Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Lakeland Terrier

Updated Aug 18, 2022

DLA Class I Haplotype Frequencies

#	Locus Name	Allele	Lakeland Terrier (n=129)
1	AHT121	94	0.260
		96	0.004
		100	0.624
		104	0.112
2	AHT137	131	0.167
		137	0.388
		141	0.043
		149	0.105
		151	0.298
3	AHTH130	121	0.221
		127	0.287
		133	0.488
		137	0.004
4	AHTh171-A	219	0.050
		225	0.128
		231	0.081
		235	0.740
5	AHTh260	238	0.275
		240	0.128
		244	0.151
		246	0.031
		248	0.016
		250	0.399
6	AHTk211	87	0.271
		89	0.050
		91	0.326
		95	0.353
7	AHTk253	286	0.651
		288	0.326
		292	0.023
8	C22.279	116	0.105
		118	0.461
		120	0.035
		124	0.070
		128	0.329
9	FH2001	124	0.004
		132	0.686
		144	0.128
		148	0.174
		152	0.008
10	FH2054	156	0.500
		160	0.275
		164	0.050
		176	0.171
		180	0.004
11	FH2848	230	0.004
		232	0.070
		234	0.066
		238	0.004
		240	0.120
		244	0.736
12	INRA21	95	0.167
		97	0.578
		99	0.008
		101	0.248
13	INU005	106	0.364
		124	0.512
		126	0.124
14	INU030	144	0.558
		148	0.229
		150	0.078
		152	0.112
		156	0.023
15	INU055	208	0.477
		210	0.171
		218	0.353
16	LEI004	85	0.078
		95	0.853
		97	0.070
17	REN105L03	229	0.674
		231	0.109
		233	0.217
18	REN162C04	202	0.333
		206	0.663
		210	0.004
19	REN169D01	202	0.112
		210	0.070
		216	0.818
20	REN169O18	164	0.345
		168	0.205
		170	0.450
21	REN247M23	266	0.058
		268	0.922
		270	0.008
		272	0.012
22	REN54P11	222	0.368
		232	0.016
		236	0.585
		238	0.031
23	REN64E19	139	0.283
		145	0.446
		147	0.271
24	VGL0760	12	0.442
		20.2	0.105
		21.2	0.008
		22.2	0.140
		23.2	0.295
		24.2	0.012
25	VGL0910	15	0.143
		15.1	0.004
		17.1	0.035
		18.1	0.012
		19.1	0.713
		20.1	0.093
26	VGL1063	12	0.070
		13	0.008
		14	0.035
		15	0.461
		16	0.155
		17	0.008
		20	0.209
		21	0.054
27	VGL1165	16	0.016
		21	0.039
		25	0.081
		26	0.109
		27	0.097
		28	0.488
		29	0.136
		30	0.035
28	VGL1828	16	0.209
		17	0.039
		19	0.349
		22	0.004
		23	0.399
29	VGL2009	10	0.426
		11	0.163
		13	0.027
		14	0.353
		15	0.031
30	VGL2409	11	0.368
		13	0.019
		15	0.004
		17	0.353
		18	0.252
		19	0.004
31	VGL2918	12	0.306
		13	0.364
		14	0.155
		15	0.062
		17.3	0.050
		19.3	0.062
32	VGL3008	15	0.081
		17	0.016
		18	0.469
		19	0.419
		20	0.016
33	VGL3235	14	0.341
		15	0.578
		18	0.078
		19	0.004

Lakeland Terrier

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	129	4.576	2.530	0.568	0.568	-0.001
	SE		0.239	0.122	0.025	0.024	0.010

Lakeland Terrier

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	129	3.571	1.496	0.330	0.322	-0.026
	SE		0.489	0.061	0.035	0.033	0.009

Lakeland Terrier

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	129	4	2.130	0.488	0.530	0.079
2	AHT137	129	5	3.573	0.713	0.720	0.010
3	AHTH130	129	4	2.706	0.581	0.630	0.078
4	AHTh171-A	129	4	1.743	0.450	0.426	-0.054
5	AHTh260	129	6	3.629	0.736	0.724	-0.017
6	AHTk211	129	4	3.262	0.744	0.693	-0.073
7	AHTk253	129	3	1.885	0.442	0.469	0.059
8	C22.279	129	5	2.956	0.620	0.662	0.063
9	FH2001	129	5	1.932	0.496	0.482	-0.028
10	FH2054	129	5	2.798	0.674	0.643	-0.049
11	FH2848	129	6	1.767	0.473	0.434	-0.090
12	INRA21	129	4	2.365	0.550	0.577	0.046
13	INU005	129	3	2.440	0.620	0.590	-0.051
14	INU030	129	5	2.611	0.558	0.617	0.095
15	INU055	129	3	2.626	0.667	0.619	-0.077
16	LEI004	129	3	1.355	0.279	0.262	-0.065
17	REN105L03	129	3	1.947	0.434	0.486	0.107
18	REN162C04	129	3	1.817	0.457	0.450	-0.017
19	REN169D01	129	3	1.457	0.302	0.314	0.036
20	REN169O18	129	3	2.752	0.636	0.637	0.002
21	REN247M23	129	4	1.170	0.155	0.145	-0.066
22	REN54P11	129	4	2.086	0.488	0.521	0.062
23	REN64E19	129	3	2.838	0.729	0.648	-0.125
24	VGL0760	129	6	3.199	0.674	0.687	0.019
25	VGL0910	129	6	1.855	0.488	0.461	-0.060
26	VGL1063	129	8	3.451	0.729	0.710	-0.026
27	VGL1165	129	8	3.476	0.713	0.712	-0.001
28	VGL1828	129	5	3.064	0.636	0.674	0.056
29	VGL2009	129	5	2.991	0.667	0.666	-0.002
30	VGL2409	129	6	3.088	0.713	0.676	-0.055
31	VGL2918	129	6	3.835	0.705	0.739	0.046
32	VGL3008	129	5	2.486	0.597	0.598	0.001
33	VGL3235	129	4	2.194	0.512	0.544	0.060

Lakeland Terrier

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	129	5	1.609	0.395	0.378	-0.045
2	DLA I-4ACA	129	5	1.612	0.388	0.380	-0.021
3	DLA I-4BCT	129	2	1.455	0.310	0.312	0.008
4	DLA1131	129	5	1.591	0.388	0.371	-0.044
5	5ACA	129	2	1.455	0.310	0.312	0.008
6	5ACT	129	3	1.615	0.395	0.381	-0.038
7	5BCA	129	3	1.134	0.124	0.118	-0.051