Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Polish Lowland Sheepdog

Updated Feb 22, 2025

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Polish Lowland Sheepdog (n=122)	Polski Owczarek Nizinny (n=1)
1016	382 371 277 178	0.020	--
1040	380 371 277 186	0.664	0.5
1067	376 373 277 178	0.307	0.5
1068	380 373 287 181	0.004	--
1156	380 373 291 178	0.004	--

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Polish Lowland Sheepdog (n=122)	Polski Owczarek Nizinny (n=1)
2005	339 322 280	0.004	--
2014	339 322 284	0.680	0.5
2017	343 322 280	0.291	0.5
2053	343 324 280	0.004	--
2067	343 322 284	0.016	--
2098	343 323 282	0.004	--

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Polish Lowland Sheepdog (n=122)	Polski Owczarek Nizinny (n=1)
1	AHT121	100	0.475	0.5
		102	0.434	--
		104	0.016	--
		106	0.074	0.5
2	AHT137	131	0.291	0.5
		135	0.004	--
		145	0.701	0.5
		149	0.004	--
3	AHTH130	121	0.049	--
		123	0.029	--
		127	0.439	0.5
		131	0.471	0.5
		133	0.012	--
4	AHTh171-A	219	0.102	--
		225	0.008	--
		233	0.061	--
		237	0.807	1.0
		239	0.008	--
		243	0.012	--
5	AHTh260	240	0.131	--
		244	0.029	--
		246	0.701	1.0
		250	0.139	--
6	AHTk211	87	0.250	--
		91	0.701	1.0
		95	0.049	--
7	AHTk253	284	0.094	--
		288	0.004	--
		290	0.508	1.0
		292	0.393	--
8	C22.279	116	0.217	--
		118	0.250	--
		124	0.533	1.0
9	FH2001	132	0.975	0.5
9	FH2001	144	0.025	0.5
10	FH2054	152	0.016	0.5
		156	0.189	--
		160	0.053	--
		164	0.016	--
		168	0.684	0.5
		172	0.033	--
		176	0.008	--
11	FH2848	232	0.307	0.5
		234	0.004	--
		236	0.480	--
		240	0.033	--
		242	0.176	0.5
12	INRA21	95	0.082	--
12	INRA21	101	0.918	1.0
13	INU005	124	0.672	0.5
		126	0.008	--
		128	0.299	0.5
		132	0.020	--
14	INU030	144	0.590	--
		150	0.254	1.0
		152	0.156	--
15	INU055	204	0.270	--
		210	0.463	0.5
		218	0.266	0.5
16	LEI004	95	0.877	1.0
16	LEI004	97	0.123	--
17	REN105L03	227	0.049	--
		231	0.508	0.5
		233	0.439	0.5
		241	0.004	--
18	REN162C04	204	0.189	--
		206	0.705	1.0
		210	0.107	--
19	REN169D01	210	0.045	--
		212	0.213	--
		216	0.676	--
		220	0.066	1.0
20	REN169O18	164	0.414	0.5
		166	0.008	--
		168	0.004	--
		170	0.574	0.5
21	REN247M23	264	0.004	--
		266	0.053	1.0
		268	0.857	--
		272	0.086	--
22	REN54P11	228	0.328	1.0
		232	0.258	--
		236	0.193	--
		238	0.213	--
		240	0.008	--
23	REN64E19	147	0.180	--
		149	0.119	--
		153	0.701	1.0
24	VGL0760	14	0.041	--
		15	0.615	--
		16	0.008	--
		20.2	0.205	--
		21.2	0.131	1.0
25	VGL0910	13	0.049	--
		14	0.303	0.5
		15	0.082	--
		16	0.135	0.5
		19.1	0.090	--
		20.1	0.172	--
		21.1	0.160	--
		22.1	0.008	--
26	VGL1063	14	0.078	0.5
		15	0.209	--
		16	0.365	--
		17	0.115	--
		18	0.209	--
		19	0.025	0.5
27	VGL1165	16	0.004	--
		17	0.275	0.5
		18	0.004	--
		25	0.004	--
		26	0.418	--
		27	0.041	--
		28	0.045	--
		29	0.004	--
		30	0.189	0.5
		31	0.016	--
28	VGL1828	19	0.238	0.5
		20	0.307	--
		21	0.176	--
		22	0.053	--
		23	0.217	0.5
		24	0.008	--
29	VGL2009	10	0.176	--
		11	0.164	0.5
		13	0.008	--
		14	0.533	0.5
		15	0.094	--
		16	0.025	--
30	VGL2409	15	0.045	--
		16	0.012	--
		17	0.619	1.0
		18	0.152	--
		19	0.172	--
31	VGL2918	12	0.738	1.0
		13	0.008	--
		15	0.025	--
		17.3	0.230	--
32	VGL3008	14	0.004	--
		15	0.365	0.5
		16	0.057	--
		17	0.250	--
		18	0.148	0.5
		19	0.176	--
33	VGL3235	13	0.086	--
		14	0.648	1.0
		16	0.266	--

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Polish Lowland Sheepdog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	123	4.455	2.407	0.527	0.521	-0.009
	SE		0.300	0.172	0.032	0.030	0.012

Polski Owczarek Nizinny

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1	1.485	1.485	0.485	0.242	-0.485
	SE		0.087	0.087	0.087	0.043	0.087

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Polish Lowland Sheepdog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	123	2.714	1.565	0.300	0.318	0.041
	SE		0.171	0.132	0.068	0.072	0.012

Polski Owczarek Nizinny

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1	1.714	1.714	0.714	0.357	-0.714
	SE		0.171	0.171	0.171	0.085	0.171

Standard genetic assessment for individual STR loci

Polish Lowland Sheepdog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	123	4	2.392	0.593	0.582	-0.020
2	AHT137	123	4	1.740	0.333	0.425	0.216
3	AHTH130	123	5	2.390	0.618	0.582	-0.062
4	AHTh171-A	123	6	1.495	0.276	0.331	0.166
5	AHTh260	123	4	1.882	0.455	0.469	0.028
6	AHTk211	123	3	1.791	0.480	0.442	-0.086
7	AHTk253	123	4	2.362	0.561	0.577	0.027
8	C22.279	123	3	2.526	0.618	0.604	-0.023
9	FH2001	123	2	1.059	0.057	0.055	-0.029
10	FH2054	123	7	1.976	0.496	0.494	-0.004
11	FH2848	123	5	2.819	0.626	0.645	0.030
12	INRA21	123	2	1.176	0.163	0.149	-0.088
13	INU005	123	4	1.849	0.447	0.459	0.026
14	INU030	123	3	2.303	0.561	0.566	0.009
15	INU055	123	3	2.788	0.740	0.641	-0.154
16	LEI004	123	2	1.273	0.211	0.214	0.013
17	REN105L03	123	4	2.206	0.553	0.547	-0.011
18	REN162C04	123	3	1.830	0.496	0.454	-0.093
19	REN169D01	123	4	1.992	0.504	0.498	-0.012
20	REN169O18	123	4	1.998	0.472	0.499	0.056
21	REN247M23	123	4	1.365	0.260	0.267	0.026
22	REN54P11	123	5	3.877	0.780	0.742	-0.052
23	REN64E19	123	3	1.850	0.496	0.460	-0.079
24	VGL0760	123	5	2.304	0.585	0.566	-0.034
25	VGL0910	123	8	5.453	0.837	0.817	-0.025
26	VGL1063	123	6	4.215	0.748	0.763	0.019
27	VGL1165	123	10	3.462	0.724	0.711	-0.017
28	VGL1828	123	6	4.309	0.797	0.768	-0.038
29	VGL2009	123	6	2.846	0.650	0.649	-0.003
30	VGL2409	123	5	2.269	0.610	0.559	-0.090
31	VGL2918	123	4	1.667	0.374	0.400	0.065
32	VGL3008	123	6	3.972	0.732	0.748	0.022
33	VGL3235	123	3	1.999	0.537	0.500	-0.073

Polski Owczarek Nizinny

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
2	AHT137	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
3	AHTH130	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
4	AHTh171-A	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
5	AHTh260	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
6	AHTk211	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
7	AHTk253	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
8	C22.279	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
9	FH2001	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
10	FH2054	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
11	FH2848	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
12	INRA21	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
13	INU005	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
14	INU030	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
15	INU055	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
16	LEI004	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
17	REN105L03	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
18	REN162C04	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
19	REN169D01	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
20	REN169O18	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
21	REN247M23	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
22	REN54P11	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
23	REN64E19	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
24	VGL0760	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
25	VGL0910	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
26	VGL1063	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
27	VGL1165	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
28	VGL1828	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
29	VGL2009	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
30	VGL2409	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
31	VGL2918	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
32	VGL3008	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
33	VGL3235	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Polish Lowland Sheepdog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	123	3	1.832	0.423	0.454	0.069
2	DLA I-4ACA	123	2	1.764	0.407	0.433	0.061
3	DLA I-4BCT	123	3	1.016	0.016	0.016	-0.006
4	DLA1131	123	3	1.818	0.431	0.450	0.042
5	5ACA	123	2	1.764	0.407	0.433	0.061
6	5ACT	123	3	1.016	0.016	0.016	-0.006
7	5BCA	123	3	1.743	0.398	0.426	0.066

Polski Owczarek Nizinny

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
2	DLA I-4ACA	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
3	DLA I-4BCT	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
4	DLA1131	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
5	5ACA	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
6	5ACT	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
7	5BCA	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Polish Lowland Sheepdog

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Polish Lowland Sheepdog

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media