Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Lakeland Terrier

Updated Jun 29, 2022

DLA Class I Haplotype Frequencies

#	Locus Name	Allele	Lakeland Terrier (n=126)
1	AHT121	94	0.266
		96	0.004
		100	0.615
		104	0.115
2	AHT137	131	0.171
		137	0.389
		141	0.044
		149	0.107
		151	0.290
3	AHTH130	121	0.214
		127	0.286
		133	0.496
		137	0.004
4	AHTh171-A	219	0.052
		225	0.131
		231	0.083
		235	0.734
5	AHTh260	238	0.274
		240	0.123
		244	0.155
		246	0.032
		248	0.016
		250	0.401
6	AHTk211	87	0.270
		89	0.052
		91	0.329
		95	0.349
7	AHTk253	286	0.659
		288	0.317
		292	0.024
8	C22.279	116	0.099
		118	0.456
		120	0.036
		124	0.071
		128	0.337
9	FH2001	124	0.004
		132	0.687
		144	0.123
		148	0.179
		152	0.008
10	FH2054	156	0.500
		160	0.278
		164	0.052
		176	0.167
		180	0.004
11	FH2848	230	0.004
		232	0.071
		234	0.067
		238	0.004
		240	0.123
		244	0.730
12	INRA21	95	0.171
		97	0.575
		99	0.008
		101	0.246
13	INU005	106	0.361
		124	0.512
		126	0.127
14	INU030	144	0.560
		148	0.234
		150	0.079
		152	0.103
		156	0.024
15	INU055	208	0.468
		210	0.171
		218	0.361
16	LEI004	85	0.079
		95	0.853
		97	0.067
17	REN105L03	229	0.671
		231	0.111
		233	0.218
18	REN162C04	202	0.341
		206	0.655
		210	0.004
19	REN169D01	202	0.115
		210	0.071
		216	0.813
20	REN169O18	164	0.333
		168	0.206
		170	0.460
21	REN247M23	266	0.056
		268	0.925
		270	0.008
		272	0.012
22	REN54P11	222	0.369
		232	0.016
		236	0.583
		238	0.032
23	REN64E19	139	0.286
		145	0.448
		147	0.266
24	VGL0760	12	0.437
		20.2	0.107
		21.2	0.008
		22.2	0.139
		23.2	0.298
		24.2	0.012
25	VGL0910	15	0.139
		15.1	0.004
		17.1	0.032
		18.1	0.008
		19.1	0.722
		20.1	0.095
26	VGL1063	12	0.071
		13	0.008
		14	0.036
		15	0.460
		16	0.147
		17	0.008
		20	0.214
		21	0.056
27	VGL1165	16	0.016
		21	0.040
		25	0.083
		26	0.103
		27	0.095
		28	0.492
		29	0.135
		30	0.036
28	VGL1828	16	0.214
		17	0.040
		19	0.341
		22	0.004
		23	0.401
29	VGL2009	10	0.425
		11	0.159
		13	0.028
		14	0.357
		15	0.032
30	VGL2409	11	0.373
		13	0.020
		15	0.004
		17	0.341
		18	0.258
		19	0.004
31	VGL2918	12	0.310
		13	0.365
		14	0.147
		15	0.063
		17.3	0.052
		19.3	0.063
32	VGL3008	15	0.083
		17	0.016
		18	0.472
		19	0.417
		20	0.012
33	VGL3235	14	0.349
		15	0.567
		18	0.079
		19	0.004

Lakeland Terrier

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	126	4.576	2.533	0.570	0.569	-0.003
	SE		0.239	0.122	0.025	0.024	0.011

Lakeland Terrier

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	126	3.571	1.490	0.324	0.320	-0.016
	SE		0.489	0.060	0.033	0.033	0.010

Lakeland Terrier

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	126	4	2.163	0.500	0.538	0.070
2	AHT137	126	5	3.602	0.714	0.722	0.011
3	AHTH130	126	4	2.677	0.571	0.626	0.088
4	AHTh171-A	126	4	1.768	0.460	0.434	-0.060
5	AHTh260	126	6	3.624	0.738	0.724	-0.019
6	AHTk211	126	4	3.269	0.746	0.694	-0.075
7	AHTk253	126	3	1.868	0.437	0.465	0.061
8	C22.279	126	5	2.956	0.635	0.662	0.041
9	FH2001	126	5	1.929	0.492	0.482	-0.022
10	FH2054	126	5	2.796	0.667	0.642	-0.038
11	FH2848	126	6	1.792	0.484	0.442	-0.095
12	INRA21	126	4	2.376	0.548	0.579	0.055
13	INU005	126	3	2.448	0.627	0.591	-0.060
14	INU030	126	5	2.595	0.548	0.615	0.109
15	INU055	126	3	2.640	0.675	0.621	-0.086
16	LEI004	126	3	1.354	0.278	0.261	-0.063
17	REN105L03	126	3	1.962	0.437	0.490	0.110
18	REN162C04	126	3	1.834	0.468	0.455	-0.030
19	REN169D01	126	3	1.470	0.310	0.320	0.032
20	REN169O18	126	3	2.735	0.643	0.634	-0.013
21	REN247M23	126	4	1.165	0.151	0.142	-0.063
22	REN54P11	126	4	2.093	0.500	0.522	0.043
23	REN64E19	126	3	2.830	0.730	0.647	-0.129
24	VGL0760	126	6	3.225	0.683	0.690	0.011
25	VGL0910	126	6	1.815	0.476	0.449	-0.061
26	VGL1063	126	8	3.461	0.722	0.711	-0.016
27	VGL1165	126	8	3.447	0.706	0.710	0.005
28	VGL1828	126	5	3.081	0.635	0.675	0.060
29	VGL2009	126	5	2.987	0.667	0.665	-0.002
30	VGL2409	126	6	3.100	0.722	0.677	-0.066
31	VGL2918	126	6	3.826	0.706	0.739	0.044
32	VGL3008	126	5	2.476	0.595	0.596	0.001
33	VGL3235	126	4	2.221	0.524	0.550	0.047

Lakeland Terrier

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	126	5	1.603	0.389	0.376	-0.034
2	DLA I-4ACA	126	5	1.606	0.381	0.377	-0.009
3	DLA I-4BCT	126	2	1.446	0.302	0.308	0.022
4	DLA1131	126	5	1.585	0.381	0.369	-0.032
5	5ACA	126	2	1.446	0.302	0.308	0.022
6	5ACT	126	3	1.609	0.389	0.378	-0.028
7	5BCA	126	3	1.137	0.127	0.121	-0.052