219	0.37016
		221	0.23086
		223	0.00616
		225	0.14189
		227	0.00901
		229	0.04926
		231	0.02186
		233	0.00152
		235	0.14367
		237	0.01954
5	AHTh260	238	0.57399
		240	0.03124
		242	0.00027
		244	0.05837
		246	0.18708
		248	0.06435
		250	0.03392
		252	0.03668
		254	0.00616
		256	0.00794
6	AHTk211	87	0.18312
		89	0.03935
		91	0.67401
		93	0.00410
		95	0.09923
		97	0.00018
7	AHTk253	280	0.00892
		284	0.12823
		286	0.11369
		288	0.40478
		290	0.21408
		292	0.12957
		296	0.00071
8	C22.279	116	0.08005
		118	0.40077
		120	0.00473
		124	0.35588
		126	0.06845
		128	0.02168
		130	0.06836
		134	0.00009
9	FH2001	124	0.01991
		132	0.42778
		136	0.07079
		140	0.01821
		144	0.24058
		148	0.20916
		152	0.01241
		158	0.00116
10	FH2054	148	0.01062
		152	0.03133
		156	0.55168
		160	0.01758
		164	0.00348
		168	0.29605
		172	0.07747
		176	0.01080
		180	0.00098
11	FH2848	230	0.01527
		232	0.01553
		234	0.01268
		236	0.05320
		238	0.13730
		240	0.68872
		242	0.07677
		244	0.00018
		246	0.00036
12	INRA21	91	0.35427
		93	0.00009
		95	0.40398
		97	0.04765
		99	0.05533
		101	0.11431
		103	0.00750
		105	0.01392
		109	0.00294
13	INU005	110	0.01981
		120	0.00009
		122	0.00054
		124	0.51419
		126	0.44833
		128	0.00178
		130	0.01178
		132	0.00116
		138	0.00232
14	INU030	144	0.32313
		146	0.14947
		148	0.06514
		150	0.08692
		152	0.37417
		154	0.00080
		156	0.00027
		158	0.00009
15	INU055	208	0.00161
		210	0.21899
		212	0.05952
		214	0.29413
		216	0.36962
		218	0.03953
		220	0.01535
		222	0.00125
16	LEI004	85	0.65313
		95	0.10146
		97	0.00491
		105	0.00071
		107	0.20748
		109	0.03230
17	REN105L03	227	0.01026
		231	0.27914
		233	0.19713
		235	0.00741
		237	0.01490
		239	0.01178
		241	0.47912
		243	0.00027
18	REN162C04	200	0.02053
		202	0.17083
		204	0.06819
		206	0.54382
		208	0.08961
		210	0.06408
		212	0.04284
		214	0.00009
19	REN169D01	202	0.00984
		210	0.00125
		212	0.07064
		214	0.00089
		216	0.41094
		218	0.25706
		220	0.00197
		222	0.05070
		224	0.17480
		226	0.02191
20	REN169O18	156	0.00125
		160	0.03400
		162	0.56577
		164	0.31483
		166	0.01758
		168	0.02427
		170	0.03293
		172	0.00937
21	REN247M23	266	0.03391
		268	0.52793
		270	0.23291
		272	0.19811
		274	0.00250
		278	0.00464
22	REN54P11	222	0.00321
		226	0.26700
		228	0.16687
		230	0.00393
		232	0.33527
		234	0.20882
		236	0.00410
		238	0.00999
		242	0.00080
23	REN64E19	139	0.00241
		143	0.00509
		145	0.42718
		147	0.24630
		149	0.03534
		153	0.25736
		155	0.02633
24	VGL0760	12	0.29668
		13	0.00125
		14	0.01383
		15	0.00848
		18	0.00152
		19	0.08524
		19.2	0.14066
		20	0.03659
		20.2	0.16101
		21	0.00134
		21.2	0.05391
		22.2	0.01687
		23.2	0.10844
		24.2	0.05962
		25.2	0.01410
		26.2	0.00045
25	VGL0910	12	0.00045
		13	0.04872
		14	0.01713
		15	0.01892
		15.1	0.01597
		16	0.00027
		16.1	0.00482
		17.1	0.10735
		18.1	0.27226
		19	0.00009
		19.1	0.13002
		20.1	0.04194
		21.1	0.27601
		22	0.00732
		22.1	0.02311
		23	0.03061
		23.1	0.00375
		24	0.00125
26	VGL1063	8	0.02802
		9	0.00223
		10	0.00009
		11	0.00161
		12	0.03445
		13	0.16277
		14	0.13868
		15	0.08710
		16	0.09789
		17	0.03204
		18	0.04399
		19	0.29734
		20	0.04069
		21	0.02490
		22	0.00660
		23	0.00152
		24	0.00009
27	VGL1165	13	0.00009
		14	0.00018
		15	0.00651
		16	0.04185
		17	0.00402
		18	0.01856
		19	0.00910
		20	0.00080
		21	0.07898
		22	0.00303
		23	0.00286
		24	0.01588
		25	0.11378
		25.3	0.00009
		26	0.47769
		27	0.10816
		28	0.11066
		29	0.00223
		30	0.00419
		31	0.00098
		32	0.00027
		34	0.00009
28	VGL1828	14	0.03721
		15	0.00054
		16	0.04703
		17	0.02302
		18	0.08736
		19	0.42558
		20	0.33875
		21	0.03337
		22	0.00705
		23	0.00009
29	VGL2009	9	0.45324
		10	0.00616
		11	0.03480
		12	0.04676
		13	0.24353
		14	0.18704
		15	0.02829
		16	0.00018
30	VGL2409	13	0.03937
		14	0.26317
		15	0.18550
		16	0.15426
		17	0.19898
		18	0.13462
		19	0.02366
		20	0.00045
31	VGL2918	7	0.00009
		12	0.00509
		13	0.11431
		14	0.20534
		15	0.15759
		16	0.04319
		16.3	0.00143
		17	0.00223
		17.3	0.03195
		18.3	0.02177
		19.3	0.11842
		20.3	0.11806
		21.3	0.14233
		22.3	0.03498
		23.3	0.00321
32	VGL3008	12	0.00009
		13	0.01169
		14	0.03391
		15	0.23487
		16	0.03810
		17	0.50116
		18	0.02534
		18.2	0.00018
		19	0.12823
		20	0.02400
		21	0.00232
		23	0.00009
33	VGL3235	12	0.15501
		13	0.04935
		14	0.15840
		15	0.04658
		16	0.29957
		17	0.22051
		18	0.06952
		19	0.00107

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5604	10.121	3.735	0.680	0.700	0.030
	SE		0.641	0.230	0.017	0.017	0.003

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5604	8.714	2.991	0.583	0.604	0.034
	SE		1.173	0.467	0.058	0.059	0.007

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	5604	13	5.291	0.795	0.811	0.020
2	AHT137	5604	12	4.286	0.756	0.767	0.014
3	AHTH130	5604	11	4.235	0.736	0.764	0.037
4	AHTh171-A	5604	11	4.264	0.755	0.765	0.013
5	AHTh260	5604	10	2.663	0.606	0.624	0.030
6	AHTk211	5604	6	2.003	0.473	0.501	0.055
7	AHTk253	5604	7	3.907	0.738	0.744	0.009
8	C22.279	5604	8	3.295	0.704	0.696	-0.010
9	FH2001	5604	8	3.442	0.690	0.709	0.028
10	FH2054	5604	9	2.503	0.600	0.600	0.001
11	FH2848	5604	9	1.990	0.473	0.497	0.050
12	INRA21	5604	9	3.253	0.667	0.693	0.038
13	INU005	5604	9	2.146	0.511	0.534	0.043
14	INU030	5604	8	3.590	0.690	0.721	0.044
15	INU055	5604	8	3.617	0.712	0.724	0.016
16	LEI004	5604	6	2.079	0.515	0.519	0.008
17	REN105L03	5604	8	2.883	0.620	0.653	0.050
18	REN162C04	5604	8	2.907	0.621	0.656	0.053
19	REN169D01	5604	10	3.654	0.685	0.726	0.057
20	REN169O18	5604	8	2.367	0.554	0.578	0.041
21	REN247M23	5604	6	2.678	0.597	0.627	0.048
22	REN54P11	5604	9	3.917	0.701	0.745	0.059
23	REN64E19	5604	7	3.212	0.669	0.689	0.028
24	VGL0760	5604	16	6.199	0.827	0.839	0.013
25	VGL0910	5604	18	5.395	0.808	0.815	0.008
26	VGL1063	5604	17	6.306	0.819	0.841	0.026
27	VGL1165	5604	22	3.652	0.689	0.726	0.051
28	VGL1828	5604	10	3.238	0.669	0.691	0.031
29	VGL2009	5604	8	3.290	0.660	0.696	0.052
30	VGL2409	5604	8	5.339	0.804	0.813	0.010
31	VGL2918	5604	15	7.524	0.859	0.867	0.009
32	VGL3008	5604	12	3.061	0.662	0.673	0.017
33	VGL3235	5604	8	5.078	0.775	0.803	0.034

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	5604	15	3.448	0.686	0.710	0.033
2	DLA I-4ACA	5604	11	4.809	0.775	0.792	0.022
3	DLA I-4BCT	5604	6	2.565	0.588	0.610	0.037
4	DLA1131	5604	9	4.642	0.760	0.785	0.032
5	5ACA	5604	6	1.548	0.349	0.354	0.015
6	5ACT	5604	8	1.821	0.439	0.451	0.027
7	5BCA	5604	6	2.100	0.485	0.524	0.074

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media