Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Polish Lowland Sheepdog

Updated Jun 5, 2025

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Polish Lowland Sheepdog (n=127)	Polski Owczarek Nizinny (n=1)
1016	382 371 277 178	0.020	--
1040	380 371 277 186	0.650	0.5
1067	376 373 277 178	0.323	0.5
1068	380 373 287 181	0.004	--
1156	380 373 291 178	0.004	--

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Polish Lowland Sheepdog (n=127)	Polski Owczarek Nizinny (n=1)
2005	339 322 280	0.004	--
2014	339 322 284	0.665	0.5
2017	343 322 280	0.307	0.5
2053	343 324 280	0.004	--
2067	343 322 284	0.016	--
2098	343 323 282	0.004	--

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Polish Lowland Sheepdog (n=128)	Polski Owczarek Nizinny (n=1)
1	AHT121	100	0.461	0.5
		102	0.430	--
		104	0.027	--
		106	0.082	0.5
2	AHT137	131	0.305	0.5
		135	0.004	--
		145	0.688	0.5
		149	0.004	--
3	AHTH130	121	0.059	--
		123	0.031	--
		127	0.434	0.5
		131	0.465	0.5
		133	0.012	--
4	AHTh171-A	219	0.105	--
		225	0.008	--
		233	0.070	--
		237	0.797	1.0
		239	0.008	--
		243	0.012	--
5	AHTh260	240	0.125	--
		244	0.027	--
		246	0.699	1.0
		250	0.148	--
6	AHTk211	87	0.242	--
		91	0.707	1.0
		95	0.051	--
7	AHTk253	284	0.090	--
		288	0.004	--
		290	0.516	1.0
		292	0.391	--
8	C22.279	116	0.223	--
		118	0.242	--
		124	0.535	1.0
9	FH2001	132	0.977	0.5
9	FH2001	144	0.023	0.5
10	FH2054	152	0.016	0.5
		156	0.195	--
		160	0.051	--
		164	0.016	--
		168	0.684	0.5
		172	0.031	--
		176	0.008	--
11	FH2848	232	0.309	0.5
		234	0.004	--
		236	0.477	--
		240	0.031	--
		242	0.180	0.5
12	INRA21	95	0.078	--
12	INRA21	101	0.922	1.0
13	INU005	124	0.680	0.5
		126	0.008	--
		128	0.293	0.5
		132	0.020	--
14	INU030	144	0.594	--
		150	0.254	1.0
		152	0.152	--
15	INU055	204	0.258	--
		210	0.457	0.5
		218	0.285	0.5
16	LEI004	95	0.883	1.0
16	LEI004	97	0.117	--
17	REN105L03	227	0.055	--
		231	0.500	0.5
		233	0.441	0.5
		241	0.004	--
18	REN162C04	204	0.195	--
		206	0.699	1.0
		210	0.105	--
19	REN169D01	210	0.055	--
		212	0.219	--
		216	0.660	--
		220	0.066	1.0
20	REN169O18	164	0.418	0.5
		166	0.008	--
		168	0.004	--
		170	0.570	0.5
21	REN247M23	264	0.004	--
		266	0.059	1.0
		268	0.852	--
		272	0.086	--
22	REN54P11	228	0.332	1.0
		232	0.258	--
		236	0.199	--
		238	0.203	--
		240	0.008	--
23	REN64E19	147	0.184	--
		149	0.113	--
		153	0.703	1.0
24	VGL0760	14	0.039	--
		15	0.598	--
		16	0.008	--
		20.2	0.215	--
		21.2	0.141	1.0
25	VGL0910	13	0.047	--
		14	0.313	0.5
		15	0.078	--
		16	0.129	0.5
		19.1	0.086	--
		20.1	0.176	--
		21.1	0.164	--
		22.1	0.008	--
26	VGL1063	14	0.074	0.5
		15	0.219	--
		16	0.352	--
		17	0.121	--
		18	0.207	--
		19	0.027	0.5
27	VGL1165	16	0.008	--
		17	0.262	0.5
		18	0.004	--
		25	0.004	--
		26	0.422	--
		27	0.047	--
		28	0.043	--
		29	0.008	--
		30	0.188	0.5
		31	0.016	--
28	VGL1828	19	0.238	0.5
		20	0.305	--
		21	0.172	--
		22	0.051	--
		23	0.227	0.5
		24	0.008	--
29	VGL2009	10	0.168	--
		11	0.160	0.5
		13	0.008	--
		14	0.551	0.5
		15	0.090	--
		16	0.023	--
30	VGL2409	15	0.047	--
		16	0.012	--
		17	0.629	1.0
		18	0.148	--
		19	0.164	--
31	VGL2918	12	0.746	1.0
		13	0.008	--
		15	0.023	--
		17.3	0.223	--
32	VGL3008	14	0.004	--
		15	0.359	0.5
		16	0.055	--
		17	0.250	--
		18	0.156	0.5
		19	0.176	--
33	VGL3235	13	0.082	--
		14	0.652	1.0
		16	0.266	--

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Polish Lowland Sheepdog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	129	4.455	2.410	0.527	0.522	-0.007
	SE		0.300	0.171	0.033	0.031	0.012

Polski Owczarek Nizinny

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1	1.485	1.485	0.485	0.242	-0.485
	SE		0.087	0.087	0.087	0.043	0.087

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Polish Lowland Sheepdog

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	129	2.714	1.585	0.292	0.324	0.072
	SE		0.171	0.136	0.066	0.074	0.019

Polski Owczarek Nizinny

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	1	1.714	1.714	0.714	0.357	-0.714
	SE		0.171	0.171	0.171	0.085	0.171

Standard genetic assessment for individual STR loci

Polish Lowland Sheepdog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	129	4	2.484	0.605	0.597	-0.012
2	AHT137	129	4	1.772	0.341	0.436	0.217
3	AHTH130	129	5	2.443	0.628	0.591	-0.063
4	AHTh171-A	129	6	1.530	0.287	0.346	0.172
5	AHTh260	129	4	1.887	0.465	0.470	0.010
6	AHTk211	129	3	1.775	0.473	0.437	-0.083
7	AHTk253	129	4	2.337	0.566	0.572	0.011
8	C22.279	129	3	2.520	0.597	0.603	0.010
9	FH2001	129	2	1.056	0.054	0.053	-0.028
10	FH2054	129	7	1.972	0.488	0.493	0.009
11	FH2848	129	5	2.826	0.628	0.646	0.028
12	INRA21	129	2	1.167	0.155	0.143	-0.084
13	INU005	129	4	1.827	0.442	0.453	0.024
14	INU030	129	3	2.286	0.558	0.563	0.008
15	INU055	129	3	2.802	0.736	0.643	-0.145
16	LEI004	129	2	1.259	0.202	0.206	0.019
17	REN105L03	129	4	2.231	0.550	0.552	0.003
18	REN162C04	129	3	1.850	0.512	0.459	-0.114
19	REN169D01	129	4	2.064	0.512	0.515	0.007
20	REN169O18	129	4	2.000	0.496	0.500	0.008
21	REN247M23	129	4	1.378	0.256	0.274	0.068
22	REN54P11	129	5	3.862	0.791	0.741	-0.067
23	REN64E19	129	3	1.840	0.481	0.457	-0.053
24	VGL0760	129	5	2.379	0.581	0.580	-0.003
25	VGL0910	129	8	5.309	0.829	0.812	-0.022
26	VGL1063	129	6	4.303	0.752	0.768	0.020
27	VGL1165	129	10	3.507	0.736	0.715	-0.030
28	VGL1828	129	6	4.289	0.806	0.767	-0.051
29	VGL2009	129	6	2.734	0.628	0.634	0.010
30	VGL2409	129	5	2.224	0.597	0.550	-0.085
31	VGL2918	129	4	1.642	0.364	0.391	0.068
32	VGL3008	129	6	3.998	0.744	0.750	0.008
33	VGL3235	129	3	1.980	0.535	0.495	-0.081

Polski Owczarek Nizinny

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
2	AHT137	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
3	AHTH130	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
4	AHTh171-A	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
5	AHTh260	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
6	AHTk211	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
7	AHTk253	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
8	C22.279	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
9	FH2001	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
10	FH2054	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
11	FH2848	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
12	INRA21	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
13	INU005	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
14	INU030	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
15	INU055	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
16	LEI004	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
17	REN105L03	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
18	REN162C04	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
19	REN169D01	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
20	REN169O18	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
21	REN247M23	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
22	REN54P11	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
23	REN64E19	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
24	VGL0760	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
25	VGL0910	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
26	VGL1063	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
27	VGL1165	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
28	VGL1828	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
29	VGL2009	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
30	VGL2409	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
31	VGL2918	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
32	VGL3008	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
33	VGL3235	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Polish Lowland Sheepdog

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	129	3	1.859	0.411	0.462	0.111
2	DLA I-4ACA	129	2	1.792	0.395	0.442	0.105
3	DLA I-4BCT	129	3	1.016	0.016	0.015	-0.006
4	DLA1131	129	3	1.847	0.422	0.459	0.080
5	5ACA	129	2	1.792	0.395	0.442	0.105
6	5ACT	129	3	1.016	0.016	0.015	-0.006
7	5BCA	129	3	1.773	0.388	0.436	0.111

Polski Owczarek Nizinny

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
2	DLA I-4ACA	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
3	DLA I-4BCT	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
4	DLA1131	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
5	5ACA	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000
6	5ACT	1	1	1.000	0.000	0.000	0.000
7	5BCA	1	2	2.000	1.000	0.500	-1.000

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Polish Lowland Sheepdog

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Polish Lowland Sheepdog

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media